Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3213140	3213415	276	20 [0]	[0] 29	rpoD	RNA polymerase, sigma 70 (sigma D) factor

CCATCAACAAGCTCAACCGTATTTCTCGCCAGATGCTGCAAGAGATGGGCCGTGAACCGACG  >  W3110S.gb/3213078‑3213139                                                              | ccATCAACAAGCTCAACCGTATTTCTCGCCAGATGCTGCAAGAGATGGGTCGTGAACCGACg  <  1:739891/62‑1 (MQ=255) ccATCAACAAGCTCAACCGTATTTCTCGCCAGATGCTGCAAGAGATGGGCCGTGAACCGACg  <  1:265120/62‑1 (MQ=255) ccATCAACAAGCTCAACCGTATTTCTCGCCAGATGCTGCAAGAGATGGGCCGTGAACCGACg  <  1:884166/62‑1 (MQ=255) ccATCAACAAGCTCAACCGTATTTCTCGCCAGATGCTGCAAGAGATGGGCCGTGAACCGACg  <  1:797257/62‑1 (MQ=255) ccATCAACAAGCTCAACCGTATTTCTCGCCAGATGCTGCAAGAGATGGGCCGTGAACCGACg  <  1:631458/62‑1 (MQ=255) ccATCAACAAGCTCAACCGTATTTCTCGCCAGATGCTGCAAGAGATGGGCCGTGAACCGACg  <  1:480874/62‑1 (MQ=255) ccATCAACAAGCTCAACCGTATTTCTCGCCAGATGCTGCAAGAGATGGGCCGTGAACCGACg  <  1:311809/62‑1 (MQ=255) ccATCAACAAGCTCAACCGTATTTCTCGCCAGATGCTGCAAGAGATGGGCCGTGAACCGACg  <  1:271783/62‑1 (MQ=255) ccATCAACAAGCTCAACCGTATTTCTCGCCAGATGCTGCAAGAGATGGGCCGTGAACCGACg  <  1:267389/62‑1 (MQ=255) ccATCAACAAGCTCAACCGTATTTCTCGCCAGATGCTGCAAGAGATGGGCCGTGAACCGACg  <  1:188946/62‑1 (MQ=255) ccATCAACAAGCTCAACCGTATTTCTCGCCAGATGCTGCAAGAGATGGGCCGTGAACCGACg  <  1:18800/62‑1 (MQ=255) ccATCAACAAGCTCAACCGTATTTCTCGCCAGATGCTGCAAGAGATGGGCCGTGAACCGACg  <  1:163577/62‑1 (MQ=255) ccATCAACAAGCTCAACCGTATTTCTCGCCAGATGCTGCAAGAGATGGGCCGTGAACCGACg  <  1:1471288/62‑1 (MQ=255) ccATCAACAAGCTCAACCGTATTTCTCGCCAGATGCTGCAAGAGATGGGCCGTGAACCGACg  <  1:1353285/62‑1 (MQ=255) ccATCAACAAGCTCAACCGTATTTCTCGCCAGATGCTGCAAGAGATGGGCCGTGAACCGACg  <  1:1318230/62‑1 (MQ=255) ccATCAACAAGCTCAACCGTATTTCTCGCCAGATGCTGCAAGAGATGGGCCGTGAACCGACg  <  1:126989/62‑1 (MQ=255) ccATCAACAAGCTCAACCGTATTTCTCGCCAGATGCTGCAAGAGATGGGCCGTGAACCGACg  <  1:1146005/62‑1 (MQ=255) ccATCAACAAGCTCAACCGTATTTCTCGCCAGATGCTGCAAGAGATGGGCCGTGAACCGACg  <  1:1133605/62‑1 (MQ=255)  cATCAACAAGCTCAACCGTATTTCTCGCCAGATGCTGCAAGAGATGGGCCGTGAACCGACg  <  1:1101085/61‑1 (MQ=255)     caacaaGCTCAACCGTATTTCTCGCCAGATGCTGCAAGAGATGGGCCGTGAACCGACg  <  1:522442/58‑1 (MQ=255)                                                              | CCATCAACAAGCTCAACCGTATTTCTCGCCAGATGCTGCAAGAGATGGGCCGTGAACCGACG  >  W3110S.gb/3213078‑3213139

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑