Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3238089	3238140	52	22 [0]	[0] 22	alx	predicted inner membrane protein, part of terminus

GCTCAAATATGGCCTGGCGGTGATTCTGGTGTTTATCGGTATCAAGATGCTGATTGTCGACT  >  W3110S.gb/3238027‑3238088                                                              | gCTCAAATATGGCCTGGCGGTGATTCTGGTGTTTATCGGTATCAAGATGCTTATTGTCGACt  <  1:629185/62‑1 (MQ=255) gCTCAAATATGGCCTGGCGGTGATTCTGGTGTTTATCGGTATCAAGATGCTGATTGTCGACt  <  1:1358755/62‑1 (MQ=255) gCTCAAATATGGCCTGGCGGTGATTCTGGTGTTTATCGGTATCAAGATGCTGATTGTCGACt  <  1:716656/62‑1 (MQ=255) gCTCAAATATGGCCTGGCGGTGATTCTGGTGTTTATCGGTATCAAGATGCTGATTGTCGACt  <  1:654339/62‑1 (MQ=255) gCTCAAATATGGCCTGGCGGTGATTCTGGTGTTTATCGGTATCAAGATGCTGATTGTCGACt  <  1:550475/62‑1 (MQ=255) gCTCAAATATGGCCTGGCGGTGATTCTGGTGTTTATCGGTATCAAGATGCTGATTGTCGACt  <  1:369792/62‑1 (MQ=255) gCTCAAATATGGCCTGGCGGTGATTCTGGTGTTTATCGGTATCAAGATGCTGATTGTCGACt  <  1:368671/62‑1 (MQ=255) gCTCAAATATGGCCTGGCGGTGATTCTGGTGTTTATCGGTATCAAGATGCTGATTGTCGACt  <  1:341692/62‑1 (MQ=255) gCTCAAATATGGCCTGGCGGTGATTCTGGTGTTTATCGGTATCAAGATGCTGATTGTCGACt  <  1:1006759/62‑1 (MQ=255) gCTCAAATATGGCCTGGCGGTGATTCTGGTGTTTATCGGTATCAAGATGCTGATTGTCGACt  <  1:1378160/62‑1 (MQ=255) gCTCAAATATGGCCTGGCGGTGATTCTGGTGTTTATCGGTATCAAGATGCTGATTGTCGACt  <  1:1297735/62‑1 (MQ=255) gCTCAAATATGGCCTGGCGGTGATTCTGGTGTTTATCGGTATCAAGATGCTGATTGTCGACt  <  1:124479/62‑1 (MQ=255) gCTCAAATATGGCCTGGCGGTGATTCTGGTGTTTATCGGTATCAAGATGCTGATTGTCGACt  <  1:1218504/62‑1 (MQ=255) gCTCAAATATGGCCTGGCGGTGATTCTGGTGTTTATCGGTATCAAGATGCTGATTGTCGACt  <  1:1131429/62‑1 (MQ=255) gCTCAAATATGGCCTGGCGGTGATTCTGGTGTTTATCGGTATCAAGATGCTGATTGTCGACt  <  1:840673/62‑1 (MQ=255) gCTCAAATATGGCCTGGCGGTGATTCTGGTGTTTATCGGTATCAAGATGCTGATTGTCGACt  <  1:1099682/62‑1 (MQ=255) gCTCAAATATGGCCTGGCGGTGATTCTGGTGTTTATCGGTATCAAGATGCTGATTGTCGACt  <  1:107623/62‑1 (MQ=255) gCTCAAATATGGCCTGGCGGTGATTCTGGTGTTTATCGGTATCAAGATGCTGATTGTCGACt  <  1:879123/62‑1 (MQ=255)  cTCAAATATGGCCTGGCGGTGATTCTGGTGTTTATCGGTATCAAGATGCTGATTGTCGACt  <  1:149753/61‑1 (MQ=255)  cTCAAATATGGCCTGGCGGTGATTCTGGTGTTTATCGGTATCAAGATGCTGATTGTCGACt  <  1:1111404/61‑1 (MQ=255)  cTCAAATATGGCCTGGCGGTGATTCTGGTGTTTATCGGTATCAAGATGCTGATTGTCGACt  <  1:1014074/61‑1 (MQ=255)                   ggTGATTCTGGGGTTTATCGGTATCAAGATGCTGATTGTCGACt  <  1:773139/44‑1 (MQ=255)                                                              | GCTCAAATATGGCCTGGCGGTGATTCTGGTGTTTATCGGTATCAAGATGCTGATTGTCGACT  >  W3110S.gb/3238027‑3238088

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑