Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2787870	2788166	297	27 [0]	[0] 100	ygaT	hypothetical protein

CGTTTCTGCGTTTTCGGGTAGCCAAAATTCTTGACGATCTATGTGCGA  >  W3110S.gb/2787822‑2787869                                                | cGTTTCTGCGTTTTCGGGTAGCCAAAATTCTTGACGATCTATGTGCGa  <  1:359719/48‑1 (MQ=255) cGTTTCTGCGTTTTCGGGTAGCCAAAATTCTTGACGATCTATGTGCGa  <  1:934509/48‑1 (MQ=255) cGTTTCTGCGTTTTCGGGTAGCCAAAATTCTTGACGATCTATGTGCGa  <  1:929931/48‑1 (MQ=255) cGTTTCTGCGTTTTCGGGTAGCCAAAATTCTTGACGATCTATGTGCGa  <  1:891436/48‑1 (MQ=255) cGTTTCTGCGTTTTCGGGTAGCCAAAATTCTTGACGATCTATGTGCGa  <  1:847483/48‑1 (MQ=255) cGTTTCTGCGTTTTCGGGTAGCCAAAATTCTTGACGATCTATGTGCGa  <  1:624102/48‑1 (MQ=255) cGTTTCTGCGTTTTCGGGTAGCCAAAATTCTTGACGATCTATGTGCGa  <  1:596238/48‑1 (MQ=255) cGTTTCTGCGTTTTCGGGTAGCCAAAATTCTTGACGATCTATGTGCGa  <  1:575837/48‑1 (MQ=255) cGTTTCTGCGTTTTCGGGTAGCCAAAATTCTTGACGATCTATGTGCGa  <  1:51159/48‑1 (MQ=255) cGTTTCTGCGTTTTCGGGTAGCCAAAATTCTTGACGATCTATGTGCGa  <  1:507529/48‑1 (MQ=255) cGTTTCTGCGTTTTCGGGTAGCCAAAATTCTTGACGATCTATGTGCGa  <  1:506741/48‑1 (MQ=255) cGTTTCTGCGTTTTCGGGTAGCCAAAATTCTTGACGATCTATGTGCGa  <  1:506410/48‑1 (MQ=255) cGTTTCTGCGTTTTCGGGTAGCCAAAATTCTTGACGATCTATGTGCGa  <  1:433934/48‑1 (MQ=255) cGTTTCTGCGTTTTCGGGTAGCCAAAATTCTTGACGATCTATGTGCGa  <  1:372236/48‑1 (MQ=255) cGTTTCTGCGTTTTCGGGTAGCCAAAATTCTTGACGATCTATGTGCGa  <  1:1082900/48‑1 (MQ=255) cGTTTCTGCGTTTTCGGGTAGCCAAAATTCTTGACGATCTATGTGCGa  <  1:26504/48‑1 (MQ=255) cGTTTCTGCGTTTTCGGGTAGCCAAAATTCTTGACGATCTATGTGCGa  <  1:229648/48‑1 (MQ=255) cGTTTCTGCGTTTTCGGGTAGCCAAAATTCTTGACGATCTATGTGCGa  <  1:223219/48‑1 (MQ=255) cGTTTCTGCGTTTTCGGGTAGCCAAAATTCTTGACGATCTATGTGCGa  <  1:222107/48‑1 (MQ=255) cGTTTCTGCGTTTTCGGGTAGCCAAAATTCTTGACGATCTATGTGCGa  <  1:167090/48‑1 (MQ=255) cGTTTCTGCGTTTTCGGGTAGCCAAAATTCTTGACGATCTATGTGCGa  <  1:164323/48‑1 (MQ=255) cGTTTCTGCGTTTTCGGGTAGCCAAAATTCTTGACGATCTATGTGCGa  <  1:1403637/48‑1 (MQ=255) cGTTTCTGCGTTTTCGGGTAGCCAAAATTCTTGACGATCTATGTGCGa  <  1:1400370/48‑1 (MQ=255) cGTTTCTGCGTTTTCGGGTAGCCAAAATTCTTGACGATCTATGTGCGa  <  1:1348650/48‑1 (MQ=255) cGTTTCTGCGTTTTCGGGTAGCCAAAATTCTTGACGATCTATGTGCGa  <  1:1201856/48‑1 (MQ=255) cGTTTCTGCGTTTTCGGGTAGCCAAAATTCTTGACGATCTATGTGCGa  <  1:1146730/48‑1 (MQ=255)  gTTTCTGCGTTTTCGGGTAGCCAAAATTCTTGACGATCTATGTGCGa  <  1:186626/47‑1 (MQ=255)                                                | CGTTTCTGCGTTTTCGGGTAGCCAAAATTCTTGACGATCTATGTGCGA  >  W3110S.gb/2787822‑2787869

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑