Missing coverage evidence...
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*	*	÷	W3110S.gb	3248909	3248981	73	42 [0]	[0] 15	yqjK	conserved hypothetical protein

AAGTCTGCGCTCCTGGGCGCTGGTTGGCAGTAGCGT  >  W3110S.gb/3248873‑3248908                                    | aaGTCTGCGCTCCTGGGCGCTGGTTGGCAGTAGCGt  >  1:683004/1‑36 (MQ=255) aaGTCTGCGCTCCTGGGCGCTGGTTGGCAGTAGCGt  >  1:338782/1‑36 (MQ=255) aaGTCTGCGCTCCTGGGCGCTGGTTGGCAGTAGCGt  >  1:360994/1‑36 (MQ=255) aaGTCTGCGCTCCTGGGCGCTGGTTGGCAGTAGCGt  >  1:361744/1‑36 (MQ=255) aaGTCTGCGCTCCTGGGCGCTGGTTGGCAGTAGCGt  >  1:387546/1‑36 (MQ=255) aaGTCTGCGCTCCTGGGCGCTGGTTGGCAGTAGCGt  >  1:422025/1‑36 (MQ=255) aaGTCTGCGCTCCTGGGCGCTGGTTGGCAGTAGCGt  >  1:493411/1‑36 (MQ=255) aaGTCTGCGCTCCTGGGCGCTGGTTGGCAGTAGCGt  >  1:51033/1‑36 (MQ=255) aaGTCTGCGCTCCTGGGCGCTGGTTGGCAGTAGCGt  >  1:549754/1‑36 (MQ=255) aaGTCTGCGCTCCTGGGCGCTGGTTGGCAGTAGCGt  >  1:599113/1‑36 (MQ=255) aaGTCTGCGCTCCTGGGCGCTGGTTGGCAGTAGCGt  >  1:602602/1‑36 (MQ=255) aaGTCTGCGCTCCTGGGCGCTGGTTGGCAGTAGCGt  >  1:327431/1‑36 (MQ=255) aaGTCTGCGCTCCTGGGCGCTGGTTGGCAGTAGCGt  >  1:748291/1‑36 (MQ=255) aaGTCTGCGCTCCTGGGCGCTGGTTGGCAGTAGCGt  >  1:803867/1‑36 (MQ=255) aaGTCTGCGCTCCTGGGCGCTGGTTGGCAGTAGCGt  >  1:810492/1‑36 (MQ=255) aaGTCTGCGCTCCTGGGCGCTGGTTGGCAGTAGCGt  >  1:865394/1‑36 (MQ=255) aaGTCTGCGCTCCTGGGCGCTGGTTGGCAGTAGCGt  >  1:894338/1‑36 (MQ=255) aaGTCTGCGCTCCTGGGCGCTGGTTGGCAGTAGCGt  >  1:900844/1‑36 (MQ=255) aaGTCTGCGCTCCTGGGCGCTGGTTGGCAGTAGCGt  >  1:909886/1‑36 (MQ=255) aaGTCTGCGCTCCTGGGCGCTGGTTGGCAGTAGCGt  >  1:980962/1‑36 (MQ=255) aaGTCTGCGCTCCTGGGCGCTGGTTGGCAGTAGCGt  >  1:994673/1‑36 (MQ=255) aaGTCTGCGCTCCTGGGCGCTGGTTGGCAGTAGCGt  >  1:1366114/1‑36 (MQ=255) aaGTCTGCGCTCCTGGGCGCTGGTTGGCAGTAGCGt  >  1:1062164/1‑36 (MQ=255) aaGTCTGCGCTCCTGGGCGCTGGTTGGCAGTAGCGt  >  1:1137598/1‑36 (MQ=255) aaGTCTGCGCTCCTGGGCGCTGGTTGGCAGTAGCGt  >  1:1179313/1‑36 (MQ=255) aaGTCTGCGCTCCTGGGCGCTGGTTGGCAGTAGCGt  >  1:1217820/1‑36 (MQ=255) aaGTCTGCGCTCCTGGGCGCTGGTTGGCAGTAGCGt  >  1:1232788/1‑36 (MQ=255) aaGTCTGCGCTCCTGGGCGCTGGTTGGCAGTAGCGt  >  1:1247316/1‑36 (MQ=255) aaGTCTGCGCTCCTGGGCGCTGGTTGGCAGTAGCGt  >  1:1253196/1‑36 (MQ=255) aaGTCTGCGCTCCTGGGCGCTGGTTGGCAGTAGCGt  >  1:1318360/1‑36 (MQ=255) aaGTCTGCGCTCCTGGGCGCTGGTTGGCAGTAGCGt  >  1:1320093/1‑36 (MQ=255) aaGTCTGCGCTCCTGGGCGCTGGTTGGCAGTAGCGt  >  1:1322141/1‑36 (MQ=255) aaGTCTGCGCTCCTGGGCGCTGGTTGGCAGTAGCGt  >  1:1045150/1‑36 (MQ=255) aaGTCTGCGCTCCTGGGCGCTGGTTGGCAGTAGCGt  >  1:1409769/1‑36 (MQ=255) aaGTCTGCGCTCCTGGGCGCTGGTTGGCAGTAGCGt  >  1:1411530/1‑36 (MQ=255) aaGTCTGCGCTCCTGGGCGCTGGTTGGCAGTAGCGt  >  1:1425757/1‑36 (MQ=255) aaGTCTGCGCTCCTGGGCGCTGGTTGGCAGTAGCGt  >  1:1432068/1‑36 (MQ=255) aaGTCTGCGCTCCTGGGCGCTGGTTGGCAGTAGCGt  >  1:1455441/1‑36 (MQ=255) aaGTCTGCGCTCCTGGGCGCTGGTTGGCAGTAGCGt  >  1:1456565/1‑36 (MQ=255) aaGTCTGCGCTCCTGGGCGCTGGTTGGCAGTAGCGt  >  1:16046/1‑36 (MQ=255) aaGTCTGCGCTCCTGGGCGCTGGTTGGCAGTAGCGt  >  1:271568/1‑36 (MQ=255) aaGTCTGCGCTCCTGGGCGCTGGTTGGCAGTAGCGt  >  1:295258/1‑36 (MQ=255)                                    | AAGTCTGCGCTCCTGGGCGCTGGTTGGCAGTAGCGT  >  W3110S.gb/3248873‑3248908

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑