Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3187535	3187605	71	34 [0]	[3] 4	yqiG	predicted outer membrane usher protein

ATTATCAGAATGAAAAAGAGAGTTATATTGTCACGTTTAACCAGTATCTTGAATCATTAAGG  >  W3110S.gb/3187473‑3187534                                                              | aTTATCAGAATGAAAAAGAGAGTTATATTGTCACGTTTAACCAGTATCTTGAATCATTAAgg  <  1:51344/62‑1 (MQ=255) aTTATCAGAATGAAAAAGAGAGTTATATTGTCACGTTTAACCAGTATCTTGAATCATTAAgg  <  1:161264/62‑1 (MQ=255) aTTATCAGAATGAAAAAGAGAGTTATATTGTCACGTTTAACCAGTATCTTGAATCATTAAgg  <  1:176971/62‑1 (MQ=255) aTTATCAGAATGAAAAAGAGAGTTATATTGTCACGTTTAACCAGTATCTTGAATCATTAAgg  <  1:239548/62‑1 (MQ=255) aTTATCAGAATGAAAAAGAGAGTTATATTGTCACGTTTAACCAGTATCTTGAATCATTAAgg  <  1:334086/62‑1 (MQ=255) aTTATCAGAATGAAAAAGAGAGTTATATTGTCACGTTTAACCAGTATCTTGAATCATTAAgg  <  1:355373/62‑1 (MQ=255) aTTATCAGAATGAAAAAGAGAGTTATATTGTCACGTTTAACCAGTATCTTGAATCATTAAgg  <  1:356605/62‑1 (MQ=255) aTTATCAGAATGAAAAAGAGAGTTATATTGTCACGTTTAACCAGTATCTTGAATCATTAAgg  <  1:377977/62‑1 (MQ=255) aTTATCAGAATGAAAAAGAGAGTTATATTGTCACGTTTAACCAGTATCTTGAATCATTAAgg  <  1:448097/62‑1 (MQ=255) aTTATCAGAATGAAAAAGAGAGTTATATTGTCACGTTTAACCAGTATCTTGAATCATTAAgg  <  1:15978/62‑1 (MQ=255) aTTATCAGAATGAAAAAGAGAGTTATATTGTCACGTTTAACCAGTATCTTGAATCATTAAgg  <  1:534141/62‑1 (MQ=255) aTTATCAGAATGAAAAAGAGAGTTATATTGTCACGTTTAACCAGTATCTTGAATCATTAAgg  <  1:575743/62‑1 (MQ=255) aTTATCAGAATGAAAAAGAGAGTTATATTGTCACGTTTAACCAGTATCTTGAATCATTAAgg  <  1:75267/62‑1 (MQ=255) aTTATCAGAATGAAAAAGAGAGTTATATTGTCACGTTTAACCAGTATCTTGAATCATTAAgg  <  1:784460/62‑1 (MQ=255) aTTATCAGAATGAAAAAGAGAGTTATATTGTCACGTTTAACCAGTATCTTGAATCATTAAgg  <  1:858797/62‑1 (MQ=255) aTTATCAGAATGAAAAAGAGAGTTATATTGTCACGTTTAACCAGTATCTTGAATCATTAAgg  <  1:924275/62‑1 (MQ=255) aTTATCAGAATGAAAAAGAGAGTTATATTGTCACGTTTAACCAGTATCTTGAATCATTAAgg  <  1:999278/62‑1 (MQ=255) aTTATCAGAATGAAAAAGAGAGTTATATTGTCACGTTTAACCAGTATCTTGAATCATTAAgg  <  1:1270532/62‑1 (MQ=255) aTTATCAGAATGAAAAAGAGAGTTATATTGTCACGTTTAACCAGTATCTTGAATCATTAAgg  <  1:1099788/62‑1 (MQ=255) aTTATCAGAATGAAAAAGAGAGTTATATTGTCACGTTTAACCAGTATCTTGAATCATTAAgg  <  1:1141847/62‑1 (MQ=255) aTTATCAGAATGAAAAAGAGAGTTATATTGTCACGTTTAACCAGTATCTTGAATCATTAAgg  <  1:1153415/62‑1 (MQ=255) aTTATCAGAATGAAAAAGAGAGTTATATTGTCACGTTTAACCAGTATCTTGAATCATTAAgg  <  1:115359/62‑1 (MQ=255) aTTATCAGAATGAAAAAGAGAGTTATATTGTCACGTTTAACCAGTATCTTGAATCATTAAgg  <  1:116320/62‑1 (MQ=255) aTTATCAGAATGAAAAAGAGAGTTATATTGTCACGTTTAACCAGTATCTTGAATCATTAAgg  <  1:1170945/62‑1 (MQ=255) aTTATCAGAATGAAAAAGAGAGTTATATTGTCACGTTTAACCAGTATCTTGAATCATTAAgg  <  1:1196202/62‑1 (MQ=255) aTTATCAGAATGAAAAAGAGAGTTATATTGTCACGTTTAACCAGTATCTTGAATCATTAAgg  <  1:1246595/62‑1 (MQ=255) aTTATCAGAATGAAAAAGAGAGTTATATTGTCACGTTTAACCAGTATCTTGAATCATTAAgg  <  1:1093213/62‑1 (MQ=255) aTTATCAGAATGAAAAAGAGAGTTATATTGTCACGTTTAACCAGTATCTTGAATCATTAAgg  <  1:1325137/62‑1 (MQ=255) aTTATCAGAATGAAAAAGAGAGTTATATTGTCACGTTTAACCAGTATCTTGAATCATTAAgg  <  1:13260/62‑1 (MQ=255) aTTATCAGAATGAAAAAGAGAGTTATATTGTCACGTTTAACCAGTATCTTGAATCATTAAgg  <  1:1345261/62‑1 (MQ=255) aTTATCAGAATGAAAAAGAGAGTTATATTGTCACGTTTAACCAGTATCTTGAATCATTAAgg  <  1:1354816/62‑1 (MQ=255) aTTATCAGAATGAAAAAGAGAGTTATATTGTCACGTTTAACCAGTATCTTGAATCATTAAgg  <  1:1381179/62‑1 (MQ=255) aTTATCAGAATGAAAAAGAGAGTTATATTGTCACGTTTAACCAGTATCTTGAATCATTAAgg  <  1:1456587/62‑1 (MQ=255) aTTATCAGAATGAAAAAGAGAGTTATATTGTCACGTTTAACCAGTATCTTGAATCATTAAgg  <  1:1461857/62‑1 (MQ=255)                                                              | ATTATCAGAATGAAAAAGAGAGTTATATTGTCACGTTTAACCAGTATCTTGAATCATTAAGG  >  W3110S.gb/3187473‑3187534

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑