Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2812198	2812233	36	66 [0]	[0] 45	emrB	multidrug efflux system protein

CGCAGTTGTTGCAGGAGGTCTACGGTTACACGGCGACCTGGGCAGGTTTGGC  >  W3110S.gb/2812146‑2812197                                                    | cGCAGTTGTTGCAGGAGGTCTATGGTTACACGGCGACCTGGGCAGGTTTGGc  >  1:688416/1‑52 (MQ=255) cGCAGTTGTTGCAGGAGGTCTACGGTTACACGGCGACCTGGGCAGGTTTGGc  >  1:510203/1‑52 (MQ=255) cGCAGTTGTTGCAGGAGGTCTACGGTTACACGGCGACCTGGGCAGGTTTGGc  >  1:711983/1‑52 (MQ=255) cGCAGTTGTTGCAGGAGGTCTACGGTTACACGGCGACCTGGGCAGGTTTGGc  >  1:687119/1‑52 (MQ=255) cGCAGTTGTTGCAGGAGGTCTACGGTTACACGGCGACCTGGGCAGGTTTGGc  >  1:663031/1‑52 (MQ=255) cGCAGTTGTTGCAGGAGGTCTACGGTTACACGGCGACCTGGGCAGGTTTGGc  >  1:589987/1‑52 (MQ=255) cGCAGTTGTTGCAGGAGGTCTACGGTTACACGGCGACCTGGGCAGGTTTGGc  >  1:570920/1‑52 (MQ=255) cGCAGTTGTTGCAGGAGGTCTACGGTTACACGGCGACCTGGGCAGGTTTGGc  >  1:562105/1‑52 (MQ=255) cGCAGTTGTTGCAGGAGGTCTACGGTTACACGGCGACCTGGGCAGGTTTGGc  >  1:556643/1‑52 (MQ=255) cGCAGTTGTTGCAGGAGGTCTACGGTTACACGGCGACCTGGGCAGGTTTGGc  >  1:718222/1‑52 (MQ=255) cGCAGTTGTTGCAGGAGGTCTACGGTTACACGGCGACCTGGGCAGGTTTGGc  >  1:509709/1‑52 (MQ=255) cGCAGTTGTTGCAGGAGGTCTACGGTTACACGGCGACCTGGGCAGGTTTGGc  >  1:489302/1‑52 (MQ=255) cGCAGTTGTTGCAGGAGGTCTACGGTTACACGGCGACCTGGGCAGGTTTGGc  >  1:487717/1‑52 (MQ=255) cGCAGTTGTTGCAGGAGGTCTACGGTTACACGGCGACCTGGGCAGGTTTGGc  >  1:482620/1‑52 (MQ=255) cGCAGTTGTTGCAGGAGGTCTACGGTTACACGGCGACCTGGGCAGGTTTGGc  >  1:450720/1‑52 (MQ=255) cGCAGTTGTTGCAGGAGGTCTACGGTTACACGGCGACCTGGGCAGGTTTGGc  >  1:444145/1‑52 (MQ=255) cGCAGTTGTTGCAGGAGGTCTACGGTTACACGGCGACCTGGGCAGGTTTGGc  >  1:1008644/1‑52 (MQ=255) cGCAGTTGTTGCAGGAGGTCTACGGTTACACGGCGACCTGGGCAGGTTTGGc  >  1:403676/1‑52 (MQ=255) cGCAGTTGTTGCAGGAGGTCTACGGTTACACGGCGACCTGGGCAGGTTTGGc  >  1:765591/1‑52 (MQ=255) cGCAGTTGTTGCAGGAGGTCTACGGTTACACGGCGACCTGGGCAGGTTTGGc  >  1:792268/1‑52 (MQ=255) cGCAGTTGTTGCAGGAGGTCTACGGTTACACGGCGACCTGGGCAGGTTTGGc  >  1:802610/1‑52 (MQ=255) cGCAGTTGTTGCAGGAGGTCTACGGTTACACGGCGACCTGGGCAGGTTTGGc  >  1:804329/1‑52 (MQ=255) cGCAGTTGTTGCAGGAGGTCTACGGTTACACGGCGACCTGGGCAGGTTTGGc  >  1:828013/1‑52 (MQ=255) cGCAGTTGTTGCAGGAGGTCTACGGTTACACGGCGACCTGGGCAGGTTTGGc  >  1:851033/1‑52 (MQ=255) cGCAGTTGTTGCAGGAGGTCTACGGTTACACGGCGACCTGGGCAGGTTTGGc  >  1:854767/1‑52 (MQ=255) cGCAGTTGTTGCAGGAGGTCTACGGTTACACGGCGACCTGGGCAGGTTTGGc  >  1:878061/1‑52 (MQ=255) cGCAGTTGTTGCAGGAGGTCTACGGTTACACGGCGACCTGGGCAGGTTTGGc  >  1:937146/1‑52 (MQ=255) cGCAGTTGTTGCAGGAGGTCTACGGTTACACGGCGACCTGGGCAGGTTTGGc  >  1:9496/1‑52 (MQ=255) cGCAGTTGTTGCAGGAGGTCTACGGTTACACGGCGACCTGGGCAGGTTTGGc  >  1:951690/1‑52 (MQ=255) cGCAGTTGTTGCAGGAGGTCTACGGTTACACGGCGACCTGGGCAGGTTTGGc  >  1:954839/1‑52 (MQ=255) cGCAGTTGTTGCAGGAGGTCTACGGTTACACGGCGACCTGGGCAGGTTTGGc  >  1:96894/1‑52 (MQ=255) cGCAGTTGTTGCAGGAGGTCTACGGTTACACGGCGACCTGGGCAGGTTTGGc  >  1:977985/1‑52 (MQ=255) cGCAGTTGTTGCAGGAGGTCTACGGTTACACGGCGACCTGGGCAGGTTTGGc  >  1:994902/1‑52 (MQ=255) cGCAGTTGTTGCAGGAGGTCTACGGTTACACGGCGACCTGGGCAGGTTTGGc  >  1:135768/1‑52 (MQ=255) cGCAGTTGTTGCAGGAGGTCTACGGTTACACGGCGACCTGGGCAGGTTTGGc  >  1:1038202/1‑52 (MQ=255) cGCAGTTGTTGCAGGAGGTCTACGGTTACACGGCGACCTGGGCAGGTTTGGc  >  1:1043273/1‑52 (MQ=255) cGCAGTTGTTGCAGGAGGTCTACGGTTACACGGCGACCTGGGCAGGTTTGGc  >  1:1066714/1‑52 (MQ=255) cGCAGTTGTTGCAGGAGGTCTACGGTTACACGGCGACCTGGGCAGGTTTGGc  >  1:1066962/1‑52 (MQ=255) cGCAGTTGTTGCAGGAGGTCTACGGTTACACGGCGACCTGGGCAGGTTTGGc  >  1:1070168/1‑52 (MQ=255) cGCAGTTGTTGCAGGAGGTCTACGGTTACACGGCGACCTGGGCAGGTTTGGc  >  1:1072270/1‑52 (MQ=255) cGCAGTTGTTGCAGGAGGTCTACGGTTACACGGCGACCTGGGCAGGTTTGGc  >  1:1075540/1‑52 (MQ=255) cGCAGTTGTTGCAGGAGGTCTACGGTTACACGGCGACCTGGGCAGGTTTGGc  >  1:1086396/1‑52 (MQ=255) cGCAGTTGTTGCAGGAGGTCTACGGTTACACGGCGACCTGGGCAGGTTTGGc  >  1:1142572/1‑52 (MQ=255) cGCAGTTGTTGCAGGAGGTCTACGGTTACACGGCGACCTGGGCAGGTTTGGc  >  1:1194447/1‑52 (MQ=255) cGCAGTTGTTGCAGGAGGTCTACGGTTACACGGCGACCTGGGCAGGTTTGGc  >  1:1220081/1‑52 (MQ=255) cGCAGTTGTTGCAGGAGGTCTACGGTTACACGGCGACCTGGGCAGGTTTGGc  >  1:1243980/1‑52 (MQ=255) cGCAGTTGTTGCAGGAGGTCTACGGTTACACGGCGACCTGGGCAGGTTTGGc  >  1:1266267/1‑52 (MQ=255) cGCAGTTGTTGCAGGAGGTCTACGGTTACACGGCGACCTGGGCAGGTTTGGc  >  1:1311464/1‑52 (MQ=255) cGCAGTTGTTGCAGGAGGTCTACGGTTACACGGCGACCTGGGCAGGTTTGGc  >  1:1337905/1‑52 (MQ=255) cGCAGTTGTTGCAGGAGGTCTACGGTTACACGGCGACCTGGGCAGGTTTGGc  >  1:166646/1‑52 (MQ=255) cGCAGTTGTTGCAGGAGGTCTACGGTTACACGGCGACCTGGGCAGGTTTGGc  >  1:36230/1‑52 (MQ=255) cGCAGTTGTTGCAGGAGGTCTACGGTTACACGGCGACCTGGGCAGGTTTGGc  >  1:330424/1‑52 (MQ=255) cGCAGTTGTTGCAGGAGGTCTACGGTTACACGGCGACCTGGGCAGGTTTGGc  >  1:320240/1‑52 (MQ=255) cGCAGTTGTTGCAGGAGGTCTACGGTTACACGGCGACCTGGGCAGGTTTGGc  >  1:29977/1‑52 (MQ=255) cGCAGTTGTTGCAGGAGGTCTACGGTTACACGGCGACCTGGGCAGGTTTGGc  >  1:298748/1‑52 (MQ=255) cGCAGTTGTTGCAGGAGGTCTACGGTTACACGGCGACCTGGGCAGGTTTGGc  >  1:296791/1‑52 (MQ=255) cGCAGTTGTTGCAGGAGGTCTACGGTTACACGGCGACCTGGGCAGGTTTGGc  >  1:290282/1‑52 (MQ=255) cGCAGTTGTTGCAGGAGGTCTACGGTTACACGGCGACCTGGGCAGGTTTGGc  >  1:248363/1‑52 (MQ=255) cGCAGTTGTTGCAGGAGGTCTACGGTTACACGGCGACCTGGGCAGGTTTGGc  >  1:396131/1‑52 (MQ=255) cGCAGTTGTTGCAGGAGGTCTACGGTTACACGGCGACCTGGGCAGGTTTGGc  >  1:16213/1‑52 (MQ=255) cGCAGTTGTTGCAGGAGGTCTACGGTTACACGGCGACCTGGGCAGGTTTGGc  >  1:1406876/1‑52 (MQ=255) cGCAGTTGTTGCAGGAGGTCTACGGTTACACGGCGACCTGGGCAGGTTTGGc  >  1:1405948/1‑52 (MQ=255) cGCAGTTGTTGCAGGAGGTCTACGGTTACACGGCGACCTGGGCAGGTTTGGc  >  1:1399753/1‑52 (MQ=255) cGCAGTTGTTGCAGGAGGTCTACGGTTACACGGCGACCTGGGCAGGTTTGGc  >  1:1385851/1‑52 (MQ=255) cGCAGTTGTTGCAGGAGGTCTACGGTTACACGGCGACCTGGGCAGGTTTGGc  >  1:1359158/1‑52 (MQ=255) cGCAGTTGTTGCAGGAGGTCTACGGTTAAACGGCGACCTGGGCAGGTTTGGc  >  1:776688/1‑52 (MQ=255)                                                    | CGCAGTTGTTGCAGGAGGTCTACGGTTACACGGCGACCTGGGCAGGTTTGGC  >  W3110S.gb/2812146‑2812197

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑