Missing coverage evidence...
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*	*	÷	W3110S.gb	3454574	3454709	136	55 [0]	[0] 15	rpoB	RNA polymerase, beta subunit

CAATATAGTCTTTAGCAACCACTTTACCTGCGATGTACTCAACC  >  W3110S.gb/3454530‑3454573                                            | caATATAGTCTTTAGCAACCACTTTACCTGCGATGTACTCAAcc  >  1:75269/1‑44 (MQ=255) caATATAGTCTTTAGCAACCACTTTACCTGCGATGTACTCAAcc  >  1:221295/1‑44 (MQ=255) caATATAGTCTTTAGCAACCACTTTACCTGCGATGTACTCAAcc  >  1:339056/1‑44 (MQ=255) caATATAGTCTTTAGCAACCACTTTACCTGCGATGTACTCAAcc  >  1:350056/1‑44 (MQ=255) caATATAGTCTTTAGCAACCACTTTACCTGCGATGTACTCAAcc  >  1:374275/1‑44 (MQ=255) caATATAGTCTTTAGCAACCACTTTACCTGCGATGTACTCAAcc  >  1:463127/1‑44 (MQ=255) caATATAGTCTTTAGCAACCACTTTACCTGCGATGTACTCAAcc  >  1:549599/1‑44 (MQ=255) caATATAGTCTTTAGCAACCACTTTACCTGCGATGTACTCAAcc  >  1:552418/1‑44 (MQ=255) caATATAGTCTTTAGCAACCACTTTACCTGCGATGTACTCAAcc  >  1:556932/1‑44 (MQ=255) caATATAGTCTTTAGCAACCACTTTACCTGCGATGTACTCAAcc  >  1:611349/1‑44 (MQ=255) caATATAGTCTTTAGCAACCACTTTACCTGCGATGTACTCAAcc  >  1:638305/1‑44 (MQ=255) caATATAGTCTTTAGCAACCACTTTACCTGCGATGTACTCAAcc  >  1:642020/1‑44 (MQ=255) caATATAGTCTTTAGCAACCACTTTACCTGCGATGTACTCAAcc  >  1:719375/1‑44 (MQ=255) caATATAGTCTTTAGCAACCACTTTACCTGCGATGTACTCAAcc  >  1:74084/1‑44 (MQ=255) caATATAGTCTTTAGCAACCACTTTACCTGCGATGTACTCAAcc  >  1:220485/1‑44 (MQ=255) caATATAGTCTTTAGCAACCACTTTACCTGCGATGTACTCAAcc  >  1:764365/1‑44 (MQ=255) caATATAGTCTTTAGCAACCACTTTACCTGCGATGTACTCAAcc  >  1:794806/1‑44 (MQ=255) caATATAGTCTTTAGCAACCACTTTACCTGCGATGTACTCAAcc  >  1:805389/1‑44 (MQ=255) caATATAGTCTTTAGCAACCACTTTACCTGCGATGTACTCAAcc  >  1:827482/1‑44 (MQ=255) caATATAGTCTTTAGCAACCACTTTACCTGCGATGTACTCAAcc  >  1:838680/1‑44 (MQ=255) caATATAGTCTTTAGCAACCACTTTACCTGCGATGTACTCAAcc  >  1:858345/1‑44 (MQ=255) caATATAGTCTTTAGCAACCACTTTACCTGCGATGTACTCAAcc  >  1:859655/1‑44 (MQ=255) caATATAGTCTTTAGCAACCACTTTACCTGCGATGTACTCAAcc  >  1:920016/1‑44 (MQ=255) caATATAGTCTTTAGCAACCACTTTACCTGCGATGTACTCAAcc  >  1:923661/1‑44 (MQ=255) caATATAGTCTTTAGCAACCACTTTACCTGCGATGTACTCAAcc  >  1:952258/1‑44 (MQ=255) caATATAGTCTTTAGCAACCACTTTACCTGCGATGTACTCAAcc  >  1:953990/1‑44 (MQ=255) caATATAGTCTTTAGCAACCACTTTACCTGCGATGTACTCAAcc  >  1:959851/1‑44 (MQ=255) caATATAGTCTTTAGCAACCACTTTACCTGCGATGTACTCAAcc  >  1:98224/1‑44 (MQ=255) caATATAGTCTTTAGCAACCACTTTACCTGCGATGTACTCAAcc  >  1:1272403/1‑44 (MQ=255) caATATAGTCTTTAGCAACCACTTTACCTGCGATGTACTCAAcc  >  1:1036226/1‑44 (MQ=255) caATATAGTCTTTAGCAACCACTTTACCTGCGATGTACTCAAcc  >  1:1043705/1‑44 (MQ=255) caATATAGTCTTTAGCAACCACTTTACCTGCGATGTACTCAAcc  >  1:1043997/1‑44 (MQ=255) caATATAGTCTTTAGCAACCACTTTACCTGCGATGTACTCAAcc  >  1:109822/1‑44 (MQ=255) caATATAGTCTTTAGCAACCACTTTACCTGCGATGTACTCAAcc  >  1:1101508/1‑44 (MQ=255) caATATAGTCTTTAGCAACCACTTTACCTGCGATGTACTCAAcc  >  1:1107978/1‑44 (MQ=255) caATATAGTCTTTAGCAACCACTTTACCTGCGATGTACTCAAcc  >  1:1155083/1‑44 (MQ=255) caATATAGTCTTTAGCAACCACTTTACCTGCGATGTACTCAAcc  >  1:1159749/1‑44 (MQ=255) caATATAGTCTTTAGCAACCACTTTACCTGCGATGTACTCAAcc  >  1:1178674/1‑44 (MQ=255) caATATAGTCTTTAGCAACCACTTTACCTGCGATGTACTCAAcc  >  1:1186563/1‑44 (MQ=255) caATATAGTCTTTAGCAACCACTTTACCTGCGATGTACTCAAcc  >  1:1189285/1‑44 (MQ=255) caATATAGTCTTTAGCAACCACTTTACCTGCGATGTACTCAAcc  >  1:1195591/1‑44 (MQ=255) caATATAGTCTTTAGCAACCACTTTACCTGCGATGTACTCAAcc  >  1:125803/1‑44 (MQ=255) caATATAGTCTTTAGCAACCACTTTACCTGCGATGTACTCAAcc  >  1:1034924/1‑44 (MQ=255) caATATAGTCTTTAGCAACCACTTTACCTGCGATGTACTCAAcc  >  1:1295286/1‑44 (MQ=255) caATATAGTCTTTAGCAACCACTTTACCTGCGATGTACTCAAcc  >  1:1314485/1‑44 (MQ=255) caATATAGTCTTTAGCAACCACTTTACCTGCGATGTACTCAAcc  >  1:1350732/1‑44 (MQ=255) caATATAGTCTTTAGCAACCACTTTACCTGCGATGTACTCAAcc  >  1:1352758/1‑44 (MQ=255) caATATAGTCTTTAGCAACCACTTTACCTGCGATGTACTCAAcc  >  1:1375493/1‑44 (MQ=255) caATATAGTCTTTAGCAACCACTTTACCTGCGATGTACTCAAcc  >  1:1393500/1‑44 (MQ=255) caATATAGTCTTTAGCAACCACTTTACCTGCGATGTACTCAAcc  >  1:1419348/1‑44 (MQ=255) caATATAGTCTTTAGCAACCACTTTACCTGCGATGTACTCAAcc  >  1:1427001/1‑44 (MQ=255) caATATAGTCTTTAGCAACCACTTTACCTGCGATGTACTCAAcc  >  1:1431085/1‑44 (MQ=255) caATATAGTCTTTAGCAACCACTTTACCTGCGATGTACTCAAcc  >  1:1447134/1‑44 (MQ=255) caATATAGTCTTTAGCAACCACTTTACCTGCGATGTACTCAAcc  >  1:20297/1‑44 (MQ=255) caATATAGTCTTTAGCAACCACTTTACCTGCGATGTACTCAAcc  >  1:207381/1‑44 (MQ=255)                                            | CAATATAGTCTTTAGCAACCACTTTACCTGCGATGTACTCAACC  >  W3110S.gb/3454530‑3454573

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑