Missing coverage evidence...
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AATGCCATTTGCCGTCAGACGTGCAGCAGGTTTAATCGCCGGCACGAC  >  W3110S.gb/3470867‑3470914                                                | aaTGCCATTTGCCGTCAGACGTGCAGCAGGTTTAATCGCCGGCACGac  >  1:636755/1‑48 (MQ=255) aaTGCCATTTGCCGTCAGACGTGCAGCAGGTTTAATCGCCGGCACGac  >  1:358526/1‑48 (MQ=255) aaTGCCATTTGCCGTCAGACGTGCAGCAGGTTTAATCGCCGGCACGac  >  1:420590/1‑48 (MQ=255) aaTGCCATTTGCCGTCAGACGTGCAGCAGGTTTAATCGCCGGCACGac  >  1:425813/1‑48 (MQ=255) aaTGCCATTTGCCGTCAGACGTGCAGCAGGTTTAATCGCCGGCACGac  >  1:43344/1‑48 (MQ=255) aaTGCCATTTGCCGTCAGACGTGCAGCAGGTTTAATCGCCGGCACGac  >  1:49987/1‑48 (MQ=255) aaTGCCATTTGCCGTCAGACGTGCAGCAGGTTTAATCGCCGGCACGac  >  1:521370/1‑48 (MQ=255) aaTGCCATTTGCCGTCAGACGTGCAGCAGGTTTAATCGCCGGCACGac  >  1:52154/1‑48 (MQ=255) aaTGCCATTTGCCGTCAGACGTGCAGCAGGTTTAATCGCCGGCACGac  >  1:535206/1‑48 (MQ=255) aaTGCCATTTGCCGTCAGACGTGCAGCAGGTTTAATCGCCGGCACGac  >  1:537498/1‑48 (MQ=255) aaTGCCATTTGCCGTCAGACGTGCAGCAGGTTTAATCGCCGGCACGac  >  1:587372/1‑48 (MQ=255) aaTGCCATTTGCCGTCAGACGTGCAGCAGGTTTAATCGCCGGCACGac  >  1:624511/1‑48 (MQ=255) aaTGCCATTTGCCGTCAGACGTGCAGCAGGTTTAATCGCCGGCACGac  >  1:631149/1‑48 (MQ=255) aaTGCCATTTGCCGTCAGACGTGCAGCAGGTTTAATCGCCGGCACGac  >  1:358417/1‑48 (MQ=255) aaTGCCATTTGCCGTCAGACGTGCAGCAGGTTTAATCGCCGGCACGac  >  1:651526/1‑48 (MQ=255) aaTGCCATTTGCCGTCAGACGTGCAGCAGGTTTAATCGCCGGCACGac  >  1:66346/1‑48 (MQ=255) aaTGCCATTTGCCGTCAGACGTGCAGCAGGTTTAATCGCCGGCACGac  >  1:666138/1‑48 (MQ=255) aaTGCCATTTGCCGTCAGACGTGCAGCAGGTTTAATCGCCGGCACGac  >  1:711996/1‑48 (MQ=255) aaTGCCATTTGCCGTCAGACGTGCAGCAGGTTTAATCGCCGGCACGac  >  1:766325/1‑48 (MQ=255) aaTGCCATTTGCCGTCAGACGTGCAGCAGGTTTAATCGCCGGCACGac  >  1:771016/1‑48 (MQ=255) aaTGCCATTTGCCGTCAGACGTGCAGCAGGTTTAATCGCCGGCACGac  >  1:870344/1‑48 (MQ=255) aaTGCCATTTGCCGTCAGACGTGCAGCAGGTTTAATCGCCGGCACGac  >  1:920119/1‑48 (MQ=255) aaTGCCATTTGCCGTCAGACGTGCAGCAGGTTTAATCGCCGGCACGac  >  1:920216/1‑48 (MQ=255) aaTGCCATTTGCCGTCAGACGTGCAGCAGGTTTAATCGCCGGCACGac  >  1:930464/1‑48 (MQ=255) aaTGCCATTTGCCGTCAGACGTGCAGCAGGTTTAATCGCCGGCACGac  >  1:952714/1‑48 (MQ=255) aaTGCCATTTGCCGTCAGACGTGCAGCAGGTTTAATCGCCGGCACGac  >  1:968858/1‑48 (MQ=255) aaTGCCATTTGCCGTCAGACGTGCAGCAGGTTTAATCGCCGGCACGac  >  1:1309071/1‑48 (MQ=255) aaTGCCATTTGCCGTCAGACGTGCAGCAGGTTTAATCGCCGGCACGac  >  1:1072708/1‑48 (MQ=255) aaTGCCATTTGCCGTCAGACGTGCAGCAGGTTTAATCGCCGGCACGac  >  1:1091115/1‑48 (MQ=255) aaTGCCATTTGCCGTCAGACGTGCAGCAGGTTTAATCGCCGGCACGac  >  1:111293/1‑48 (MQ=255) aaTGCCATTTGCCGTCAGACGTGCAGCAGGTTTAATCGCCGGCACGac  >  1:1149492/1‑48 (MQ=255) aaTGCCATTTGCCGTCAGACGTGCAGCAGGTTTAATCGCCGGCACGac  >  1:1165689/1‑48 (MQ=255) aaTGCCATTTGCCGTCAGACGTGCAGCAGGTTTAATCGCCGGCACGac  >  1:1197859/1‑48 (MQ=255) aaTGCCATTTGCCGTCAGACGTGCAGCAGGTTTAATCGCCGGCACGac  >  1:1202338/1‑48 (MQ=255) aaTGCCATTTGCCGTCAGACGTGCAGCAGGTTTAATCGCCGGCACGac  >  1:1216398/1‑48 (MQ=255) aaTGCCATTTGCCGTCAGACGTGCAGCAGGTTTAATCGCCGGCACGac  >  1:1237653/1‑48 (MQ=255) aaTGCCATTTGCCGTCAGACGTGCAGCAGGTTTAATCGCCGGCACGac  >  1:1264395/1‑48 (MQ=255) aaTGCCATTTGCCGTCAGACGTGCAGCAGGTTTAATCGCCGGCACGac  >  1:1277513/1‑48 (MQ=255) aaTGCCATTTGCCGTCAGACGTGCAGCAGGTTTAATCGCCGGCACGac  >  1:129926/1‑48 (MQ=255) aaTGCCATTTGCCGTCAGACGTGCAGCAGGTTTAATCGCCGGCACGac  >  1:1003981/1‑48 (MQ=255) aaTGCCATTTGCCGTCAGACGTGCAGCAGGTTTAATCGCCGGCACGac  >  1:1354936/1‑48 (MQ=255) aaTGCCATTTGCCGTCAGACGTGCAGCAGGTTTAATCGCCGGCACGac  >  1:1422658/1‑48 (MQ=255) aaTGCCATTTGCCGTCAGACGTGCAGCAGGTTTAATCGCCGGCACGac  >  1:1432114/1‑48 (MQ=255) aaTGCCATTTGCCGTCAGACGTGCAGCAGGTTTAATCGCCGGCACGac  >  1:1442811/1‑48 (MQ=255) aaTGCCATTTGCCGTCAGACGTGCAGCAGGTTTAATCGCCGGCACGac  >  1:213396/1‑48 (MQ=255) aaTGCCATTTGCCGTCAGACGTGCAGCAGGTTTAATCGCCGGCACGac  >  1:216415/1‑48 (MQ=255) aaTGCCATTTGCCGTCAGACGTGCAGCAGGTTTAATCGCCGGCACGac  >  1:227910/1‑48 (MQ=255) aaTGCCATTTGCCGTCAGACGTGCAGCAGGTTTAATCGCCGGCACGac  >  1:238623/1‑48 (MQ=255) aaTGCCATTTGCCGTCAGACGTGCAGCAGGTTTAATCGCCGGCACGac  >  1:240049/1‑48 (MQ=255) aaTGCCATTTGCCGTCAGACGTGCAGCAGGTTTAATCGCCGGCACGac  >  1:295915/1‑48 (MQ=255) aaTGCCATTTGCCGTCAGACGTGCAGCAGGTTTAATCGCCGGCACGac  >  1:302555/1‑48 (MQ=255) aaTGCCATTTGCCGTCAGACGTGCAGCAGGTTTAATCGCCGGCACGac  >  1:335555/1‑48 (MQ=255)                                                | AATGCCATTTGCCGTCAGACGTGCAGCAGGTTTAATCGCCGGCACGAC  >  W3110S.gb/3470867‑3470914

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑