Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2985885	2985961	77	61 [0]	[0] 20	yqeG/yqeH	predicted transporter/conserved hypothetical protein with bipartite regulator domain

ATTATCAGTTAGTTAAACACACAAAGAGATCTGAACATCTTAAAT  >  W3110S.gb/2985840‑2985884                                             | attatCAGTTAGTTTAACACACAAAGAGATCTGAACATCTTAAAt  >  1:1269048/1‑45 (MQ=255) attatCAGTTAGTTAAACACCCAAAGAGATCTGAACATCTTAAAt  >  1:39930/1‑45 (MQ=255) attatCAGTTAGTTAAACACACTAAGAGATCTGAACATCTTAAAt  >  1:599380/1‑45 (MQ=255) attatCAGTTAGTTAAACACACAAAGAGATCTGAACATCTTAAAt  >  1:503237/1‑45 (MQ=255) attatCAGTTAGTTAAACACACAAAGAGATCTGAACATCTTAAAt  >  1:583070/1‑45 (MQ=255) attatCAGTTAGTTAAACACACAAAGAGATCTGAACATCTTAAAt  >  1:567988/1‑45 (MQ=255) attatCAGTTAGTTAAACACACAAAGAGATCTGAACATCTTAAAt  >  1:567607/1‑45 (MQ=255) attatCAGTTAGTTAAACACACAAAGAGATCTGAACATCTTAAAt  >  1:560058/1‑45 (MQ=255) attatCAGTTAGTTAAACACACAAAGAGATCTGAACATCTTAAAt  >  1:546866/1‑45 (MQ=255) attatCAGTTAGTTAAACACACAAAGAGATCTGAACATCTTAAAt  >  1:538563/1‑45 (MQ=255) attatCAGTTAGTTAAACACACAAAGAGATCTGAACATCTTAAAt  >  1:270914/1‑45 (MQ=255) attatCAGTTAGTTAAACACACAAAGAGATCTGAACATCTTAAAt  >  1:490682/1‑45 (MQ=255) attatCAGTTAGTTAAACACACAAAGAGATCTGAACATCTTAAAt  >  1:482869/1‑45 (MQ=255) attatCAGTTAGTTAAACACACAAAGAGATCTGAACATCTTAAAt  >  1:402527/1‑45 (MQ=255) attatCAGTTAGTTAAACACACAAAGAGATCTGAACATCTTAAAt  >  1:337671/1‑45 (MQ=255) attatCAGTTAGTTAAACACACAAAGAGATCTGAACATCTTAAAt  >  1:313787/1‑45 (MQ=255) attatCAGTTAGTTAAACACACAAAGAGATCTGAACATCTTAAAt  >  1:251277/1‑45 (MQ=255) attatCAGTTAGTTAAACACACAAAGAGATCTGAACATCTTAAAt  >  1:604765/1‑45 (MQ=255) attatCAGTTAGTTAAACACACAAAGAGATCTGAACATCTTAAAt  >  1:659079/1‑45 (MQ=255) attatCAGTTAGTTAAACACACAAAGAGATCTGAACATCTTAAAt  >  1:703714/1‑45 (MQ=255) attatCAGTTAGTTAAACACACAAAGAGATCTGAACATCTTAAAt  >  1:72142/1‑45 (MQ=255) attatCAGTTAGTTAAACACACAAAGAGATCTGAACATCTTAAAt  >  1:726083/1‑45 (MQ=255) attatCAGTTAGTTAAACACACAAAGAGATCTGAACATCTTAAAt  >  1:778171/1‑45 (MQ=255) attatCAGTTAGTTAAACACACAAAGAGATCTGAACATCTTAAAt  >  1:780809/1‑45 (MQ=255) attatCAGTTAGTTAAACACACAAAGAGATCTGAACATCTTAAAt  >  1:782122/1‑45 (MQ=255) attatCAGTTAGTTAAACACACAAAGAGATCTGAACATCTTAAAt  >  1:785097/1‑45 (MQ=255) attatCAGTTAGTTAAACACACAAAGAGATCTGAACATCTTAAAt  >  1:851881/1‑45 (MQ=255) attatCAGTTAGTTAAACACACAAAGAGATCTGAACATCTTAAAt  >  1:871050/1‑45 (MQ=255) attatCAGTTAGTTAAACACACAAAGAGATCTGAACATCTTAAAt  >  1:896928/1‑45 (MQ=255) attatCAGTTAGTTAAACACACAAAGAGATCTGAACATCTTAAAt  >  1:935641/1‑45 (MQ=255) attatCAGTTAGTTAAACACACAAAGAGATCTGAACATCTTAAAt  >  1:961438/1‑45 (MQ=255) attatCAGTTAGTTAAACACACAAAGAGATCTGAACATCTTAAAt  >  1:247831/1‑45 (MQ=255) attatCAGTTAGTTAAACACACAAAGAGATCTGAACATCTTAAAt  >  1:1077492/1‑45 (MQ=255) attatCAGTTAGTTAAACACACAAAGAGATCTGAACATCTTAAAt  >  1:1082901/1‑45 (MQ=255) attatCAGTTAGTTAAACACACAAAGAGATCTGAACATCTTAAAt  >  1:1089158/1‑45 (MQ=255) attatCAGTTAGTTAAACACACAAAGAGATCTGAACATCTTAAAt  >  1:1100470/1‑45 (MQ=255) attatCAGTTAGTTAAACACACAAAGAGATCTGAACATCTTAAAt  >  1:1113693/1‑45 (MQ=255) attatCAGTTAGTTAAACACACAAAGAGATCTGAACATCTTAAAt  >  1:1127295/1‑45 (MQ=255) attatCAGTTAGTTAAACACACAAAGAGATCTGAACATCTTAAAt  >  1:1132126/1‑45 (MQ=255) attatCAGTTAGTTAAACACACAAAGAGATCTGAACATCTTAAAt  >  1:1172301/1‑45 (MQ=255) attatCAGTTAGTTAAACACACAAAGAGATCTGAACATCTTAAAt  >  1:1204588/1‑45 (MQ=255) attatCAGTTAGTTAAACACACAAAGAGATCTGAACATCTTAAAt  >  1:1212841/1‑45 (MQ=255) attatCAGTTAGTTAAACACACAAAGAGATCTGAACATCTTAAAt  >  1:1226862/1‑45 (MQ=255) attatCAGTTAGTTAAACACACAAAGAGATCTGAACATCTTAAAt  >  1:1250751/1‑45 (MQ=255) attatCAGTTAGTTAAACACACAAAGAGATCTGAACATCTTAAAt  >  1:1264561/1‑45 (MQ=255) attatCAGTTAGTTAAACACACAAAGAGATCTGAACATCTTAAAt  >  1:1264599/1‑45 (MQ=255) attatCAGTTAGTTAAACACACAAAGAGATCTGAACATCTTAAAt  >  1:128603/1‑45 (MQ=255) attatCAGTTAGTTAAACACACAAAGAGATCTGAACATCTTAAAt  >  1:1363851/1‑45 (MQ=255) attatCAGTTAGTTAAACACACAAAGAGATCTGAACATCTTAAAt  >  1:1393280/1‑45 (MQ=255) attatCAGTTAGTTAAACACACAAAGAGATCTGAACATCTTAAAt  >  1:142711/1‑45 (MQ=255) attatCAGTTAGTTAAACACACAAAGAGATCTGAACATCTTAAAt  >  1:1447388/1‑45 (MQ=255) attatCAGTTAGTTAAACACACAAAGAGATCTGAACATCTTAAAt  >  1:149366/1‑45 (MQ=255) attatCAGTTAGTTAAACACACAAAGAGATCTGAACATCTTAAAt  >  1:188452/1‑45 (MQ=255) attatCAGTTAGTTAAACACACAAAGAGATCTGAACATCTTAAAt  >  1:190807/1‑45 (MQ=255) attatCAGTTAGTTAAACACACAAAGAGATCTGAACATCTTAAAt  >  1:201563/1‑45 (MQ=255) attatCAGTTAGTTAAACACACAAAGAGATCTGAACATCTTAAAt  >  1:214993/1‑45 (MQ=255) attatCAGTTAGTTAAACACACAAAGAGATCTGAACATCTTAAAt  >  1:228972/1‑45 (MQ=255) attatCAGTTAGTTAAACACACAAAGAGATCTGAACATCTTAAAt  >  1:2455/1‑45 (MQ=255) attatCAGTTAGTTAAACACACAAAGAGATCTGAACATCTTAAAt  >  1:247554/1‑45 (MQ=255) attatCAGTTAGTTAAACACACAAAGAGATCTGAACATCTTAAAt  >  1:107236/1‑45 (MQ=255) attatCAGTTAGTTAAACACACAAAGAGATCT‑AACATCTTAAAt  >  1:602899/1‑44 (MQ=255)                                             | ATTATCAGTTAGTTAAACACACAAAGAGATCTGAACATCTTAAAT  >  W3110S.gb/2985840‑2985884

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑