Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3237577	3237636	60	31 [0]	[0] 68	alx	predicted inner membrane protein, part of terminus

GTCTTTGTCTGGCTGATGTTGTTCAGCTATTTCTCTGTTCCGGCGGCATTACAACGCCGCGT  >  W3110S.gb/3237515‑3237576                                                              | gTCTTTGTCTGGCTGATGTTGTTCAGCTATTTCTCTGTTCCGGCGGCATTACAACGCCGCGt  <  1:279139/62‑1 (MQ=255) gTCTTTGTCTGGCTGATGTTGTTCAGCTATTTCTCTGTTCCGGCGGCATTACAACGCCGCGt  <  1:960392/62‑1 (MQ=255) gTCTTTGTCTGGCTGATGTTGTTCAGCTATTTCTCTGTTCCGGCGGCATTACAACGCCGCGt  <  1:955021/62‑1 (MQ=255) gTCTTTGTCTGGCTGATGTTGTTCAGCTATTTCTCTGTTCCGGCGGCATTACAACGCCGCGt  <  1:865794/62‑1 (MQ=255) gTCTTTGTCTGGCTGATGTTGTTCAGCTATTTCTCTGTTCCGGCGGCATTACAACGCCGCGt  <  1:839952/62‑1 (MQ=255) gTCTTTGTCTGGCTGATGTTGTTCAGCTATTTCTCTGTTCCGGCGGCATTACAACGCCGCGt  <  1:829393/62‑1 (MQ=255) gTCTTTGTCTGGCTGATGTTGTTCAGCTATTTCTCTGTTCCGGCGGCATTACAACGCCGCGt  <  1:770887/62‑1 (MQ=255) gTCTTTGTCTGGCTGATGTTGTTCAGCTATTTCTCTGTTCCGGCGGCATTACAACGCCGCGt  <  1:625222/62‑1 (MQ=255) gTCTTTGTCTGGCTGATGTTGTTCAGCTATTTCTCTGTTCCGGCGGCATTACAACGCCGCGt  <  1:492374/62‑1 (MQ=255) gTCTTTGTCTGGCTGATGTTGTTCAGCTATTTCTCTGTTCCGGCGGCATTACAACGCCGCGt  <  1:376752/62‑1 (MQ=255) gTCTTTGTCTGGCTGATGTTGTTCAGCTATTTCTCTGTTCCGGCGGCATTACAACGCCGCGt  <  1:37124/62‑1 (MQ=255) gTCTTTGTCTGGCTGATGTTGTTCAGCTATTTCTCTGTTCCGGCGGCATTACAACGCCGCGt  <  1:356314/62‑1 (MQ=255) gTCTTTGTCTGGCTGATGTTGTTCAGCTATTTCTCTGTTCCGGCGGCATTACAACGCCGCGt  <  1:299815/62‑1 (MQ=255) gTCTTTGTCTGGCTGATGTTGTTCAGCTATTTCTCTGTTCCGGCGGCATTACAACGCCGCGt  <  1:298779/62‑1 (MQ=255) gTCTTTGTCTGGCTGATGTTGTTCAGCTATTTCTCTGTTCCGGCGGCATTACAACGCCGCGt  <  1:1068019/62‑1 (MQ=255) gTCTTTGTCTGGCTGATGTTGTTCAGCTATTTCTCTGTTCCGGCGGCATTACAACGCCGCGt  <  1:243259/62‑1 (MQ=255) gTCTTTGTCTGGCTGATGTTGTTCAGCTATTTCTCTGTTCCGGCGGCATTACAACGCCGCGt  <  1:199212/62‑1 (MQ=255) gTCTTTGTCTGGCTGATGTTGTTCAGCTATTTCTCTGTTCCGGCGGCATTACAACGCCGCGt  <  1:164865/62‑1 (MQ=255) gTCTTTGTCTGGCTGATGTTGTTCAGCTATTTCTCTGTTCCGGCGGCATTACAACGCCGCGt  <  1:1445634/62‑1 (MQ=255) gTCTTTGTCTGGCTGATGTTGTTCAGCTATTTCTCTGTTCCGGCGGCATTACAACGCCGCGt  <  1:1423152/62‑1 (MQ=255) gTCTTTGTCTGGCTGATGTTGTTCAGCTATTTCTCTGTTCCGGCGGCATTACAACGCCGCGt  <  1:1264615/62‑1 (MQ=255) gTCTTTGTCTGGCTGATGTTGTTCAGCTATTTCTCTGTTCCGGCGGCATTACAACGCCGCGt  <  1:1263246/62‑1 (MQ=255) gTCTTTGTCTGGCTGATGTTGTTCAGCTATTTCTCTGTTCCGGCGGCATTACAACGCCGCGt  <  1:119197/62‑1 (MQ=255) gTCTTTGTCTGGCTGATGTTGTTCAGCTATTTCTCTGTTCCGGCGGCATTACAACGCCGCGt  <  1:118091/62‑1 (MQ=255) gTCTTTGTCTGGCTGATGTTGTTCAGCTATTTCTCTGTTCCGGCGGCATTACAACGCCGCGt  <  1:1177940/62‑1 (MQ=255) gTCTTTGTCTGGCTGATGTTGTTCAGCTATTTCTCTGTTCCGGCGGCATTACAACGCCGCGt  <  1:1133074/62‑1 (MQ=255) gTCTTTGTCTGGCTGATGTTGTTCAGCTATTTCTCTGTTCCGGCGGCATTACAACGCCGCGt  <  1:1120662/62‑1 (MQ=255)  tCTTTGTCTGGCTGATGTTGTTCAGCTATTTCTCTGTTCCGGCGGCATTACAACGCCGCGt  <  1:370873/61‑1 (MQ=255)  tCTTTGTCTGGCTGATGTTGTTCAGCTATTTCTCTGTTCCGGCGGCATTACAACGCCGCGt  <  1:1281285/61‑1 (MQ=255)    tttGTCTGGCTGATGTTGTTCAGCTATTTCTCTGTTCCGGCGGCATTACAACGCCGCGt  <  1:1172819/59‑1 (MQ=255)                  gttgttCAGCTATTTCTCTGTTCCGGCGGCATTACAACGCCGCGt  <  1:885827/45‑1 (MQ=255)                                                              | GTCTTTGTCTGGCTGATGTTGTTCAGCTATTTCTCTGTTCCGGCGGCATTACAACGCCGCGT  >  W3110S.gb/3237515‑3237576

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑