Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3451683	3451705	23	60 [0]	[0] 8	rpoB	RNA polymerase, beta subunit

TCCCCGAAACGCTGACCACCGAACTGTGCCTTACCACCCAGCGGCTGCTGAGTAACCAGGC  >  W3110S.gb/3451622‑3451682                                                             | tcCCCGAAACGCTGACCACCGAACTGTGCCTTACCACCCAGCGGCTGCTGAGTAACCAGGc  >  1:69123/1‑61 (MQ=255) tcCCCGAAACGCTGACCACCGAACTGTGCCTTACCACCCAGCGGCTGCTGAGTAACCAGGc  >  1:1008246/1‑61 (MQ=255) tcCCCGAAACGCTGACCACCGAACTGTGCCTTACCACCCAGCGGCTGCTGAGTAACCAGGc  >  1:404356/1‑61 (MQ=255) tcCCCGAAACGCTGACCACCGAACTGTGCCTTACCACCCAGCGGCTGCTGAGTAACCAGGc  >  1:427360/1‑61 (MQ=255) tcCCCGAAACGCTGACCACCGAACTGTGCCTTACCACCCAGCGGCTGCTGAGTAACCAGGc  >  1:492553/1‑61 (MQ=255) tcCCCGAAACGCTGACCACCGAACTGTGCCTTACCACCCAGCGGCTGCTGAGTAACCAGGc  >  1:506540/1‑61 (MQ=255) tcCCCGAAACGCTGACCACCGAACTGTGCCTTACCACCCAGCGGCTGCTGAGTAACCAGGc  >  1:512131/1‑61 (MQ=255) tcCCCGAAACGCTGACCACCGAACTGTGCCTTACCACCCAGCGGCTGCTGAGTAACCAGGc  >  1:529992/1‑61 (MQ=255) tcCCCGAAACGCTGACCACCGAACTGTGCCTTACCACCCAGCGGCTGCTGAGTAACCAGGc  >  1:566748/1‑61 (MQ=255) tcCCCGAAACGCTGACCACCGAACTGTGCCTTACCACCCAGCGGCTGCTGAGTAACCAGGc  >  1:570064/1‑61 (MQ=255) tcCCCGAAACGCTGACCACCGAACTGTGCCTTACCACCCAGCGGCTGCTGAGTAACCAGGc  >  1:579310/1‑61 (MQ=255) tcCCCGAAACGCTGACCACCGAACTGTGCCTTACCACCCAGCGGCTGCTGAGTAACCAGGc  >  1:581986/1‑61 (MQ=255) tcCCCGAAACGCTGACCACCGAACTGTGCCTTACCACCCAGCGGCTGCTGAGTAACCAGGc  >  1:591964/1‑61 (MQ=255) tcCCCGAAACGCTGACCACCGAACTGTGCCTTACCACCCAGCGGCTGCTGAGTAACCAGGc  >  1:637359/1‑61 (MQ=255) tcCCCGAAACGCTGACCACCGAACTGTGCCTTACCACCCAGCGGCTGCTGAGTAACCAGGc  >  1:647432/1‑61 (MQ=255) tcCCCGAAACGCTGACCACCGAACTGTGCCTTACCACCCAGCGGCTGCTGAGTAACCAGGc  >  1:31513/1‑61 (MQ=255) tcCCCGAAACGCTGACCACCGAACTGTGCCTTACCACCCAGCGGCTGCTGAGTAACCAGGc  >  1:69304/1‑61 (MQ=255) tcCCCGAAACGCTGACCACCGAACTGTGCCTTACCACCCAGCGGCTGCTGAGTAACCAGGc  >  1:727687/1‑61 (MQ=255) tcCCCGAAACGCTGACCACCGAACTGTGCCTTACCACCCAGCGGCTGCTGAGTAACCAGGc  >  1:729052/1‑61 (MQ=255) tcCCCGAAACGCTGACCACCGAACTGTGCCTTACCACCCAGCGGCTGCTGAGTAACCAGGc  >  1:742358/1‑61 (MQ=255) tcCCCGAAACGCTGACCACCGAACTGTGCCTTACCACCCAGCGGCTGCTGAGTAACCAGGc  >  1:74504/1‑61 (MQ=255) tcCCCGAAACGCTGACCACCGAACTGTGCCTTACCACCCAGCGGCTGCTGAGTAACCAGGc  >  1:757256/1‑61 (MQ=255) tcCCCGAAACGCTGACCACCGAACTGTGCCTTACCACCCAGCGGCTGCTGAGTAACCAGGc  >  1:786082/1‑61 (MQ=255) tcCCCGAAACGCTGACCACCGAACTGTGCCTTACCACCCAGCGGCTGCTGAGTAACCAGGc  >  1:824068/1‑61 (MQ=255) tcCCCGAAACGCTGACCACCGAACTGTGCCTTACCACCCAGCGGCTGCTGAGTAACCAGGc  >  1:847999/1‑61 (MQ=255) tcCCCGAAACGCTGACCACCGAACTGTGCCTTACCACCCAGCGGCTGCTGAGTAACCAGGc  >  1:888318/1‑61 (MQ=255) tcCCCGAAACGCTGACCACCGAACTGTGCCTTACCACCCAGCGGCTGCTGAGTAACCAGGc  >  1:906863/1‑61 (MQ=255) tcCCCGAAACGCTGACCACCGAACTGTGCCTTACCACCCAGCGGCTGCTGAGTAACCAGGc  >  1:939973/1‑61 (MQ=255) tcCCCGAAACGCTGACCACCGAACTGTGCCTTACCACCCAGCGGCTGCTGAGTAACCAGGc  >  1:981932/1‑61 (MQ=255) tcCCCGAAACGCTGACCACCGAACTGTGCCTTACCACCCAGCGGCTGCTGAGTAACCAGGc  >  1:985392/1‑61 (MQ=255) tcCCCGAAACGCTGACCACCGAACTGTGCCTTACCACCCAGCGGCTGCTGAGTAACCAGGc  >  1:241237/1‑61 (MQ=255) tcCCCGAAACGCTGACCACCGAACTGTGCCTTACCACCCAGCGGCTGCTGAGTAACCAGGc  >  1:1011284/1‑61 (MQ=255) tcCCCGAAACGCTGACCACCGAACTGTGCCTTACCACCCAGCGGCTGCTGAGTAACCAGGc  >  1:1063908/1‑61 (MQ=255) tcCCCGAAACGCTGACCACCGAACTGTGCCTTACCACCCAGCGGCTGCTGAGTAACCAGGc  >  1:107912/1‑61 (MQ=255) tcCCCGAAACGCTGACCACCGAACTGTGCCTTACCACCCAGCGGCTGCTGAGTAACCAGGc  >  1:1094629/1‑61 (MQ=255) tcCCCGAAACGCTGACCACCGAACTGTGCCTTACCACCCAGCGGCTGCTGAGTAACCAGGc  >  1:1133682/1‑61 (MQ=255) tcCCCGAAACGCTGACCACCGAACTGTGCCTTACCACCCAGCGGCTGCTGAGTAACCAGGc  >  1:1142545/1‑61 (MQ=255) tcCCCGAAACGCTGACCACCGAACTGTGCCTTACCACCCAGCGGCTGCTGAGTAACCAGGc  >  1:1153330/1‑61 (MQ=255) tcCCCGAAACGCTGACCACCGAACTGTGCCTTACCACCCAGCGGCTGCTGAGTAACCAGGc  >  1:1156544/1‑61 (MQ=255) tcCCCGAAACGCTGACCACCGAACTGTGCCTTACCACCCAGCGGCTGCTGAGTAACCAGGc  >  1:1165401/1‑61 (MQ=255) tcCCCGAAACGCTGACCACCGAACTGTGCCTTACCACCCAGCGGCTGCTGAGTAACCAGGc  >  1:1172499/1‑61 (MQ=255) tcCCCGAAACGCTGACCACCGAACTGTGCCTTACCACCCAGCGGCTGCTGAGTAACCAGGc  >  1:1175343/1‑61 (MQ=255) tcCCCGAAACGCTGACCACCGAACTGTGCCTTACCACCCAGCGGCTGCTGAGTAACCAGGc  >  1:1197553/1‑61 (MQ=255) tcCCCGAAACGCTGACCACCGAACTGTGCCTTACCACCCAGCGGCTGCTGAGTAACCAGGc  >  1:120314/1‑61 (MQ=255) tcCCCGAAACGCTGACCACCGAACTGTGCCTTACCACCCAGCGGCTGCTGAGTAACCAGGc  >  1:1237895/1‑61 (MQ=255) tcCCCGAAACGCTGACCACCGAACTGTGCCTTACCACCCAGCGGCTGCTGAGTAACCAGGc  >  1:1313379/1‑61 (MQ=255) tcCCCGAAACGCTGACCACCGAACTGTGCCTTACCACCCAGCGGCTGCTGAGTAACCAGGc  >  1:1335988/1‑61 (MQ=255) tcCCCGAAACGCTGACCACCGAACTGTGCCTTACCACCCAGCGGCTGCTGAGTAACCAGGc  >  1:1363225/1‑61 (MQ=255) tcCCCGAAACGCTGACCACCGAACTGTGCCTTACCACCCAGCGGCTGCTGAGTAACCAGGc  >  1:1389232/1‑61 (MQ=255) tcCCCGAAACGCTGACCACCGAACTGTGCCTTACCACCCAGCGGCTGCTGAGTAACCAGGc  >  1:1405003/1‑61 (MQ=255) tcCCCGAAACGCTGACCACCGAACTGTGCCTTACCACCCAGCGGCTGCTGAGTAACCAGGc  >  1:1418510/1‑61 (MQ=255) tcCCCGAAACGCTGACCACCGAACTGTGCCTTACCACCCAGCGGCTGCTGAGTAACCAGGc  >  1:142956/1‑61 (MQ=255) tcCCCGAAACGCTGACCACCGAACTGTGCCTTACCACCCAGCGGCTGCTGAGTAACCAGGc  >  1:1430569/1‑61 (MQ=255) tcCCCGAAACGCTGACCACCGAACTGTGCCTTACCACCCAGCGGCTGCTGAGTAACCAGGc  >  1:1437494/1‑61 (MQ=255) tcCCCGAAACGCTGACCACCGAACTGTGCCTTACCACCCAGCGGCTGCTGAGTAACCAGGc  >  1:1468942/1‑61 (MQ=255) tcCCCGAAACGCTGACCACCGAACTGTGCCTTACCACCCAGCGGCTGCTGAGTAACCAGGc  >  1:190269/1‑61 (MQ=255) tcCCCGAAACGCTGACCACCGAACTGTGCCTTACCACCCAGCGGCTGCTGAGTAACCAGGc  >  1:212565/1‑61 (MQ=255) tcCCCGAAACGCTGACCACCGAACTGTGCCTTACCACCCAGCGGCTGCTGAGTAACCAGGc  >  1:245969/1‑61 (MQ=255) tcCCCGAAACGCTGACCACCGAACTGTGCCTTACCACCCAGCGCCTGCTGAGTAACCAGGc  >  1:53483/1‑61 (MQ=255) tcCCCGAAACGCTGACCACCGAACTGAGCCTTACCACCCAGCGGCTGCTGAGTAACCAGGc  >  1:1262744/1‑61 (MQ=255)                                                             | TCCCCGAAACGCTGACCACCGAACTGTGCCTTACCACCCAGCGGCTGCTGAGTAACCAGGC  >  W3110S.gb/3451622‑3451682

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑