Missing coverage evidence...
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TCAGTTTAACTTCGATTGCGATTCCATTTATGCACAAGCCAGAAAAGCCGCTGCCAGTATGTGGCGTCGGATGGATGCGC  >  W3110S.gb/3019058‑3019137                                                              |                   tCATTTTAACTTCGATTGCGATTCCATTTATGCACAAGCCAGAAAAGCCGCTGCCAGTAtgt                    >  1:503624/1‑62 (MQ=255) tCAGTTTAACTTCGATTGCGATTCCATTTATGCACAAGCCAGAAAAGCCGCTGCCAGTAtgt                    >  1:428953/1‑62 (MQ=255) tCAGTTTAACTTCGATTGCGATTCCATTTATGCACAAGCCAGAAAAGCCGCTGCCAGTAtgt                    >  1:978962/1‑62 (MQ=255) tCAGTTTAACTTCGATTGCGATTCCATTTATGCACAAGCCAGAAAAGCCGCTGCCAGTAtgt                    >  1:765558/1‑62 (MQ=255) tCAGTTTAACTTCGATTGCGATTCCATTTATGCACAAGCCAGAAAAGCCGCTGCCAGTAtgt                    >  1:733981/1‑62 (MQ=255) tCAGTTTAACTTCGATTGCGATTCCATTTATGCACAAGCCAGAAAAGCCGCTGCCAGTAtgt                    >  1:722405/1‑62 (MQ=255) tCAGTTTAACTTCGATTGCGATTCCATTTATGCACAAGCCAGAAAAGCCGCTGCCAGTAtgt                    >  1:613229/1‑62 (MQ=255) tCAGTTTAACTTCGATTGCGATTCCATTTATGCACAAGCCAGAAAAGCCGCTGCCAGTAtgt                    >  1:601200/1‑62 (MQ=255) tCAGTTTAACTTCGATTGCGATTCCATTTATGCACAAGCCAGAAAAGCCGCTGCCAGTAtgt                    >  1:590053/1‑62 (MQ=255) tCAGTTTAACTTCGATTGCGATTCCATTTATGCACAAGCCAGAAAAGCCGCTGCCAGTAtgt                    >  1:54407/1‑62 (MQ=255) tCAGTTTAACTTCGATTGCGATTCCATTTATGCACAAGCCAGAAAAGCCGCTGCCAGTAtgt                    >  1:500632/1‑62 (MQ=255) tCAGTTTAACTTCGATTGCGATTCCATTTATGCACAAGCCAGAAAAGCCGCTGCCAGTAtgt                    >  1:46719/1‑62 (MQ=255) tCAGTTTAACTTCGATTGCGATTCCATTTATGCACAAGCCAGAAAAGCCGCTGCCAGTAtgt                    >  1:1023597/1‑62 (MQ=255) tCAGTTTAACTTCGATTGCGATTCCATTTATGCACAAGCCAGAAAAGCCGCTGCCAGTAtgt                    >  1:320321/1‑62 (MQ=255) tCAGTTTAACTTCGATTGCGATTCCATTTATGCACAAGCCAGAAAAGCCGCTGCCAGTAtgt                    >  1:285654/1‑62 (MQ=255) tCAGTTTAACTTCGATTGCGATTCCATTTATGCACAAGCCAGAAAAGCCGCTGCCAGTAtgt                    >  1:246907/1‑62 (MQ=255) tCAGTTTAACTTCGATTGCGATTCCATTTATGCACAAGCCAGAAAAGCCGCTGCCAGTAtgt                    >  1:216586/1‑62 (MQ=255) tCAGTTTAACTTCGATTGCGATTCCATTTATGCACAAGCCAGAAAAGCCGCTGCCAGTAtgt                    >  1:150703/1‑62 (MQ=255) tCAGTTTAACTTCGATTGCGATTCCATTTATGCACAAGCCAGAAAAGCCGCTGCCAGTAtgt                    >  1:1407552/1‑62 (MQ=255) tCAGTTTAACTTCGATTGCGATTCCATTTATGCACAAGCCAGAAAAGCCGCTGCCAGTAtgt                    >  1:1364277/1‑62 (MQ=255) tCAGTTTAACTTCGATTGCGATTCCATTTATGCACAAGCCAGAAAAGCCGCTGCCAGTAtgt                    >  1:1343776/1‑62 (MQ=255) tCAGTTTAACTTCGATTGCGATTCCATTTATGCACAAGCCAGAAAAGCCGCTGCCAGTAtgt                    >  1:131206/1‑62 (MQ=255) tCAGTTTAACTTCGATTGCGATTCCATTTATGCACAAGCCAGAAAAGCCGCTGCCAGTAtgt                    >  1:1303080/1‑62 (MQ=255) tCAGTTTAACTTCGATTGCGATTCCATTTATGCACAAGCCAGAAAAGCCGCTGCCAGTAtgt                    >  1:122106/1‑62 (MQ=255) tCAGTTTAACTTCGATTGCGATTCCATTTATGCACAAGCCAGAAAAGCCGCTGCCAGTAtgt                    >  1:1084692/1‑62 (MQ=255) tCAGTTTAACTTCGATTGCGATTCCATTTATGCACAAGCCAGAAAAGCCGCTGCCAGTAtgt                    >  1:1041726/1‑62 (MQ=255) tCAGTTTAACTTCGATTGCGATTCCATTTATGCACAAGCCAGAAAAGCCGCTGCCAGCAtgt                    >  1:9379/1‑62 (MQ=255)                    gATTCCATTTATGCACAAGCCAGAAAAGCCGCTGCCAGTATGTGGCGTCGGATGGATgcgc  <  1:507482/61‑1 (MQ=255)                    gATTCCATTTATGCACAAGCCAGAAAAGCCGCTGCCAGTATGTGGCGTCGGATGGATgcgc  <  1:1406405/61‑1 (MQ=255)                    gATTCCATTTATGCACAAGCCAGAAAAGCCGCTGCCAGTATGTGGCGTCGGATGGATgcgc  <  1:629872/61‑1 (MQ=255)                                                              |                   TCAGTTTAACTTCGATTGCGATTCCATTTATGCACAAGCCAGAAAAGCCGCTGCCAGTATGTGGCGTCGGATGGATGCGC  >  W3110S.gb/3019058‑3019137

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑