Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3348516	3348610	95	32 [0]	[0] 54	yrbL	hypothetical protein

TACGCGCATCTTGGTCGCCGGTTAAAAGACTGGAGTGGAATACCGCGCTATCACGGTACCGT  >  W3110S.gb/3348454‑3348515                                                              | tacGCGCATCTTGGTCGCCGGTTAAAAGACTGGAGTGGAATACCGCGCTATCACGGTACCGt  <  1:695179/62‑1 (MQ=255)  acGCGCATCTTGGTCGCCGGTTAAAAGACTGGAGTGGAATACCGCGCTATCACGGTACCGt  <  1:499003/61‑1 (MQ=255)  acGCGCATCTTGGTCGCCGGTTAAAAGACTGGAGTGGAATACCGCGCTATCACGGTACCGt  <  1:950441/61‑1 (MQ=255)  acGCGCATCTTGGTCGCCGGTTAAAAGACTGGAGTGGAATACCGCGCTATCACGGTACCGt  <  1:89641/61‑1 (MQ=255)  acGCGCATCTTGGTCGCCGGTTAAAAGACTGGAGTGGAATACCGCGCTATCACGGTACCGt  <  1:761973/61‑1 (MQ=255)  acGCGCATCTTGGTCGCCGGTTAAAAGACTGGAGTGGAATACCGCGCTATCACGGTACCGt  <  1:760042/61‑1 (MQ=255)  acGCGCATCTTGGTCGCCGGTTAAAAGACTGGAGTGGAATACCGCGCTATCACGGTACCGt  <  1:743723/61‑1 (MQ=255)  acGCGCATCTTGGTCGCCGGTTAAAAGACTGGAGTGGAATACCGCGCTATCACGGTACCGt  <  1:7381/61‑1 (MQ=255)  acGCGCATCTTGGTCGCCGGTTAAAAGACTGGAGTGGAATACCGCGCTATCACGGTACCGt  <  1:728149/61‑1 (MQ=255)  acGCGCATCTTGGTCGCCGGTTAAAAGACTGGAGTGGAATACCGCGCTATCACGGTACCGt  <  1:654966/61‑1 (MQ=255)  acGCGCATCTTGGTCGCCGGTTAAAAGACTGGAGTGGAATACCGCGCTATCACGGTACCGt  <  1:632796/61‑1 (MQ=255)  acGCGCATCTTGGTCGCCGGTTAAAAGACTGGAGTGGAATACCGCGCTATCACGGTACCGt  <  1:613893/61‑1 (MQ=255)  acGCGCATCTTGGTCGCCGGTTAAAAGACTGGAGTGGAATACCGCGCTATCACGGTACCGt  <  1:565214/61‑1 (MQ=255)  acGCGCATCTTGGTCGCCGGTTAAAAGACTGGAGTGGAATACCGCGCTATCACGGTACCGt  <  1:55969/61‑1 (MQ=255)  acGCGCATCTTGGTCGCCGGTTAAAAGACTGGAGTGGAATACCGCGCTATCACGGTACCGt  <  1:526275/61‑1 (MQ=255)  acGCGCATCTTGGTCGCCGGTTAAAAGACTGGAGTGGAATACCGCGCTATCACGGTACCGt  <  1:101713/61‑1 (MQ=255)  acGCGCATCTTGGTCGCCGGTTAAAAGACTGGAGTGGAATACCGCGCTATCACGGTACCGt  <  1:491143/61‑1 (MQ=255)  acGCGCATCTTGGTCGCCGGTTAAAAGACTGGAGTGGAATACCGCGCTATCACGGTACCGt  <  1:449708/61‑1 (MQ=255)  acGCGCATCTTGGTCGCCGGTTAAAAGACTGGAGTGGAATACCGCGCTATCACGGTACCGt  <  1:358575/61‑1 (MQ=255)  acGCGCATCTTGGTCGCCGGTTAAAAGACTGGAGTGGAATACCGCGCTATCACGGTACCGt  <  1:268703/61‑1 (MQ=255)  acGCGCATCTTGGTCGCCGGTTAAAAGACTGGAGTGGAATACCGCGCTATCACGGTACCGt  <  1:22555/61‑1 (MQ=255)  acGCGCATCTTGGTCGCCGGTTAAAAGACTGGAGTGGAATACCGCGCTATCACGGTACCGt  <  1:204773/61‑1 (MQ=255)  acGCGCATCTTGGTCGCCGGTTAAAAGACTGGAGTGGAATACCGCGCTATCACGGTACCGt  <  1:196516/61‑1 (MQ=255)  acGCGCATCTTGGTCGCCGGTTAAAAGACTGGAGTGGAATACCGCGCTATCACGGTACCGt  <  1:18693/61‑1 (MQ=255)  acGCGCATCTTGGTCGCCGGTTAAAAGACTGGAGTGGAATACCGCGCTATCACGGTACCGt  <  1:1468003/61‑1 (MQ=255)  acGCGCATCTTGGTCGCCGGTTAAAAGACTGGAGTGGAATACCGCGCTATCACGGTACCGt  <  1:1466612/61‑1 (MQ=255)  acGCGCATCTTGGTCGCCGGTTAAAAGACTGGAGTGGAATACCGCGCTATCACGGTACCGt  <  1:1303719/61‑1 (MQ=255)  acGCGCATCTTGGTCGCCGGTTAAAAGACTGGAGTGGAATACCGCGCTATCACGGTACCGt  <  1:117086/61‑1 (MQ=255)  acGCGCATCTTGGTCGCCGGTTAAAAGACTGGAGTGGAATACCGCGCTATCACGGTACCGt  <  1:1132710/61‑1 (MQ=255)  acGCGCATCTTGGTCGCCGGTTAAAAGACTGGAGTGGAATACCGCGCTATCACGGTACCGt  <  1:1122129/61‑1 (MQ=255)   cgcgCATCTTGGTCGCCGGTTAAAAGACTGGAGTGGAATACCGCGCTATCACGGTACCGt  <  1:1358863/60‑1 (MQ=255)                         aaaGACTGGAGTGGAATACCGCGCTATCACGGTACCGt  <  1:907657/38‑1 (MQ=255)                                                              | TACGCGCATCTTGGTCGCCGGTTAAAAGACTGGAGTGGAATACCGCGCTATCACGGTACCGT  >  W3110S.gb/3348454‑3348515

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑