Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3115576	3115589	14	16 [0]	[0] 84	yghJ	predicted inner membrane lipoprotein

ATCGACAGACCTGCGGCATCCAACAGACGCACAAAACCAGACGCGCTCTCTTCCTTAAGATT  >  W3110S.gb/3115514‑3115575                                                              | aTCGACAGACCTGCGGCATCCAACAGCCGCACAAAACCAGACGCGCTCTCTTCCTTAAGAtt  >  1:1377628/1‑62 (MQ=255) aTCGACAGACCTGCGGCATCCAACAGACGCACAAAACCAGACGCGCTCTCTTCCTTAAGAtt  >  1:1035106/1‑62 (MQ=255) aTCGACAGACCTGCGGCATCCAACAGACGCACAAAACCAGACGCGCTCTCTTCCTTAAGAtt  >  1:1087592/1‑62 (MQ=255) aTCGACAGACCTGCGGCATCCAACAGACGCACAAAACCAGACGCGCTCTCTTCCTTAAGAtt  >  1:1407227/1‑62 (MQ=255) aTCGACAGACCTGCGGCATCCAACAGACGCACAAAACCAGACGCGCTCTCTTCCTTAAGAtt  >  1:1419823/1‑62 (MQ=255) aTCGACAGACCTGCGGCATCCAACAGACGCACAAAACCAGACGCGCTCTCTTCCTTAAGAtt  >  1:156114/1‑62 (MQ=255) aTCGACAGACCTGCGGCATCCAACAGACGCACAAAACCAGACGCGCTCTCTTCCTTAAGAtt  >  1:258399/1‑62 (MQ=255) aTCGACAGACCTGCGGCATCCAACAGACGCACAAAACCAGACGCGCTCTCTTCCTTAAGAtt  >  1:294870/1‑62 (MQ=255) aTCGACAGACCTGCGGCATCCAACAGACGCACAAAACCAGACGCGCTCTCTTCCTTAAGAtt  >  1:389703/1‑62 (MQ=255) aTCGACAGACCTGCGGCATCCAACAGACGCACAAAACCAGACGCGCTCTCTTCCTTAAGAtt  >  1:415136/1‑62 (MQ=255) aTCGACAGACCTGCGGCATCCAACAGACGCACAAAACCAGACGCGCTCTCTTCCTTAAGAtt  >  1:583905/1‑62 (MQ=255) aTCGACAGACCTGCGGCATCCAACAGACGCACAAAACCAGACGCGCTCTCTTCCTTAAGAtt  >  1:700477/1‑62 (MQ=255) aTCGACAGACCTGCGGCATCCAACAGACGCACAAAACCAGACGCGCTCTCTTCCTTAAGAtt  >  1:714008/1‑62 (MQ=255) aTCGACAGACCTGCGGCATCCAACAGACGCACAAAACCAGACGCGCTCTCTTCCTTAAGAtt  >  1:733806/1‑62 (MQ=255) aTCGACAGACCTGCGGCATCCAACAGACGCACAAAACCAGACGCGCTCTCTTCCTTAAGAtt  >  1:79491/1‑62 (MQ=255) aTCGACAGACCTGCGGCATCCAACAGACGCACAAAACCAGACGCGCTCTCTTCCTTAAGAtt  >  1:800825/1‑62 (MQ=255)                                                              | ATCGACAGACCTGCGGCATCCAACAGACGCACAAAACCAGACGCGCTCTCTTCCTTAAGATT  >  W3110S.gb/3115514‑3115575

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑