Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2923631	2923760	130	40 [0]	[0] 29	syd	hypothetical protein

GAGTCACCAGATGACCAATCAGATTTTCCTGCACCCGACGGAAGTCGTCTTCACTCCAGGT  >  W3110S.gb/2923570‑2923630                                                             | gAGTCACCAGATGACCAATCAGATTTTCCTGCACCCGACGGAAGTCGTCTTCACTCCAGGt  <  1:691142/61‑1 (MQ=255) gAGTCACCAGATGACCAATCAGATTTTCCTGCACCCGACGGAAGTCGTCTTCACTCCAGGt  <  1:409468/61‑1 (MQ=255) gAGTCACCAGATGACCAATCAGATTTTCCTGCACCCGACGGAAGTCGTCTTCACTCCAGGt  <  1:1040257/61‑1 (MQ=255) gAGTCACCAGATGACCAATCAGATTTTCCTGCACCCGACGGAAGTCGTCTTCACTCCAGGt  <  1:412848/61‑1 (MQ=255) gAGTCACCAGATGACCAATCAGATTTTCCTGCACCCGACGGAAGTCGTCTTCACTCCAGGt  <  1:419580/61‑1 (MQ=255) gAGTCACCAGATGACCAATCAGATTTTCCTGCACCCGACGGAAGTCGTCTTCACTCCAGGt  <  1:456117/61‑1 (MQ=255) gAGTCACCAGATGACCAATCAGATTTTCCTGCACCCGACGGAAGTCGTCTTCACTCCAGGt  <  1:527998/61‑1 (MQ=255) gAGTCACCAGATGACCAATCAGATTTTCCTGCACCCGACGGAAGTCGTCTTCACTCCAGGt  <  1:576277/61‑1 (MQ=255) gAGTCACCAGATGACCAATCAGATTTTCCTGCACCCGACGGAAGTCGTCTTCACTCCAGGt  <  1:629770/61‑1 (MQ=255) gAGTCACCAGATGACCAATCAGATTTTCCTGCACCCGACGGAAGTCGTCTTCACTCCAGGt  <  1:410380/61‑1 (MQ=255) gAGTCACCAGATGACCAATCAGATTTTCCTGCACCCGACGGAAGTCGTCTTCACTCCAGGt  <  1:747429/61‑1 (MQ=255) gAGTCACCAGATGACCAATCAGATTTTCCTGCACCCGACGGAAGTCGTCTTCACTCCAGGt  <  1:848444/61‑1 (MQ=255) gAGTCACCAGATGACCAATCAGATTTTCCTGCACCCGACGGAAGTCGTCTTCACTCCAGGt  <  1:880024/61‑1 (MQ=255) gAGTCACCAGATGACCAATCAGATTTTCCTGCACCCGACGGAAGTCGTCTTCACTCCAGGt  <  1:88616/61‑1 (MQ=255) gAGTCACCAGATGACCAATCAGATTTTCCTGCACCCGACGGAAGTCGTCTTCACTCCAGGt  <  1:941661/61‑1 (MQ=255) gAGTCACCAGATGACCAATCAGATTTTCCTGCACCCGACGGAAGTCGTCTTCACTCCAGGt  <  1:959893/61‑1 (MQ=255) gAGTCACCAGATGACCAATCAGATTTTCCTGCACCCGACGGAAGTCGTCTTCACTCCAGGt  <  1:978953/61‑1 (MQ=255) gAGTCACCAGATGACCAATCAGATTTTCCTGCACCCGACGGAAGTCGTCTTCACTCCAGGt  <  1:985214/61‑1 (MQ=255) gAGTCACCAGATGACCAATCAGATTTTCCTGCACCCGACGGAAGTCGTCTTCACTCCAGGt  <  1:136611/61‑1 (MQ=255) gAGTCACCAGATGACCAATCAGATTTTCCTGCACCCGACGGAAGTCGTCTTCACTCCAGGt  <  1:1070794/61‑1 (MQ=255) gAGTCACCAGATGACCAATCAGATTTTCCTGCACCCGACGGAAGTCGTCTTCACTCCAGGt  <  1:1074900/61‑1 (MQ=255) gAGTCACCAGATGACCAATCAGATTTTCCTGCACCCGACGGAAGTCGTCTTCACTCCAGGt  <  1:1110211/61‑1 (MQ=255) gAGTCACCAGATGACCAATCAGATTTTCCTGCACCCGACGGAAGTCGTCTTCACTCCAGGt  <  1:1129127/61‑1 (MQ=255) gAGTCACCAGATGACCAATCAGATTTTCCTGCACCCGACGGAAGTCGTCTTCACTCCAGGt  <  1:1138451/61‑1 (MQ=255) gAGTCACCAGATGACCAATCAGATTTTCCTGCACCCGACGGAAGTCGTCTTCACTCCAGGt  <  1:1180237/61‑1 (MQ=255) gAGTCACCAGATGACCAATCAGATTTTCCTGCACCCGACGGAAGTCGTCTTCACTCCAGGt  <  1:1226906/61‑1 (MQ=255) gAGTCACCAGATGACCAATCAGATTTTCCTGCACCCGACGGAAGTCGTCTTCACTCCAGGt  <  1:132735/61‑1 (MQ=255) gAGTCACCAGATGACCAATCAGATTTTCCTGCACCCGACGGAAGTCGTCTTCACTCCAGGt  <  1:357064/61‑1 (MQ=255) gAGTCACCAGATGACCAATCAGATTTTCCTGCACCCGACGGAAGTCGTCTTCACTCCAGGt  <  1:1408463/61‑1 (MQ=255) gAGTCACCAGATGACCAATCAGATTTTCCTGCACCCGACGGAAGTCGTCTTCACTCCAGGt  <  1:1428349/61‑1 (MQ=255) gAGTCACCAGATGACCAATCAGATTTTCCTGCACCCGACGGAAGTCGTCTTCACTCCAGGt  <  1:189424/61‑1 (MQ=255) gAGTCACCAGATGACCAATCAGATTTTCCTGCACCCGACGGAAGTCGTCTTCACTCCAGGt  <  1:191249/61‑1 (MQ=255) gAGTCACCAGATGACCAATCAGATTTTCCTGCACCCGACGGAAGTCGTCTTCACTCCAGGt  <  1:328450/61‑1 (MQ=255) gAGTCACCAGATGACCAATCAGATTTTCCTGCACCCGACGGAAGTCGTCTTCACTCCAGGt  <  1:353834/61‑1 (MQ=255) gAGTCACCAGATGACCAATCAGATTTTCCTGCACCCGACGGAAGTCGTCTTCACTCAAGGt  <  1:764198/61‑1 (MQ=255) gAGTCACCAGATGACCAATCAGATTTTCCTGCACCCGACGGAAGTCGTCTACACTCCAGGt  <  1:231642/61‑1 (MQ=255) gAGGCACCAGATGACCAATCAGATTTTCCTGCACCCGACGGAAGTCGTCTTCACTCCAGGt  <  1:670585/61‑1 (MQ=255)  aGTCACCAGATGACCAATCAGATTTTCCTGCACCCGACGGAAGTCGTCTTCACTCCAGGt  <  1:517807/60‑1 (MQ=255)  aGTCACCAGATGACCAATCAGATTTTCCTGCACCCGACGGAAGTCGTCTTCACTCCAGGt  <  1:953004/60‑1 (MQ=255)        cAGATGACCAATCAGATTTTCCTGCACCCGACGGAAGTCGTCTTCACTCCAGGt  <  1:198495/54‑1 (MQ=255)                                                             | GAGTCACCAGATGACCAATCAGATTTTCCTGCACCCGACGGAAGTCGTCTTCACTCCAGGT  >  W3110S.gb/2923570‑2923630

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑