Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3289183	3289215	33	38 [0]	[0] 49	yraJ	predicted outer membrane protein

TCAGCAACTTAATTTGAGCATTCCCCAAATTGCACTGTACCGTGATGCAAGAGGTTACGTCT  >  W3110S.gb/3289121‑3289182                                                              | tcaGCAACTTGATTTGAGCATTCCCCAAATTGCACTGTACCGTGATGCAAGAGGTTACGtct  >  1:213744/1‑62 (MQ=255) tcaGCAACTTAATTTGAGCTTTCCCCAAATTGCACTGTACCGTGATGCAAGAGGTTACGtct  >  1:564002/1‑62 (MQ=255) tcaGCAACTTAATTTGAGCATTCCCCAAATTGCACTGTACCGTGATGCAAGAGGTTACGtct  >  1:609588/1‑62 (MQ=255) tcaGCAACTTAATTTGAGCATTCCCCAAATTGCACTGTACCGTGATGCAAGAGGTTACGtct  >  1:252720/1‑62 (MQ=255) tcaGCAACTTAATTTGAGCATTCCCCAAATTGCACTGTACCGTGATGCAAGAGGTTACGtct  >  1:371339/1‑62 (MQ=255) tcaGCAACTTAATTTGAGCATTCCCCAAATTGCACTGTACCGTGATGCAAGAGGTTACGtct  >  1:372229/1‑62 (MQ=255) tcaGCAACTTAATTTGAGCATTCCCCAAATTGCACTGTACCGTGATGCAAGAGGTTACGtct  >  1:407313/1‑62 (MQ=255) tcaGCAACTTAATTTGAGCATTCCCCAAATTGCACTGTACCGTGATGCAAGAGGTTACGtct  >  1:49236/1‑62 (MQ=255) tcaGCAACTTAATTTGAGCATTCCCCAAATTGCACTGTACCGTGATGCAAGAGGTTACGtct  >  1:555025/1‑62 (MQ=255) tcaGCAACTTAATTTGAGCATTCCCCAAATTGCACTGTACCGTGATGCAAGAGGTTACGtct  >  1:597103/1‑62 (MQ=255) tcaGCAACTTAATTTGAGCATTCCCCAAATTGCACTGTACCGTGATGCAAGAGGTTACGtct  >  1:249894/1‑62 (MQ=255) tcaGCAACTTAATTTGAGCATTCCCCAAATTGCACTGTACCGTGATGCAAGAGGTTACGtct  >  1:648608/1‑62 (MQ=255) tcaGCAACTTAATTTGAGCATTCCCCAAATTGCACTGTACCGTGATGCAAGAGGTTACGtct  >  1:693160/1‑62 (MQ=255) tcaGCAACTTAATTTGAGCATTCCCCAAATTGCACTGTACCGTGATGCAAGAGGTTACGtct  >  1:705606/1‑62 (MQ=255) tcaGCAACTTAATTTGAGCATTCCCCAAATTGCACTGTACCGTGATGCAAGAGGTTACGtct  >  1:719894/1‑62 (MQ=255) tcaGCAACTTAATTTGAGCATTCCCCAAATTGCACTGTACCGTGATGCAAGAGGTTACGtct  >  1:72932/1‑62 (MQ=255) tcaGCAACTTAATTTGAGCATTCCCCAAATTGCACTGTACCGTGATGCAAGAGGTTACGtct  >  1:739913/1‑62 (MQ=255) tcaGCAACTTAATTTGAGCATTCCCCAAATTGCACTGTACCGTGATGCAAGAGGTTACGtct  >  1:769635/1‑62 (MQ=255) tcaGCAACTTAATTTGAGCATTCCCCAAATTGCACTGTACCGTGATGCAAGAGGTTACGtct  >  1:832962/1‑62 (MQ=255) tcaGCAACTTAATTTGAGCATTCCCCAAATTGCACTGTACCGTGATGCAAGAGGTTACGtct  >  1:995650/1‑62 (MQ=255) tcaGCAACTTAATTTGAGCATTCCCCAAATTGCACTGTACCGTGATGCAAGAGGTTACGtct  >  1:1277631/1‑62 (MQ=255) tcaGCAACTTAATTTGAGCATTCCCCAAATTGCACTGTACCGTGATGCAAGAGGTTACGtct  >  1:1018509/1‑62 (MQ=255) tcaGCAACTTAATTTGAGCATTCCCCAAATTGCACTGTACCGTGATGCAAGAGGTTACGtct  >  1:1040548/1‑62 (MQ=255) tcaGCAACTTAATTTGAGCATTCCCCAAATTGCACTGTACCGTGATGCAAGAGGTTACGtct  >  1:1081911/1‑62 (MQ=255) tcaGCAACTTAATTTGAGCATTCCCCAAATTGCACTGTACCGTGATGCAAGAGGTTACGtct  >  1:1111904/1‑62 (MQ=255) tcaGCAACTTAATTTGAGCATTCCCCAAATTGCACTGTACCGTGATGCAAGAGGTTACGtct  >  1:1135914/1‑62 (MQ=255) tcaGCAACTTAATTTGAGCATTCCCCAAATTGCACTGTACCGTGATGCAAGAGGTTACGtct  >  1:1216761/1‑62 (MQ=255) tcaGCAACTTAATTTGAGCATTCCCCAAATTGCACTGTACCGTGATGCAAGAGGTTACGtct  >  1:1249916/1‑62 (MQ=255) tcaGCAACTTAATTTGAGCATTCCCCAAATTGCACTGTACCGTGATGCAAGAGGTTACGtct  >  1:1000900/1‑62 (MQ=255) tcaGCAACTTAATTTGAGCATTCCCCAAATTGCACTGTACCGTGATGCAAGAGGTTACGtct  >  1:1294634/1‑62 (MQ=255) tcaGCAACTTAATTTGAGCATTCCCCAAATTGCACTGTACCGTGATGCAAGAGGTTACGtct  >  1:1314818/1‑62 (MQ=255) tcaGCAACTTAATTTGAGCATTCCCCAAATTGCACTGTACCGTGATGCAAGAGGTTACGtct  >  1:1342960/1‑62 (MQ=255) tcaGCAACTTAATTTGAGCATTCCCCAAATTGCACTGTACCGTGATGCAAGAGGTTACGtct  >  1:1354504/1‑62 (MQ=255) tcaGCAACTTAATTTGAGCATTCCCCAAATTGCACTGTACCGTGATGCAAGAGGTTACGtct  >  1:1408351/1‑62 (MQ=255) tcaGCAACTTAATTTGAGCATTCCCCAAATTGCACTGTACCGTGATGCAAGAGGTTACGtct  >  1:1432749/1‑62 (MQ=255) tcaGCAACTTAATTTGAGCATTCCCCAAATTGCACTGTACCGTGATGCAAGAGGTTACGtct  >  1:1455768/1‑62 (MQ=255) tcaGCAACTTAATTTGAGCATTCCCCAAATTGCACTGTACCGTGATGCAAGAGGTTACGtct  >  1:220400/1‑62 (MQ=255) tcaGCAACTTAATTTGAGCATTCCCCAAATTGCACTGCACCGTGATGCAAGAGGTTACGtct  >  1:119406/1‑62 (MQ=255)                                                              | TCAGCAACTTAATTTGAGCATTCCCCAAATTGCACTGTACCGTGATGCAAGAGGTTACGTCT  >  W3110S.gb/3289121‑3289182

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑