Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3448781	3448802	22	43 [0]	[0] 62	rpoC	RNA polymerase, beta prime subunit

CAGGTCACACCACTGTTCGTGCAGCAGCGTGTTGCGCGGAACGAGGATATCAGCAGTACCCG  >  W3110S.gb/3448719‑3448780                                                              | cagGTCACACCTCTGTTGGTGCAGCAGCGTGTTGCGCGGAACGAGGATATCAGCAGTACCCg  <  1:587991/62‑1 (MQ=255) cagGTCACACCACTGTTCGTGCAGCAGCGTGTTGCGCGGAACGATGATATCAGCAGTACCCg  <  1:326572/62‑1 (MQ=255) cagGTCACACCACTGTTCGTGCAGCAGCGTGTTGCGCGGAACGAGGATATCAGCAGTACCCg  <  1:653561/62‑1 (MQ=255) cagGTCACACCACTGTTCGTGCAGCAGCGTGTTGCGCGGAACGAGGATATCAGCAGTACCCg  <  1:408671/62‑1 (MQ=255) cagGTCACACCACTGTTCGTGCAGCAGCGTGTTGCGCGGAACGAGGATATCAGCAGTACCCg  <  1:409601/62‑1 (MQ=255) cagGTCACACCACTGTTCGTGCAGCAGCGTGTTGCGCGGAACGAGGATATCAGCAGTACCCg  <  1:468837/62‑1 (MQ=255) cagGTCACACCACTGTTCGTGCAGCAGCGTGTTGCGCGGAACGAGGATATCAGCAGTACCCg  <  1:493257/62‑1 (MQ=255) cagGTCACACCACTGTTCGTGCAGCAGCGTGTTGCGCGGAACGAGGATATCAGCAGTACCCg  <  1:558844/62‑1 (MQ=255) cagGTCACACCACTGTTCGTGCAGCAGCGTGTTGCGCGGAACGAGGATATCAGCAGTACCCg  <  1:574199/62‑1 (MQ=255) cagGTCACACCACTGTTCGTGCAGCAGCGTGTTGCGCGGAACGAGGATATCAGCAGTACCCg  <  1:589674/62‑1 (MQ=255) cagGTCACACCACTGTTCGTGCAGCAGCGTGTTGCGCGGAACGAGGATATCAGCAGTACCCg  <  1:596854/62‑1 (MQ=255) cagGTCACACCACTGTTCGTGCAGCAGCGTGTTGCGCGGAACGAGGATATCAGCAGTACCCg  <  1:37512/62‑1 (MQ=255) cagGTCACACCACTGTTCGTGCAGCAGCGTGTTGCGCGGAACGAGGATATCAGCAGTACCCg  <  1:655619/62‑1 (MQ=255) cagGTCACACCACTGTTCGTGCAGCAGCGTGTTGCGCGGAACGAGGATATCAGCAGTACCCg  <  1:681198/62‑1 (MQ=255) cagGTCACACCACTGTTCGTGCAGCAGCGTGTTGCGCGGAACGAGGATATCAGCAGTACCCg  <  1:69366/62‑1 (MQ=255) cagGTCACACCACTGTTCGTGCAGCAGCGTGTTGCGCGGAACGAGGATATCAGCAGTACCCg  <  1:699014/62‑1 (MQ=255) cagGTCACACCACTGTTCGTGCAGCAGCGTGTTGCGCGGAACGAGGATATCAGCAGTACCCg  <  1:723037/62‑1 (MQ=255) cagGTCACACCACTGTTCGTGCAGCAGCGTGTTGCGCGGAACGAGGATATCAGCAGTACCCg  <  1:733908/62‑1 (MQ=255) cagGTCACACCACTGTTCGTGCAGCAGCGTGTTGCGCGGAACGAGGATATCAGCAGTACCCg  <  1:743825/62‑1 (MQ=255) cagGTCACACCACTGTTCGTGCAGCAGCGTGTTGCGCGGAACGAGGATATCAGCAGTACCCg  <  1:775204/62‑1 (MQ=255) cagGTCACACCACTGTTCGTGCAGCAGCGTGTTGCGCGGAACGAGGATATCAGCAGTACCCg  <  1:796601/62‑1 (MQ=255) cagGTCACACCACTGTTCGTGCAGCAGCGTGTTGCGCGGAACGAGGATATCAGCAGTACCCg  <  1:821575/62‑1 (MQ=255) cagGTCACACCACTGTTCGTGCAGCAGCGTGTTGCGCGGAACGAGGATATCAGCAGTACCCg  <  1:1327076/62‑1 (MQ=255) cagGTCACACCACTGTTCGTGCAGCAGCGTGTTGCGCGGAACGAGGATATCAGCAGTACCCg  <  1:105630/62‑1 (MQ=255) cagGTCACACCACTGTTCGTGCAGCAGCGTGTTGCGCGGAACGAGGATATCAGCAGTACCCg  <  1:1105083/62‑1 (MQ=255) cagGTCACACCACTGTTCGTGCAGCAGCGTGTTGCGCGGAACGAGGATATCAGCAGTACCCg  <  1:1129182/62‑1 (MQ=255) cagGTCACACCACTGTTCGTGCAGCAGCGTGTTGCGCGGAACGAGGATATCAGCAGTACCCg  <  1:1171787/62‑1 (MQ=255) cagGTCACACCACTGTTCGTGCAGCAGCGTGTTGCGCGGAACGAGGATATCAGCAGTACCCg  <  1:1226662/62‑1 (MQ=255) cagGTCACACCACTGTTCGTGCAGCAGCGTGTTGCGCGGAACGAGGATATCAGCAGTACCCg  <  1:123569/62‑1 (MQ=255) cagGTCACACCACTGTTCGTGCAGCAGCGTGTTGCGCGGAACGAGGATATCAGCAGTACCCg  <  1:1258438/62‑1 (MQ=255) cagGTCACACCACTGTTCGTGCAGCAGCGTGTTGCGCGGAACGAGGATATCAGCAGTACCCg  <  1:1307681/62‑1 (MQ=255) cagGTCACACCACTGTTCGTGCAGCAGCGTGTTGCGCGGAACGAGGATATCAGCAGTACCCg  <  1:1003046/62‑1 (MQ=255) cagGTCACACCACTGTTCGTGCAGCAGCGTGTTGCGCGGAACGAGGATATCAGCAGTACCCg  <  1:146320/62‑1 (MQ=255) cagGTCACACCACTGTTCGTGCAGCAGCGTGTTGCGCGGAACGAGGATATCAGCAGTACCCg  <  1:149393/62‑1 (MQ=255) cagGTCACACCACTGTTCGTGCAGCAGCGTGTTGCGCGGAACGAGGATATCAGCAGTACCCg  <  1:179182/62‑1 (MQ=255) cagGTCACACCACTGTTCGTGCAGCAGCGTGTTGCGCGGAACGAGGATATCAGCAGTACCCg  <  1:206712/62‑1 (MQ=255) cagGTCACACCACTGTTCGTGCAGCAGCGTGTTGCGCGGAACGAGGATATCAGCAGTACCCg  <  1:252703/62‑1 (MQ=255) cagGTCACACCACTGTTCGTGCAGCAGCGTGTTGCGCGGAACGAGGATATCAGCAGTACCCg  <  1:294844/62‑1 (MQ=255) cagGTCACACCACTGTTCGTGCAGCAGCGTGTTGCGCGGAACGAGGATATCAGCAGTACCCg  <  1:310045/62‑1 (MQ=255) cagGTCACACCACTGTTCGTGCAGCAGCGTGTTGCGCGGAACGAGGATATCAGCAGTACCCg  <  1:354066/62‑1 (MQ=255) cagGTCACACCACTGTTCGTGCAGCAGCGTGTTGCGCGGAACGAGGATATCAGCAGTACCCg  <  1:374041/62‑1 (MQ=255) cagGTCACACCACTGTTCGTGCAGAAGCGTGTTGCGCGGAACGAGGATATCAGCAGTACACg  <  1:801349/62‑1 (MQ=255)                         cagcGTGTTGCGCGGAACGAGGATATCAGCAGTACCCg  <  1:1246475/38‑1 (MQ=255)                                                              | CAGGTCACACCACTGTTCGTGCAGCAGCGTGTTGCGCGGAACGAGGATATCAGCAGTACCCG  >  W3110S.gb/3448719‑3448780

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑