Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3227127	3227535	409	10 [0]	[0] 13	[ygjJ]	[ygjJ]

AAATACGATCGCTATGACGACAAATACACCTATCCGGCAATGATGAACGGTTACATCCAGT  >  W3110S.gb/3227066‑3227126                                                             | aaaTACGATCGCTATGACGACAAATACACCTATCCGGCAATGATGAACGGTTACATCCAGt  <  1:1159207/61‑1 (MQ=255) aaaTACGATCGCTATGACGACAAATACACCTATCCGGCAATGATGAACGGTTACATCCAGt  <  1:1212433/61‑1 (MQ=255) aaaTACGATCGCTATGACGACAAATACACCTATCCGGCAATGATGAACGGTTACATCCAGt  <  1:137284/61‑1 (MQ=255) aaaTACGATCGCTATGACGACAAATACACCTATCCGGCAATGATGAACGGTTACATCCAGt  <  1:1410179/61‑1 (MQ=255) aaaTACGATCGCTATGACGACAAATACACCTATCCGGCAATGATGAACGGTTACATCCAGt  <  1:529772/61‑1 (MQ=255) aaaTACGATCGCTATGACGACAAATACACCTATCCGGCAATGATGAACGGTTACATCCAGt  <  1:56564/61‑1 (MQ=255) aaaTACGATCGCTATGACGACAAATACACCTATCCGGCAATGATGAACGGTTACATCCAGt  <  1:938003/61‑1 (MQ=255)  aaTACGATCGCTATGACGACAAATACACCTATCCGGCAATGATGAACGGTTACATCCAGt  <  1:205997/60‑1 (MQ=255)  aaTACGATCGCTATGACGACAAATACACCTATCCGGCAATGATGAACGGTTACATCCAGt  <  1:759429/60‑1 (MQ=255)   aTACGATCGCTATGACGACAAATACACCTATCCGGCAATGATGAACGGTTACATCCAGt  <  1:1419858/59‑1 (MQ=255)                                                             | AAATACGATCGCTATGACGACAAATACACCTATCCGGCAATGATGAACGGTTACATCCAGT  >  W3110S.gb/3227066‑3227126

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑