Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ W3110S.gb 2750847 2750952 106 74 [0] [0] 50 recN recombination and repair protein

TTCCTCTGTCACAACTGCGCGAACTGGGTCAGTTGCTGATTCAGATCCATGGTCAGCACGCT  >  W3110S.gb/2750785‑2750846
                                                             |
ttCCTCTGTCACAACTGCGCGAACTGGGTCAGTTGCTGATTCAGATCCATGGTCAGCACGCt  <  1:856052/62‑1 (MQ=255)
 tCCTCTGTCACAACTGCGCGAACTGGGTCAGTTGCTGATTCAGATCCATGGTCAGCACGCt  <  1:978032/61‑1 (MQ=255)
  ccTCTGTCACAACTGCGCGAACTGGGTCAGTTGCTGATTCAGATCCATGGTCAGCACGCt  <  1:771500/60‑1 (MQ=255)
  ccTCTGTCACAACTGCGCGAACTGGGTCAGTTGCTGATTCAGATCCATGGTCAGCACGCt  <  1:46121/60‑1 (MQ=255)
  ccTCTGTCACAACTGCGCGAACTGGGTCAGTTGCTGATTCAGATCCATGGTCAGCACGCt  <  1:762873/60‑1 (MQ=255)
  ccTCTGTCACAACTGCGCGAACTGGGTCAGTTGCTGATTCAGATCCATGGTCAGCACGCt  <  1:734924/60‑1 (MQ=255)
  ccTCTGTCACAACTGCGCGAACTGGGTCAGTTGCTGATTCAGATCCATGGTCAGCACGCt  <  1:726624/60‑1 (MQ=255)
  ccTCTGTCACAACTGCGCGAACTGGGTCAGTTGCTGATTCAGATCCATGGTCAGCACGCt  <  1:722534/60‑1 (MQ=255)
  ccTCTGTCACAACTGCGCGAACTGGGTCAGTTGCTGATTCAGATCCATGGTCAGCACGCt  <  1:646583/60‑1 (MQ=255)
  ccTCTGTCACAACTGCGCGAACTGGGTCAGTTGCTGATTCAGATCCATGGTCAGCACGCt  <  1:644430/60‑1 (MQ=255)
  ccTCTGTCACAACTGCGCGAACTGGGTCAGTTGCTGATTCAGATCCATGGTCAGCACGCt  <  1:639865/60‑1 (MQ=255)
  ccTCTGTCACAACTGCGCGAACTGGGTCAGTTGCTGATTCAGATCCATGGTCAGCACGCt  <  1:639326/60‑1 (MQ=255)
  ccTCTGTCACAACTGCGCGAACTGGGTCAGTTGCTGATTCAGATCCATGGTCAGCACGCt  <  1:622302/60‑1 (MQ=255)
  ccTCTGTCACAACTGCGCGAACTGGGTCAGTTGCTGATTCAGATCCATGGTCAGCACGCt  <  1:572839/60‑1 (MQ=255)
  ccTCTGTCACAACTGCGCGAACTGGGTCAGTTGCTGATTCAGATCCATGGTCAGCACGCt  <  1:524204/60‑1 (MQ=255)
  ccTCTGTCACAACTGCGCGAACTGGGTCAGTTGCTGATTCAGATCCATGGTCAGCACGCt  <  1:523926/60‑1 (MQ=255)
  ccTCTGTCACAACTGCGCGAACTGGGTCAGTTGCTGATTCAGATCCATGGTCAGCACGCt  <  1:499827/60‑1 (MQ=255)
  ccTCTGTCACAACTGCGCGAACTGGGTCAGTTGCTGATTCAGATCCATGGTCAGCACGCt  <  1:1008573/60‑1 (MQ=255)
  ccTCTGTCACAACTGCGCGAACTGGGTCAGTTGCTGATTCAGATCCATGGTCAGCACGCt  <  1:473034/60‑1 (MQ=255)
  ccTCTGTCACAACTGCGCGAACTGGGTCAGTTGCTGATTCAGATCCATGGTCAGCACGCt  <  1:891618/60‑1 (MQ=255)
  ccTCTGTCACAACTGCGCGAACTGGGTCAGTTGCTGATTCAGATCCATGGTCAGCACGCt  <  1:961248/60‑1 (MQ=255)
  ccTCTGTCACAACTGCGCGAACTGGGTCAGTTGCTGATTCAGATCCATGGTCAGCACGCt  <  1:960801/60‑1 (MQ=255)
  ccTCTGTCACAACTGCGCGAACTGGGTCAGTTGCTGATTCAGATCCATGGTCAGCACGCt  <  1:945175/60‑1 (MQ=255)
  ccTCTGTCACAACTGCGCGAACTGGGTCAGTTGCTGATTCAGATCCATGGTCAGCACGCt  <  1:944125/60‑1 (MQ=255)
  ccTCTGTCACAACTGCGCGAACTGGGTCAGTTGCTGATTCAGATCCATGGTCAGCACGCt  <  1:943541/60‑1 (MQ=255)
  ccTCTGTCACAACTGCGCGAACTGGGTCAGTTGCTGATTCAGATCCATGGTCAGCACGCt  <  1:939224/60‑1 (MQ=255)
  ccTCTGTCACAACTGCGCGAACTGGGTCAGTTGCTGATTCAGATCCATGGTCAGCACGCt  <  1:937673/60‑1 (MQ=255)
  ccTCTGTCACAACTGCGCGAACTGGGTCAGTTGCTGATTCAGATCCATGGTCAGCACGCt  <  1:914710/60‑1 (MQ=255)
  ccTCTGTCACAACTGCGCGAACTGGGTCAGTTGCTGATTCAGATCCATGGTCAGCACGCt  <  1:782808/60‑1 (MQ=255)
  ccTCTGTCACAACTGCGCGAACTGGGTCAGTTGCTGATTCAGATCCATGGTCAGCACGCt  <  1:877095/60‑1 (MQ=255)
  ccTCTGTCACAACTGCGCGAACTGGGTCAGTTGCTGATTCAGATCCATGGTCAGCACGCt  <  1:874823/60‑1 (MQ=255)
  ccTCTGTCACAACTGCGCGAACTGGGTCAGTTGCTGATTCAGATCCATGGTCAGCACGCt  <  1:854798/60‑1 (MQ=255)
  ccTCTGTCACAACTGCGCGAACTGGGTCAGTTGCTGATTCAGATCCATGGTCAGCACGCt  <  1:852483/60‑1 (MQ=255)
  ccTCTGTCACAACTGCGCGAACTGGGTCAGTTGCTGATTCAGATCCATGGTCAGCACGCt  <  1:829515/60‑1 (MQ=255)
  ccTCTGTCACAACTGCGCGAACTGGGTCAGTTGCTGATTCAGATCCATGGTCAGCACGCt  <  1:805510/60‑1 (MQ=255)
  ccTCTGTCACAACTGCGCGAACTGGGTCAGTTGCTGATTCAGATCCATGGTCAGCACGCt  <  1:788625/60‑1 (MQ=255)
  ccTCTGTCACAACTGCGCGAACTGGGTCAGTTGCTGATTCAGATCCATGGTCAGCACGCt  <  1:1232829/60‑1 (MQ=255)
  ccTCTGTCACAACTGCGCGAACTGGGTCAGTTGCTGATTCAGATCCATGGTCAGCACGCt  <  1:1325115/60‑1 (MQ=255)
  ccTCTGTCACAACTGCGCGAACTGGGTCAGTTGCTGATTCAGATCCATGGTCAGCACGCt  <  1:1320524/60‑1 (MQ=255)
  ccTCTGTCACAACTGCGCGAACTGGGTCAGTTGCTGATTCAGATCCATGGTCAGCACGCt  <  1:1289075/60‑1 (MQ=255)
  ccTCTGTCACAACTGCGCGAACTGGGTCAGTTGCTGATTCAGATCCATGGTCAGCACGCt  <  1:1282729/60‑1 (MQ=255)
  ccTCTGTCACAACTGCGCGAACTGGGTCAGTTGCTGATTCAGATCCATGGTCAGCACGCt  <  1:127385/60‑1 (MQ=255)
  ccTCTGTCACAACTGCGCGAACTGGGTCAGTTGCTGATTCAGATCCATGGTCAGCACGCt  <  1:1234069/60‑1 (MQ=255)
  ccTCTGTCACAACTGCGCGAACTGGGTCAGTTGCTGATTCAGATCCATGGTCAGCACGCt  <  1:1233529/60‑1 (MQ=255)
  ccTCTGTCACAACTGCGCGAACTGGGTCAGTTGCTGATTCAGATCCATGGTCAGCACGCt  <  1:1233306/60‑1 (MQ=255)
  ccTCTGTCACAACTGCGCGAACTGGGTCAGTTGCTGATTCAGATCCATGGTCAGCACGCt  <  1:286578/60‑1 (MQ=255)
  ccTCTGTCACAACTGCGCGAACTGGGTCAGTTGCTGATTCAGATCCATGGTCAGCACGCt  <  1:1231423/60‑1 (MQ=255)
  ccTCTGTCACAACTGCGCGAACTGGGTCAGTTGCTGATTCAGATCCATGGTCAGCACGCt  <  1:1226275/60‑1 (MQ=255)
  ccTCTGTCACAACTGCGCGAACTGGGTCAGTTGCTGATTCAGATCCATGGTCAGCACGCt  <  1:1110703/60‑1 (MQ=255)
  ccTCTGTCACAACTGCGCGAACTGGGTCAGTTGCTGATTCAGATCCATGGTCAGCACGCt  <  1:1090296/60‑1 (MQ=255)
  ccTCTGTCACAACTGCGCGAACTGGGTCAGTTGCTGATTCAGATCCATGGTCAGCACGCt  <  1:1055065/60‑1 (MQ=255)
  ccTCTGTCACAACTGCGCGAACTGGGTCAGTTGCTGATTCAGATCCATGGTCAGCACGCt  <  1:1049967/60‑1 (MQ=255)
  ccTCTGTCACAACTGCGCGAACTGGGTCAGTTGCTGATTCAGATCCATGGTCAGCACGCt  <  1:1048239/60‑1 (MQ=255)
  ccTCTGTCACAACTGCGCGAACTGGGTCAGTTGCTGATTCAGATCCATGGTCAGCACGCt  <  1:1036170/60‑1 (MQ=255)
  ccTCTGTCACAACTGCGCGAACTGGGTCAGTTGCTGATTCAGATCCATGGTCAGCACGCt  <  1:1329195/60‑1 (MQ=255)
  ccTCTGTCACAACTGCGCGAACTGGGTCAGTTGCTGATTCAGATCCATGGTCAGCACGCt  <  1:277951/60‑1 (MQ=255)
  ccTCTGTCACAACTGCGCGAACTGGGTCAGTTGCTGATTCAGATCCATGGTCAGCACGCt  <  1:2579/60‑1 (MQ=255)
  ccTCTGTCACAACTGCGCGAACTGGGTCAGTTGCTGATTCAGATCCATGGTCAGCACGCt  <  1:232987/60‑1 (MQ=255)
  ccTCTGTCACAACTGCGCGAACTGGGTCAGTTGCTGATTCAGATCCATGGTCAGCACGCt  <  1:213274/60‑1 (MQ=255)
  ccTCTGTCACAACTGCGCGAACTGGGTCAGTTGCTGATTCAGATCCATGGTCAGCACGCt  <  1:179306/60‑1 (MQ=255)
  ccTCTGTCACAACTGCGCGAACTGGGTCAGTTGCTGATTCAGATCCATGGTCAGCACGCt  <  1:1470028/60‑1 (MQ=255)
  ccTCTGTCACAACTGCGCGAACTGGGTCAGTTGCTGATTCAGATCCATGGTCAGCACGCt  <  1:1465084/60‑1 (MQ=255)
  ccTCTGTCACAACTGCGCGAACTGGGTCAGTTGCTGATTCAGATCCATGGTCAGCACGCt  <  1:1431199/60‑1 (MQ=255)
  ccTCTGTCACAACTGCGCGAACTGGGTCAGTTGCTGATTCAGATCCATGGTCAGCACGCt  <  1:1397405/60‑1 (MQ=255)
  ccTCTGTCACAACTGCGCGAACTGGGTCAGTTGCTGATTCAGATCCATGGTCAGCACGCt  <  1:1385888/60‑1 (MQ=255)
  ccTCTGTCACAACTGCGCGAACTGGGTCAGTTGCTGATTCAGATCCATGGTCAGCACGCt  <  1:1342230/60‑1 (MQ=255)
  ccTCTGTCACAACTGCGCGAACTGGGTCAGTTGCTGATTCAGATCCATGGTCAGCACGCt  <  1:1331666/60‑1 (MQ=255)
  ccTCTGTCACAACTGCGCGAACTGGGTCAGTTGCTGATTCAGATCCATGGTCAGCACGCt  <  1:1326746/60‑1 (MQ=255)
  ccTCTGTCACAACTGCGCGAACTGGGGCAGTTGCTGATTCAGATCCATGGTCAGCACGCt  <  1:827301/60‑1 (MQ=255)
  ccTCTGTCACAACTGAGCGAACTGGGTCAGTTGCTGATTCAGATCCATGGTCAGCACGCt  <  1:523208/60‑1 (MQ=255)
   ctctGTCACAACTGCGCGAACTGGGTCAGTTGCTGATTCAGTTCCATGGTCAGCACGCt  <  1:814025/59‑1 (MQ=255)
         cacaACTGCGCGAACTGGGTCAGTTGCTGATTCAGATCCATGGTCAGCACGCt  <  1:214299/53‑1 (MQ=255)
           caACTGCGCGAACTGGGTCAGTTGCTGATTCAGATCCATGGTCAGCACGCt  <  1:1020438/51‑1 (MQ=255)
                 cgcgAACTGGGTCAGTTGCTGATTCAGATCCATGGTCAGCACGCt  <  1:352370/45‑1 (MQ=255)
                                                             |
TTCCTCTGTCACAACTGCGCGAACTGGGTCAGTTGCTGATTCAGATCCATGGTCAGCACGCT  >  W3110S.gb/2750785‑2750846

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: