Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2752295	2752308	14	42 [0]	[0] 21	smpA	small membrane lipoprotein

CTCGGGCCCGAAAAGGAATCAAATCACTATGCGCTGTAAAACGCTGACTGCTGCAGCAGCAG  >  W3110S.gb/2752233‑2752294                                                              | cTCGGGCCCGAAAAGGAATCAAATCACTATGCGCTGTAAAACGCTGACTGCTGcagcagcag  <  1:1321493/62‑1 (MQ=255)   cGGGCCCGAAAAGGAATCAAATCACTATGCGCTGTGAAACGCTGACTGCTGcagcagcag  <  1:434114/60‑1 (MQ=255)   cGGGCCCGAAAAGGAATCAAATCACTATGCGCTGTAAAACGCTGACTGCTGcagcagcag  <  1:543460/60‑1 (MQ=255)   cGGGCCCGAAAAGGAATCAAATCACTATGCGCTGTAAAACGCTGACTGCTGcagcagcag  <  1:302087/60‑1 (MQ=255)   cGGGCCCGAAAAGGAATCAAATCACTATGCGCTGTAAAACGCTGACTGCTGcagcagcag  <  1:31459/60‑1 (MQ=255)   cGGGCCCGAAAAGGAATCAAATCACTATGCGCTGTAAAACGCTGACTGCTGcagcagcag  <  1:350377/60‑1 (MQ=255)   cGGGCCCGAAAAGGAATCAAATCACTATGCGCTGTAAAACGCTGACTGCTGcagcagcag  <  1:410817/60‑1 (MQ=255)   cGGGCCCGAAAAGGAATCAAATCACTATGCGCTGTAAAACGCTGACTGCTGcagcagcag  <  1:447996/60‑1 (MQ=255)   cGGGCCCGAAAAGGAATCAAATCACTATGCGCTGTAAAACGCTGACTGCTGcagcagcag  <  1:454437/60‑1 (MQ=255)   cGGGCCCGAAAAGGAATCAAATCACTATGCGCTGTAAAACGCTGACTGCTGcagcagcag  <  1:471984/60‑1 (MQ=255)   cGGGCCCGAAAAGGAATCAAATCACTATGCGCTGTAAAACGCTGACTGCTGcagcagcag  <  1:474763/60‑1 (MQ=255)   cGGGCCCGAAAAGGAATCAAATCACTATGCGCTGTAAAACGCTGACTGCTGcagcagcag  <  1:291779/60‑1 (MQ=255)   cGGGCCCGAAAAGGAATCAAATCACTATGCGCTGTAAAACGCTGACTGCTGcagcagcag  <  1:558621/60‑1 (MQ=255)   cGGGCCCGAAAAGGAATCAAATCACTATGCGCTGTAAAACGCTGACTGCTGcagcagcag  <  1:580245/60‑1 (MQ=255)   cGGGCCCGAAAAGGAATCAAATCACTATGCGCTGTAAAACGCTGACTGCTGcagcagcag  <  1:59235/60‑1 (MQ=255)   cGGGCCCGAAAAGGAATCAAATCACTATGCGCTGTAAAACGCTGACTGCTGcagcagcag  <  1:593783/60‑1 (MQ=255)   cGGGCCCGAAAAGGAATCAAATCACTATGCGCTGTAAAACGCTGACTGCTGcagcagcag  <  1:594805/60‑1 (MQ=255)   cGGGCCCGAAAAGGAATCAAATCACTATGCGCTGTAAAACGCTGACTGCTGcagcagcag  <  1:611769/60‑1 (MQ=255)   cGGGCCCGAAAAGGAATCAAATCACTATGCGCTGTAAAACGCTGACTGCTGcagcagcag  <  1:653456/60‑1 (MQ=255)   cGGGCCCGAAAAGGAATCAAATCACTATGCGCTGTAAAACGCTGACTGCTGcagcagcag  <  1:659819/60‑1 (MQ=255)   cGGGCCCGAAAAGGAATCAAATCACTATGCGCTGTAAAACGCTGACTGCTGcagcagcag  <  1:867295/60‑1 (MQ=255)   cGGGCCCGAAAAGGAATCAAATCACTATGCGCTGTAAAACGCTGACTGCTGcagcagcag  <  1:939934/60‑1 (MQ=255)   cGGGCCCGAAAAGGAATCAAATCACTATGCGCTGTAAAACGCTGACTGCTGcagcagcag  <  1:117776/60‑1 (MQ=255)   cGGGCCCGAAAAGGAATCAAATCACTATGCGCTGTAAAACGCTGACTGCTGcagcagcag  <  1:1023572/60‑1 (MQ=255)   cGGGCCCGAAAAGGAATCAAATCACTATGCGCTGTAAAACGCTGACTGCTGcagcagcag  <  1:1037585/60‑1 (MQ=255)   cGGGCCCGAAAAGGAATCAAATCACTATGCGCTGTAAAACGCTGACTGCTGcagcagcag  <  1:1038077/60‑1 (MQ=255)   cGGGCCCGAAAAGGAATCAAATCACTATGCGCTGTAAAACGCTGACTGCTGcagcagcag  <  1:1065275/60‑1 (MQ=255)   cGGGCCCGAAAAGGAATCAAATCACTATGCGCTGTAAAACGCTGACTGCTGcagcagcag  <  1:1065743/60‑1 (MQ=255)   cGGGCCCGAAAAGGAATCAAATCACTATGCGCTGTAAAACGCTGACTGCTGcagcagcag  <  1:1074606/60‑1 (MQ=255)   cGGGCCCGAAAAGGAATCAAATCACTATGCGCTGTAAAACGCTGACTGCTGcagcagcag  <  1:1087833/60‑1 (MQ=255)   cGGGCCCGAAAAGGAATCAAATCACTATGCGCTGTAAAACGCTGACTGCTGcagcagcag  <  1:1126100/60‑1 (MQ=255)   cGGGCCCGAAAAGGAATCAAATCACTATGCGCTGTAAAACGCTGACTGCTGcagcagcag  <  1:1140070/60‑1 (MQ=255)   cGGGCCCGAAAAGGAATCAAATCACTATGCGCTGTAAAACGCTGACTGCTGcagcagcag  <  1:1004482/60‑1 (MQ=255)   cGGGCCCGAAAAGGAATCAAATCACTATGCGCTGTAAAACGCTGACTGCTGcagcagcag  <  1:120278/60‑1 (MQ=255)   cGGGCCCGAAAAGGAATCAAATCACTATGCGCTGTAAAACGCTGACTGCTGcagcagcag  <  1:1284651/60‑1 (MQ=255)   cGGGCCCGAAAAGGAATCAAATCACTATGCGCTGTAAAACGCTGACTGCTGcagcagcag  <  1:128848/60‑1 (MQ=255)   cGGGCCCGAAAAGGAATCAAATCACTATGCGCTGTAAAACGCTGACTGCTGcagcagcag  <  1:133738/60‑1 (MQ=255)   cGGGCCCGAAAAGGAATCAAATCACTATGCGCTGTAAAACGCTGACTGCTGcagcagcag  <  1:1441428/60‑1 (MQ=255)   cGGGCCCGAAAAGGAATCAAATCACTATGCGCTGTAAAACGCTGACTGCTGcagcagcag  <  1:1467956/60‑1 (MQ=255)   cGGGCCCGAAAAGGAATCAAATCACTATGCGCTGTAAAACGCTGACTGCTGcagcagcag  <  1:206596/60‑1 (MQ=255)   cGGGCCCGAAAAGGAATCAAATCACTATGCGCTGTAAAACGCTGACTGCTGcagcagcag  <  1:233070/60‑1 (MQ=255)                 aatcaaatcaCTATGCGCTGTAAAACGCTGACTGCTGcagcagcag  <  1:1358162/46‑1 (MQ=255)                                                              | CTCGGGCCCGAAAAGGAATCAAATCACTATGCGCTGTAAAACGCTGACTGCTGCAGCAGCAG  >  W3110S.gb/2752233‑2752294

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑