Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3089434	3089645	212	57 [0]	[0] 31	endA	DNA‑specific endonuclease I

CGTCAGTCGGTGAGGTGAATGGCGATCGCGGCAACTTTATGTACAGCCAGTGGAATGGCGG  >  W3110S.gb/3089373‑3089433                                                             | cGTCAGTCGGTGAGGTGAATGGCGATCGCGGCAACTTTATGTACAGCCAGTGGAATGGCgg  >  1:725507/1‑61 (MQ=255) cGTCAGTCGGTGAGGTGAATGGCGATCGCGGCAACTTTATGTACAGCCAGTGGAATGGCgg  >  1:48865/1‑61 (MQ=255) cGTCAGTCGGTGAGGTGAATGGCGATCGCGGCAACTTTATGTACAGCCAGTGGAATGGCgg  >  1:492883/1‑61 (MQ=255) cGTCAGTCGGTGAGGTGAATGGCGATCGCGGCAACTTTATGTACAGCCAGTGGAATGGCgg  >  1:514918/1‑61 (MQ=255) cGTCAGTCGGTGAGGTGAATGGCGATCGCGGCAACTTTATGTACAGCCAGTGGAATGGCgg  >  1:517173/1‑61 (MQ=255) cGTCAGTCGGTGAGGTGAATGGCGATCGCGGCAACTTTATGTACAGCCAGTGGAATGGCgg  >  1:520335/1‑61 (MQ=255) cGTCAGTCGGTGAGGTGAATGGCGATCGCGGCAACTTTATGTACAGCCAGTGGAATGGCgg  >  1:530812/1‑61 (MQ=255) cGTCAGTCGGTGAGGTGAATGGCGATCGCGGCAACTTTATGTACAGCCAGTGGAATGGCgg  >  1:59744/1‑61 (MQ=255) cGTCAGTCGGTGAGGTGAATGGCGATCGCGGCAACTTTATGTACAGCCAGTGGAATGGCgg  >  1:602228/1‑61 (MQ=255) cGTCAGTCGGTGAGGTGAATGGCGATCGCGGCAACTTTATGTACAGCCAGTGGAATGGCgg  >  1:628473/1‑61 (MQ=255) cGTCAGTCGGTGAGGTGAATGGCGATCGCGGCAACTTTATGTACAGCCAGTGGAATGGCgg  >  1:638134/1‑61 (MQ=255) cGTCAGTCGGTGAGGTGAATGGCGATCGCGGCAACTTTATGTACAGCCAGTGGAATGGCgg  >  1:645563/1‑61 (MQ=255) cGTCAGTCGGTGAGGTGAATGGCGATCGCGGCAACTTTATGTACAGCCAGTGGAATGGCgg  >  1:679373/1‑61 (MQ=255) cGTCAGTCGGTGAGGTGAATGGCGATCGCGGCAACTTTATGTACAGCCAGTGGAATGGCgg  >  1:693492/1‑61 (MQ=255) cGTCAGTCGGTGAGGTGAATGGCGATCGCGGCAACTTTATGTACAGCCAGTGGAATGGCgg  >  1:483912/1‑61 (MQ=255) cGTCAGTCGGTGAGGTGAATGGCGATCGCGGCAACTTTATGTACAGCCAGTGGAATGGCgg  >  1:790902/1‑61 (MQ=255) cGTCAGTCGGTGAGGTGAATGGCGATCGCGGCAACTTTATGTACAGCCAGTGGAATGGCgg  >  1:792527/1‑61 (MQ=255) cGTCAGTCGGTGAGGTGAATGGCGATCGCGGCAACTTTATGTACAGCCAGTGGAATGGCgg  >  1:794697/1‑61 (MQ=255) cGTCAGTCGGTGAGGTGAATGGCGATCGCGGCAACTTTATGTACAGCCAGTGGAATGGCgg  >  1:842390/1‑61 (MQ=255) cGTCAGTCGGTGAGGTGAATGGCGATCGCGGCAACTTTATGTACAGCCAGTGGAATGGCgg  >  1:850137/1‑61 (MQ=255) cGTCAGTCGGTGAGGTGAATGGCGATCGCGGCAACTTTATGTACAGCCAGTGGAATGGCgg  >  1:886992/1‑61 (MQ=255) cGTCAGTCGGTGAGGTGAATGGCGATCGCGGCAACTTTATGTACAGCCAGTGGAATGGCgg  >  1:903579/1‑61 (MQ=255) cGTCAGTCGGTGAGGTGAATGGCGATCGCGGCAACTTTATGTACAGCCAGTGGAATGGCgg  >  1:909311/1‑61 (MQ=255) cGTCAGTCGGTGAGGTGAATGGCGATCGCGGCAACTTTATGTACAGCCAGTGGAATGGCgg  >  1:92720/1‑61 (MQ=255) cGTCAGTCGGTGAGGTGAATGGCGATCGCGGCAACTTTATGTACAGCCAGTGGAATGGCgg  >  1:933426/1‑61 (MQ=255) cGTCAGTCGGTGAGGTGAATGGCGATCGCGGCAACTTTATGTACAGCCAGTGGAATGGCgg  >  1:959054/1‑61 (MQ=255) cGTCAGTCGGTGAGGTGAATGGCGATCGCGGCAACTTTATGTACAGCCAGTGGAATGGCgg  >  1:961286/1‑61 (MQ=255) cGTCAGTCGGTGAGGTGAATGGCGATCGCGGCAACTTTATGTACAGCCAGTGGAATGGCgg  >  1:985893/1‑61 (MQ=255) cGTCAGTCGGTGAGGTGAATGGCGATCGCGGCAACTTTATGTACAGCCAGTGGAATGGCgg  >  1:1377013/1‑61 (MQ=255) cGTCAGTCGGTGAGGTGAATGGCGATCGCGGCAACTTTATGTACAGCCAGTGGAATGGCgg  >  1:1048249/1‑61 (MQ=255) cGTCAGTCGGTGAGGTGAATGGCGATCGCGGCAACTTTATGTACAGCCAGTGGAATGGCgg  >  1:1073045/1‑61 (MQ=255) cGTCAGTCGGTGAGGTGAATGGCGATCGCGGCAACTTTATGTACAGCCAGTGGAATGGCgg  >  1:108943/1‑61 (MQ=255) cGTCAGTCGGTGAGGTGAATGGCGATCGCGGCAACTTTATGTACAGCCAGTGGAATGGCgg  >  1:1093808/1‑61 (MQ=255) cGTCAGTCGGTGAGGTGAATGGCGATCGCGGCAACTTTATGTACAGCCAGTGGAATGGCgg  >  1:1173125/1‑61 (MQ=255) cGTCAGTCGGTGAGGTGAATGGCGATCGCGGCAACTTTATGTACAGCCAGTGGAATGGCgg  >  1:1257581/1‑61 (MQ=255) cGTCAGTCGGTGAGGTGAATGGCGATCGCGGCAACTTTATGTACAGCCAGTGGAATGGCgg  >  1:1309281/1‑61 (MQ=255) cGTCAGTCGGTGAGGTGAATGGCGATCGCGGCAACTTTATGTACAGCCAGTGGAATGGCgg  >  1:1310323/1‑61 (MQ=255) cGTCAGTCGGTGAGGTGAATGGCGATCGCGGCAACTTTATGTACAGCCAGTGGAATGGCgg  >  1:1310564/1‑61 (MQ=255) cGTCAGTCGGTGAGGTGAATGGCGATCGCGGCAACTTTATGTACAGCCAGTGGAATGGCgg  >  1:1318765/1‑61 (MQ=255) cGTCAGTCGGTGAGGTGAATGGCGATCGCGGCAACTTTATGTACAGCCAGTGGAATGGCgg  >  1:1323508/1‑61 (MQ=255) cGTCAGTCGGTGAGGTGAATGGCGATCGCGGCAACTTTATGTACAGCCAGTGGAATGGCgg  >  1:1344727/1‑61 (MQ=255) cGTCAGTCGGTGAGGTGAATGGCGATCGCGGCAACTTTATGTACAGCCAGTGGAATGGCgg  >  1:1349358/1‑61 (MQ=255) cGTCAGTCGGTGAGGTGAATGGCGATCGCGGCAACTTTATGTACAGCCAGTGGAATGGCgg  >  1:1018770/1‑61 (MQ=255) cGTCAGTCGGTGAGGTGAATGGCGATCGCGGCAACTTTATGTACAGCCAGTGGAATGGCgg  >  1:1395794/1‑61 (MQ=255) cGTCAGTCGGTGAGGTGAATGGCGATCGCGGCAACTTTATGTACAGCCAGTGGAATGGCgg  >  1:1408849/1‑61 (MQ=255) cGTCAGTCGGTGAGGTGAATGGCGATCGCGGCAACTTTATGTACAGCCAGTGGAATGGCgg  >  1:1416850/1‑61 (MQ=255) cGTCAGTCGGTGAGGTGAATGGCGATCGCGGCAACTTTATGTACAGCCAGTGGAATGGCgg  >  1:1449407/1‑61 (MQ=255) cGTCAGTCGGTGAGGTGAATGGCGATCGCGGCAACTTTATGTACAGCCAGTGGAATGGCgg  >  1:154425/1‑61 (MQ=255) cGTCAGTCGGTGAGGTGAATGGCGATCGCGGCAACTTTATGTACAGCCAGTGGAATGGCgg  >  1:21907/1‑61 (MQ=255) cGTCAGTCGGTGAGGTGAATGGCGATCGCGGCAACTTTATGTACAGCCAGTGGAATGGCgg  >  1:251914/1‑61 (MQ=255) cGTCAGTCGGTGAGGTGAATGGCGATCGCGGCAACTTTATGTACAGCCAGTGGAATGGCgg  >  1:286679/1‑61 (MQ=255) cGTCAGTCGGTGAGGTGAATGGCGATCGCGGCAACTTTATGTACAGCCAGTGGAATGGCgg  >  1:306567/1‑61 (MQ=255) cGTCAGTCGGTGAGGTGAATGGCGATCGCGGCAACTTTATGTACAGCCAGTGGAATGGCgg  >  1:319516/1‑61 (MQ=255) cGTCAGTCGGTGAGGTGAATGGCGATCGCGGCAACTTTATGTACAGCCAGTGGAATGGCgg  >  1:321378/1‑61 (MQ=255) cGTCAGTCGGTGAGGTGAATGGCGATCGCGGCAACTTTATGTACAGCCAGTGGAATGGCgg  >  1:347534/1‑61 (MQ=255) cGTCAGTCGGTGAGGTGAATGGCGATCGCGGCAACTTTATGTACAGCCAGTGGAATGGCgg  >  1:438368/1‑61 (MQ=255) cGTCAGTCGGTGAGGTGAATGGCGATCGCGGCAACTTTATGTACAGCCAGTCGAATGGCgg  >  1:831663/1‑61 (MQ=255)                                                             | CGTCAGTCGGTGAGGTGAATGGCGATCGCGGCAACTTTATGTACAGCCAGTGGAATGGCGG  >  W3110S.gb/3089373‑3089433

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑