Missing coverage evidence...
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*	*	÷	W3110S.gb	3380840	3380954	115	40 [0]	[0] 25	degQ	serine endoprotease, periplasmic

ACGGCCAGTCAGGGACAGAAAATCCCGGAAGAATTCAAAAAGTTTTTTGGTGATGATTTACC  >  W3110S.gb/3380778‑3380839                                                              | aCGGCCAGTCAGGGACATAAAATCCCGGAAGAATTCAAAAAGTTTTTTGGTGATGATTTAcc  <  1:276223/62‑1 (MQ=255) aCGGCCAGTCAGGGACAGAAAATCCCGGAAGAATTCAAAAAGTTTTTTGGTGATGATTTAcc  <  1:613153/62‑1 (MQ=255) aCGGCCAGTCAGGGACAGAAAATCCCGGAAGAATTCAAAAAGTTTTTTGGTGATGATTTAcc  <  1:1029641/62‑1 (MQ=255) aCGGCCAGTCAGGGACAGAAAATCCCGGAAGAATTCAAAAAGTTTTTTGGTGATGATTTAcc  <  1:464887/62‑1 (MQ=255) aCGGCCAGTCAGGGACAGAAAATCCCGGAAGAATTCAAAAAGTTTTTTGGTGATGATTTAcc  <  1:488402/62‑1 (MQ=255) aCGGCCAGTCAGGGACAGAAAATCCCGGAAGAATTCAAAAAGTTTTTTGGTGATGATTTAcc  <  1:488794/62‑1 (MQ=255) aCGGCCAGTCAGGGACAGAAAATCCCGGAAGAATTCAAAAAGTTTTTTGGTGATGATTTAcc  <  1:490130/62‑1 (MQ=255) aCGGCCAGTCAGGGACAGAAAATCCCGGAAGAATTCAAAAAGTTTTTTGGTGATGATTTAcc  <  1:521157/62‑1 (MQ=255) aCGGCCAGTCAGGGACAGAAAATCCCGGAAGAATTCAAAAAGTTTTTTGGTGATGATTTAcc  <  1:566927/62‑1 (MQ=255) aCGGCCAGTCAGGGACAGAAAATCCCGGAAGAATTCAAAAAGTTTTTTGGTGATGATTTAcc  <  1:612884/62‑1 (MQ=255) aCGGCCAGTCAGGGACAGAAAATCCCGGAAGAATTCAAAAAGTTTTTTGGTGATGATTTAcc  <  1:393190/62‑1 (MQ=255) aCGGCCAGTCAGGGACAGAAAATCCCGGAAGAATTCAAAAAGTTTTTTGGTGATGATTTAcc  <  1:636052/62‑1 (MQ=255) aCGGCCAGTCAGGGACAGAAAATCCCGGAAGAATTCAAAAAGTTTTTTGGTGATGATTTAcc  <  1:68823/62‑1 (MQ=255) aCGGCCAGTCAGGGACAGAAAATCCCGGAAGAATTCAAAAAGTTTTTTGGTGATGATTTAcc  <  1:707200/62‑1 (MQ=255) aCGGCCAGTCAGGGACAGAAAATCCCGGAAGAATTCAAAAAGTTTTTTGGTGATGATTTAcc  <  1:759719/62‑1 (MQ=255) aCGGCCAGTCAGGGACAGAAAATCCCGGAAGAATTCAAAAAGTTTTTTGGTGATGATTTAcc  <  1:788470/62‑1 (MQ=255) aCGGCCAGTCAGGGACAGAAAATCCCGGAAGAATTCAAAAAGTTTTTTGGTGATGATTTAcc  <  1:900914/62‑1 (MQ=255) aCGGCCAGTCAGGGACAGAAAATCCCGGAAGAATTCAAAAAGTTTTTTGGTGATGATTTAcc  <  1:930607/62‑1 (MQ=255) aCGGCCAGTCAGGGACAGAAAATCCCGGAAGAATTCAAAAAGTTTTTTGGTGATGATTTAcc  <  1:952880/62‑1 (MQ=255) aCGGCCAGTCAGGGACAGAAAATCCCGGAAGAATTCAAAAAGTTTTTTGGTGATGATTTAcc  <  1:972824/62‑1 (MQ=255) aCGGCCAGTCAGGGACAGAAAATCCCGGAAGAATTCAAAAAGTTTTTTGGTGATGATTTAcc  <  1:139224/62‑1 (MQ=255) aCGGCCAGTCAGGGACAGAAAATCCCGGAAGAATTCAAAAAGTTTTTTGGTGATGATTTAcc  <  1:1081039/62‑1 (MQ=255) aCGGCCAGTCAGGGACAGAAAATCCCGGAAGAATTCAAAAAGTTTTTTGGTGATGATTTAcc  <  1:1083682/62‑1 (MQ=255) aCGGCCAGTCAGGGACAGAAAATCCCGGAAGAATTCAAAAAGTTTTTTGGTGATGATTTAcc  <  1:1151585/62‑1 (MQ=255) aCGGCCAGTCAGGGACAGAAAATCCCGGAAGAATTCAAAAAGTTTTTTGGTGATGATTTAcc  <  1:122501/62‑1 (MQ=255) aCGGCCAGTCAGGGACAGAAAATCCCGGAAGAATTCAAAAAGTTTTTTGGTGATGATTTAcc  <  1:1260237/62‑1 (MQ=255) aCGGCCAGTCAGGGACAGAAAATCCCGGAAGAATTCAAAAAGTTTTTTGGTGATGATTTAcc  <  1:1292395/62‑1 (MQ=255) aCGGCCAGTCAGGGACAGAAAATCCCGGAAGAATTCAAAAAGTTTTTTGGTGATGATTTAcc  <  1:1320270/62‑1 (MQ=255) aCGGCCAGTCAGGGACAGAAAATCCCGGAAGAATTCAAAAAGTTTTTTGGTGATGATTTAcc  <  1:1384217/62‑1 (MQ=255) aCGGCCAGTCAGGGACAGAAAATCCCGGAAGAATTCAAAAAGTTTTTTGGTGATGATTTAcc  <  1:1385925/62‑1 (MQ=255) aCGGCCAGTCAGGGACAGAAAATCCCGGAAGAATTCAAAAAGTTTTTTGGTGATGATTTAcc  <  1:364639/62‑1 (MQ=255) aCGGCCAGTCAGGGACAGAAAATCCCGGAAGAATTCAAAAAGTTTTTTGGTGATGATTTAcc  <  1:1415314/62‑1 (MQ=255) aCGGCCAGTCAGGGACAGAAAATCCCGGAAGAATTCAAAAAGTTTTTTGGTGATGATTTAcc  <  1:1424037/62‑1 (MQ=255) aCGGCCAGTCAGGGACAGAAAATCCCGGAAGAATTCAAAAAGTTTTTTGGTGATGATTTAcc  <  1:158156/62‑1 (MQ=255) aCGGCCAGTCAGGGACAGAAAATCCCGGAAGAATTCAAAAAGTTTTTTGGTGATGATTTAcc  <  1:225579/62‑1 (MQ=255) aCGGCCAGTCAGGGACAGAAAATCCCGGAAGAATTCAAAAAGTTTTTTGGTGATGATTTAcc  <  1:258861/62‑1 (MQ=255) aCGGCCAGTCAGGGACAGAAAATCCCGGAAGAATTCAAAAAGTTTTTTGGTGATGATTTAcc  <  1:268566/62‑1 (MQ=255) aCGGCCAGTCAGGGACAGAAAATCCCGGAAGAATTCAAAAAGTTTTTTGGTGATGATTTAcc  <  1:271370/62‑1 (MQ=255)  cGGCCAGTCAGGGACAGAAAATCCCGGAAGAATTCAAAAAGTTTTTTGGTGATGATTTAcc  <  1:483974/61‑1 (MQ=255)                cAGAAAATCCCGGAAGAATTCAAAAAGTTTTTTGGTGATGATTTAcc  <  1:515704/47‑1 (MQ=255)                                                              | ACGGCCAGTCAGGGACAGAAAATCCCGGAAGAATTCAAAAAGTTTTTTGGTGATGATTTACC  >  W3110S.gb/3380778‑3380839

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑