Missing coverage evidence...
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*	*	÷	W3110S.gb	2865199	2865607	409	32 [0]	[0] 49	[rpoS]	[rpoS]

CCGATGGGCATCGGACCTTTTATTGTGCACAGAAAAGGCCAGCCTCGCTTGAGACTGGCCTT  >  W3110S.gb/2865137‑2865198                                                              | ccGATTGGCATCGGACCTTTTATTGTGCACAGAAAAGGCCAGCCTCGCTTGAGACTGGCCtt  <  1:891312/62‑1 (MQ=255) ccGATGGGCATCGGACCTTTTATTTTGCACAGAAAAGGCCAGCCTCGCTTGAGACTGGCCtt  <  1:655468/62‑1 (MQ=255) ccGATGGGCATCGGACCTTTTATTGTGCACAGAAAAGGCCAGCCTCGCTTGAGACTGGCCtt  <  1:335743/62‑1 (MQ=255) ccGATGGGCATCGGACCTTTTATTGTGCACAGAAAAGGCCAGCCTCGCTTGAGACTGGCCtt  <  1:828861/62‑1 (MQ=255) ccGATGGGCATCGGACCTTTTATTGTGCACAGAAAAGGCCAGCCTCGCTTGAGACTGGCCtt  <  1:787123/62‑1 (MQ=255) ccGATGGGCATCGGACCTTTTATTGTGCACAGAAAAGGCCAGCCTCGCTTGAGACTGGCCtt  <  1:745774/62‑1 (MQ=255) ccGATGGGCATCGGACCTTTTATTGTGCACAGAAAAGGCCAGCCTCGCTTGAGACTGGCCtt  <  1:696961/62‑1 (MQ=255) ccGATGGGCATCGGACCTTTTATTGTGCACAGAAAAGGCCAGCCTCGCTTGAGACTGGCCtt  <  1:645683/62‑1 (MQ=255) ccGATGGGCATCGGACCTTTTATTGTGCACAGAAAAGGCCAGCCTCGCTTGAGACTGGCCtt  <  1:531711/62‑1 (MQ=255) ccGATGGGCATCGGACCTTTTATTGTGCACAGAAAAGGCCAGCCTCGCTTGAGACTGGCCtt  <  1:502395/62‑1 (MQ=255) ccGATGGGCATCGGACCTTTTATTGTGCACAGAAAAGGCCAGCCTCGCTTGAGACTGGCCtt  <  1:404138/62‑1 (MQ=255) ccGATGGGCATCGGACCTTTTATTGTGCACAGAAAAGGCCAGCCTCGCTTGAGACTGGCCtt  <  1:340980/62‑1 (MQ=255) ccGATGGGCATCGGACCTTTTATTGTGCACAGAAAAGGCCAGCCTCGCTTGAGACTGGCCtt  <  1:1025221/62‑1 (MQ=255) ccGATGGGCATCGGACCTTTTATTGTGCACAGAAAAGGCCAGCCTCGCTTGAGACTGGCCtt  <  1:315043/62‑1 (MQ=255) ccGATGGGCATCGGACCTTTTATTGTGCACAGAAAAGGCCAGCCTCGCTTGAGACTGGCCtt  <  1:220010/62‑1 (MQ=255) ccGATGGGCATCGGACCTTTTATTGTGCACAGAAAAGGCCAGCCTCGCTTGAGACTGGCCtt  <  1:1118172/62‑1 (MQ=255) ccGATGGGCATCGGACCTTTTATTGTGCACAGAAAAGGCCAGCCTCGCTTGAGACTGGCCtt  <  1:1130070/62‑1 (MQ=255) ccGATGGGCATCGGACCTTTTATTGTGCACAGAAAAGGCCAGCCTCGCTTGAGACTGGCCtt  <  1:1169525/62‑1 (MQ=255) ccGATGGGCATCGGACCTTTTATTGTGCACAGAAAAGGCCAGCCTCGCTTGAGACTGGCCtt  <  1:117313/62‑1 (MQ=255) ccGATGGGCATCGGACCTTTTATTGTGCACAGAAAAGGCCAGCCTCGCTTGAGACTGGCCtt  <  1:1197317/62‑1 (MQ=255) ccGATGGGCATCGGACCTTTTATTGTGCACAGAAAAGGCCAGCCTCGCTTGAGACTGGCCtt  <  1:1377729/62‑1 (MQ=255) ccGATGGGCATCGGACCTTTTATTGTGCACAGAAAAGGCCAGCCTCGCTTGAGACTGGCCtt  <  1:1417553/62‑1 (MQ=255) ccGATGGGCATCGGACCTTTTATTGTGCACAGAAAAGGCCAGCCTCGCTTGAGACTGGCCtt  <  1:1463429/62‑1 (MQ=255) ccGATGGGCATCGGACCTTTTATTGTGCACAGAAAAGGCCAGCCTCGCTTGAGACTGGCCtt  <  1:165442/62‑1 (MQ=255) ccGATGGGCATCGGACCTTTTATTGTGCACAGAAAAGGCCAGCCTCGCTTGAGACTGGCCtt  <  1:215475/62‑1 (MQ=255) ccGATGGGCATCGGACCTTTTATTGTGCACAGAAAAGGCCAGCCTCGCTTGAGACTGGCCtt  <  1:254951/62‑1 (MQ=255) ccGATGGGAATCGGACCTTTTATTGTGCACAGAAAAGGCCAGCCTCGCTTGAGACTGGCCtt  <  1:113473/62‑1 (MQ=255)  cGATGGGCATCGGACCTTTTATTGTGCACAGAAAAGGCCAGCCTCGCTTGAGACTGGCCtt  <  1:460357/61‑1 (MQ=255)  cGATGGGCATCGGACCTTTTATTGTGCACAGAAAAGGCCAGCCTCGCTTGAGACTGGCCtt  <  1:344982/61‑1 (MQ=255)  cGATGGGCATCGGACCTTTTATTGTGCACAGAAAAGGCCAGCCTCGCTTGAGACTGGCCtt  <  1:760391/61‑1 (MQ=255)    aTGGGCATCGGACCTTTTATTGTGCACAGAAAAGGCCAGCCTCGCTTGAGACTGGCCtt  <  1:206340/59‑1 (MQ=255)          aTCGGACCTTTTATTGTGCACAGAAAAGGCCAGCCTCGCTTGAGACTGGCCtt  <  1:586103/53‑1 (MQ=255)                                                              | CCGATGGGCATCGGACCTTTTATTGTGCACAGAAAAGGCCAGCCTCGCTTGAGACTGGCCTT  >  W3110S.gb/2865137‑2865198

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑