Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3393336	3393682	347	79 [0]	[0] 6	yhdP	conserved membrane protein, predicted transporter

AGCGTGGCGTTGATTTCACGCCCTTGCGCTTCAACCAGGGTGCCATTTGCCGTCGGTTGCGA  >  W3110S.gb/3393274‑3393335                                                              | aGCGTGGCGTTTATTTCACGCCCTTGCGCTTCAACCAGGGTGCCATTTGCCGTCGGTTGCGa  <  1:146549/62‑1 (MQ=255) aGCGTGGCGTTGATTTCACGCCCTTGCGCTTCAACCAGGGTGCCATTTGCCGTCGGTTGCGa  <  1:63153/62‑1 (MQ=255) aGCGTGGCGTTGATTTCACGCCCTTGCGCTTCAACCAGGGTGCCATTTGCCGTCGGTTGCGa  <  1:694339/62‑1 (MQ=255) aGCGTGGCGTTGATTTCACGCCCTTGCGCTTCAACCAGGGTGCCATTTGCCGTCGGTTGCGa  <  1:692259/62‑1 (MQ=255) aGCGTGGCGTTGATTTCACGCCCTTGCGCTTCAACCAGGGTGCCATTTGCCGTCGGTTGCGa  <  1:674335/62‑1 (MQ=255) aGCGTGGCGTTGATTTCACGCCCTTGCGCTTCAACCAGGGTGCCATTTGCCGTCGGTTGCGa  <  1:664769/62‑1 (MQ=255) aGCGTGGCGTTGATTTCACGCCCTTGCGCTTCAACCAGGGTGCCATTTGCCGTCGGTTGCGa  <  1:662055/62‑1 (MQ=255) aGCGTGGCGTTGATTTCACGCCCTTGCGCTTCAACCAGGGTGCCATTTGCCGTCGGTTGCGa  <  1:656198/62‑1 (MQ=255) aGCGTGGCGTTGATTTCACGCCCTTGCGCTTCAACCAGGGTGCCATTTGCCGTCGGTTGCGa  <  1:649083/62‑1 (MQ=255) aGCGTGGCGTTGATTTCACGCCCTTGCGCTTCAACCAGGGTGCCATTTGCCGTCGGTTGCGa  <  1:635544/62‑1 (MQ=255) aGCGTGGCGTTGATTTCACGCCCTTGCGCTTCAACCAGGGTGCCATTTGCCGTCGGTTGCGa  <  1:733236/62‑1 (MQ=255) aGCGTGGCGTTGATTTCACGCCCTTGCGCTTCAACCAGGGTGCCATTTGCCGTCGGTTGCGa  <  1:591591/62‑1 (MQ=255) aGCGTGGCGTTGATTTCACGCCCTTGCGCTTCAACCAGGGTGCCATTTGCCGTCGGTTGCGa  <  1:564683/62‑1 (MQ=255) aGCGTGGCGTTGATTTCACGCCCTTGCGCTTCAACCAGGGTGCCATTTGCCGTCGGTTGCGa  <  1:533359/62‑1 (MQ=255) aGCGTGGCGTTGATTTCACGCCCTTGCGCTTCAACCAGGGTGCCATTTGCCGTCGGTTGCGa  <  1:520964/62‑1 (MQ=255) aGCGTGGCGTTGATTTCACGCCCTTGCGCTTCAACCAGGGTGCCATTTGCCGTCGGTTGCGa  <  1:505761/62‑1 (MQ=255) aGCGTGGCGTTGATTTCACGCCCTTGCGCTTCAACCAGGGTGCCATTTGCCGTCGGTTGCGa  <  1:495993/62‑1 (MQ=255) aGCGTGGCGTTGATTTCACGCCCTTGCGCTTCAACCAGGGTGCCATTTGCCGTCGGTTGCGa  <  1:485563/62‑1 (MQ=255) aGCGTGGCGTTGATTTCACGCCCTTGCGCTTCAACCAGGGTGCCATTTGCCGTCGGTTGCGa  <  1:464666/62‑1 (MQ=255) aGCGTGGCGTTGATTTCACGCCCTTGCGCTTCAACCAGGGTGCCATTTGCCGTCGGTTGCGa  <  1:100765/62‑1 (MQ=255) aGCGTGGCGTTGATTTCACGCCCTTGCGCTTCAACCAGGGTGCCATTTGCCGTCGGTTGCGa  <  1:838000/62‑1 (MQ=255) aGCGTGGCGTTGATTTCACGCCCTTGCGCTTCAACCAGGGTGCCATTTGCCGTCGGTTGCGa  <  1:950426/62‑1 (MQ=255) aGCGTGGCGTTGATTTCACGCCCTTGCGCTTCAACCAGGGTGCCATTTGCCGTCGGTTGCGa  <  1:947616/62‑1 (MQ=255) aGCGTGGCGTTGATTTCACGCCCTTGCGCTTCAACCAGGGTGCCATTTGCCGTCGGTTGCGa  <  1:927584/62‑1 (MQ=255) aGCGTGGCGTTGATTTCACGCCCTTGCGCTTCAACCAGGGTGCCATTTGCCGTCGGTTGCGa  <  1:921422/62‑1 (MQ=255) aGCGTGGCGTTGATTTCACGCCCTTGCGCTTCAACCAGGGTGCCATTTGCCGTCGGTTGCGa  <  1:91227/62‑1 (MQ=255) aGCGTGGCGTTGATTTCACGCCCTTGCGCTTCAACCAGGGTGCCATTTGCCGTCGGTTGCGa  <  1:910828/62‑1 (MQ=255) aGCGTGGCGTTGATTTCACGCCCTTGCGCTTCAACCAGGGTGCCATTTGCCGTCGGTTGCGa  <  1:863909/62‑1 (MQ=255) aGCGTGGCGTTGATTTCACGCCCTTGCGCTTCAACCAGGGTGCCATTTGCCGTCGGTTGCGa  <  1:841878/62‑1 (MQ=255) aGCGTGGCGTTGATTTCACGCCCTTGCGCTTCAACCAGGGTGCCATTTGCCGTCGGTTGCGa  <  1:83929/62‑1 (MQ=255) aGCGTGGCGTTGATTTCACGCCCTTGCGCTTCAACCAGGGTGCCATTTGCCGTCGGTTGCGa  <  1:390154/62‑1 (MQ=255) aGCGTGGCGTTGATTTCACGCCCTTGCGCTTCAACCAGGGTGCCATTTGCCGTCGGTTGCGa  <  1:824256/62‑1 (MQ=255) aGCGTGGCGTTGATTTCACGCCCTTGCGCTTCAACCAGGGTGCCATTTGCCGTCGGTTGCGa  <  1:796298/62‑1 (MQ=255) aGCGTGGCGTTGATTTCACGCCCTTGCGCTTCAACCAGGGTGCCATTTGCCGTCGGTTGCGa  <  1:794108/62‑1 (MQ=255) aGCGTGGCGTTGATTTCACGCCCTTGCGCTTCAACCAGGGTGCCATTTGCCGTCGGTTGCGa  <  1:784390/62‑1 (MQ=255) aGCGTGGCGTTGATTTCACGCCCTTGCGCTTCAACCAGGGTGCCATTTGCCGTCGGTTGCGa  <  1:765625/62‑1 (MQ=255) aGCGTGGCGTTGATTTCACGCCCTTGCGCTTCAACCAGGGTGCCATTTGCCGTCGGTTGCGa  <  1:762087/62‑1 (MQ=255) aGCGTGGCGTTGATTTCACGCCCTTGCGCTTCAACCAGGGTGCCATTTGCCGTCGGTTGCGa  <  1:760448/62‑1 (MQ=255) aGCGTGGCGTTGATTTCACGCCCTTGCGCTTCAACCAGGGTGCCATTTGCCGTCGGTTGCGa  <  1:759591/62‑1 (MQ=255) aGCGTGGCGTTGATTTCACGCCCTTGCGCTTCAACCAGGGTGCCATTTGCCGTCGGTTGCGa  <  1:1221681/62‑1 (MQ=255) aGCGTGGCGTTGATTTCACGCCCTTGCGCTTCAACCAGGGTGCCATTTGCCGTCGGTTGCGa  <  1:1405122/62‑1 (MQ=255) aGCGTGGCGTTGATTTCACGCCCTTGCGCTTCAACCAGGGTGCCATTTGCCGTCGGTTGCGa  <  1:327329/62‑1 (MQ=255) aGCGTGGCGTTGATTTCACGCCCTTGCGCTTCAACCAGGGTGCCATTTGCCGTCGGTTGCGa  <  1:1377621/62‑1 (MQ=255) aGCGTGGCGTTGATTTCACGCCCTTGCGCTTCAACCAGGGTGCCATTTGCCGTCGGTTGCGa  <  1:1346002/62‑1 (MQ=255) aGCGTGGCGTTGATTTCACGCCCTTGCGCTTCAACCAGGGTGCCATTTGCCGTCGGTTGCGa  <  1:1338879/62‑1 (MQ=255) aGCGTGGCGTTGATTTCACGCCCTTGCGCTTCAACCAGGGTGCCATTTGCCGTCGGTTGCGa  <  1:130983/62‑1 (MQ=255) aGCGTGGCGTTGATTTCACGCCCTTGCGCTTCAACCAGGGTGCCATTTGCCGTCGGTTGCGa  <  1:1282957/62‑1 (MQ=255) aGCGTGGCGTTGATTTCACGCCCTTGCGCTTCAACCAGGGTGCCATTTGCCGTCGGTTGCGa  <  1:1268806/62‑1 (MQ=255) aGCGTGGCGTTGATTTCACGCCCTTGCGCTTCAACCAGGGTGCCATTTGCCGTCGGTTGCGa  <  1:1265132/62‑1 (MQ=255) aGCGTGGCGTTGATTTCACGCCCTTGCGCTTCAACCAGGGTGCCATTTGCCGTCGGTTGCGa  <  1:1383447/62‑1 (MQ=255) aGCGTGGCGTTGATTTCACGCCCTTGCGCTTCAACCAGGGTGCCATTTGCCGTCGGTTGCGa  <  1:1193963/62‑1 (MQ=255) aGCGTGGCGTTGATTTCACGCCCTTGCGCTTCAACCAGGGTGCCATTTGCCGTCGGTTGCGa  <  1:1169822/62‑1 (MQ=255) aGCGTGGCGTTGATTTCACGCCCTTGCGCTTCAACCAGGGTGCCATTTGCCGTCGGTTGCGa  <  1:1156000/62‑1 (MQ=255) aGCGTGGCGTTGATTTCACGCCCTTGCGCTTCAACCAGGGTGCCATTTGCCGTCGGTTGCGa  <  1:1142563/62‑1 (MQ=255) aGCGTGGCGTTGATTTCACGCCCTTGCGCTTCAACCAGGGTGCCATTTGCCGTCGGTTGCGa  <  1:1119493/62‑1 (MQ=255) aGCGTGGCGTTGATTTCACGCCCTTGCGCTTCAACCAGGGTGCCATTTGCCGTCGGTTGCGa  <  1:1113841/62‑1 (MQ=255) aGCGTGGCGTTGATTTCACGCCCTTGCGCTTCAACCAGGGTGCCATTTGCCGTCGGTTGCGa  <  1:1093220/62‑1 (MQ=255) aGCGTGGCGTTGATTTCACGCCCTTGCGCTTCAACCAGGGTGCCATTTGCCGTCGGTTGCGa  <  1:1083660/62‑1 (MQ=255) aGCGTGGCGTTGATTTCACGCCCTTGCGCTTCAACCAGGGTGCCATTTGCCGTCGGTTGCGa  <  1:247955/62‑1 (MQ=255) aGCGTGGCGTTGATTTCACGCCCTTGCGCTTCAACCAGGGTGCCATTTGCCGTCGGTTGCGa  <  1:322578/62‑1 (MQ=255) aGCGTGGCGTTGATTTCACGCCCTTGCGCTTCAACCAGGGTGCCATTTGCCGTCGGTTGCGa  <  1:311535/62‑1 (MQ=255) aGCGTGGCGTTGATTTCACGCCCTTGCGCTTCAACCAGGGTGCCATTTGCCGTCGGTTGCGa  <  1:304181/62‑1 (MQ=255) aGCGTGGCGTTGATTTCACGCCCTTGCGCTTCAACCAGGGTGCCATTTGCCGTCGGTTGCGa  <  1:288554/62‑1 (MQ=255) aGCGTGGCGTTGATTTCACGCCCTTGCGCTTCAACCAGGGTGCCATTTGCCGTCGGTTGCGa  <  1:284311/62‑1 (MQ=255) aGCGTGGCGTTGATTTCACGCCCTTGCGCTTCAACCAGGGTGCCATTTGCCGTCGGTTGCGa  <  1:261145/62‑1 (MQ=255) aGCGTGGCGTTGATTTCACGCCCTTGCGCTTCAACCAGGGTGCCATTTGCCGTCGGTTGCGa  <  1:255579/62‑1 (MQ=255) aGCGTGGCGTTGATTTCACGCCCTTGCGCTTCAACCAGGGTGCCATTTGCCGTCGGTTGCGa  <  1:252051/62‑1 (MQ=255) aGCGTGGCGTTGATTTCACGCCCTTGCGCTTCAACCAGGGTGCCATTTGCCGTCGGTTGCGa  <  1:1406618/62‑1 (MQ=255) aGCGTGGCGTTGATTTCACGCCCTTGCGCTTCAACCAGGGTGCCATTTGCCGTCGGTTGCGa  <  1:228337/62‑1 (MQ=255) aGCGTGGCGTTGATTTCACGCCCTTGCGCTTCAACCAGGGTGCCATTTGCCGTCGGTTGCGa  <  1:20924/62‑1 (MQ=255) aGCGTGGCGTTGATTTCACGCCCTTGCGCTTCAACCAGGGTGCCATTTGCCGTCGGTTGCGa  <  1:1472162/62‑1 (MQ=255) aGCGTGGCGTTGATTTCACGCCCTTGCGCTTCAACCAGGGTGCCATTTGCCGTCGGTTGCGa  <  1:1441125/62‑1 (MQ=255) aGCGTGGCGTTGATTTCACGCCCTTGCGCTTCAACCAGGGTGCCATTTGCCGTCGGTTGCGa  <  1:1424847/62‑1 (MQ=255) aGCGTGGCGTTGATTTCACGCCCTTGCGCTTCAACCAGGGTGCCATTTGCCGTCGGTTGCGa  <  1:1423650/62‑1 (MQ=255)  gCGTGGCGTTGATTTCACGCCCTTGCGCTTCAACCAGGGTGCCATTTGCCGTCGGTTGCGa  <  1:235534/61‑1 (MQ=255)  gCGTGGCGTTGATTTCACGCCCTTGCGCTTCAACCAGGGTGCCATTTGCCGTCGGTTGCGa  <  1:882195/61‑1 (MQ=255)  gCGTGGCGTTGATTTCACGCCCTTGCGCTTCAACCAGGGTGCCATTTGCCGTCGGTTGCGa  <  1:13761/61‑1 (MQ=255)   cGTGGCGTTGATTTCACGCCCTTGCGCTTCAACCAGGGTGCCATTTGCCGTCGGTTGCGa  <  1:826467/60‑1 (MQ=255)             aTTTCACGCCCTTGCGCTTCAACCAGGGTGCCATTTGCCGTCGGTTGCGa  <  1:523260/50‑1 (MQ=255)                                                              | AGCGTGGCGTTGATTTCACGCCCTTGCGCTTCAACCAGGGTGCCATTTGCCGTCGGTTGCGA  >  W3110S.gb/3393274‑3393335

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑