Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3476228	3476342	115	48 [0]	[0] 21	sthA	pyridine nucleotide transhydrogenase, soluble

CGTGATTAATCAACAAACGCGCATGCGTCAGGGATTTTACGAACGTAATCACTGTGAAATAT  >  W3110S.gb/3476166‑3476227                                                              | cGTGATTAATCAACAAACGCGCATGCGTCAGGGATTTTACGAACGTAATCACTGTGAAatat  >  1:760251/1‑62 (MQ=255) cGTGATTAATCAACAAACGCGCATGCGTCAGGGATTTTACGAACGTAATCACTGTGAAatat  >  1:329308/1‑62 (MQ=255) cGTGATTAATCAACAAACGCGCATGCGTCAGGGATTTTACGAACGTAATCACTGTGAAatat  >  1:351025/1‑62 (MQ=255) cGTGATTAATCAACAAACGCGCATGCGTCAGGGATTTTACGAACGTAATCACTGTGAAatat  >  1:359888/1‑62 (MQ=255) cGTGATTAATCAACAAACGCGCATGCGTCAGGGATTTTACGAACGTAATCACTGTGAAatat  >  1:374281/1‑62 (MQ=255) cGTGATTAATCAACAAACGCGCATGCGTCAGGGATTTTACGAACGTAATCACTGTGAAatat  >  1:469045/1‑62 (MQ=255) cGTGATTAATCAACAAACGCGCATGCGTCAGGGATTTTACGAACGTAATCACTGTGAAatat  >  1:483747/1‑62 (MQ=255) cGTGATTAATCAACAAACGCGCATGCGTCAGGGATTTTACGAACGTAATCACTGTGAAatat  >  1:48757/1‑62 (MQ=255) cGTGATTAATCAACAAACGCGCATGCGTCAGGGATTTTACGAACGTAATCACTGTGAAatat  >  1:641548/1‑62 (MQ=255) cGTGATTAATCAACAAACGCGCATGCGTCAGGGATTTTACGAACGTAATCACTGTGAAatat  >  1:644071/1‑62 (MQ=255) cGTGATTAATCAACAAACGCGCATGCGTCAGGGATTTTACGAACGTAATCACTGTGAAatat  >  1:65883/1‑62 (MQ=255) cGTGATTAATCAACAAACGCGCATGCGTCAGGGATTTTACGAACGTAATCACTGTGAAatat  >  1:74797/1‑62 (MQ=255) cGTGATTAATCAACAAACGCGCATGCGTCAGGGATTTTACGAACGTAATCACTGTGAAatat  >  1:324442/1‑62 (MQ=255) cGTGATTAATCAACAAACGCGCATGCGTCAGGGATTTTACGAACGTAATCACTGTGAAatat  >  1:798413/1‑62 (MQ=255) cGTGATTAATCAACAAACGCGCATGCGTCAGGGATTTTACGAACGTAATCACTGTGAAatat  >  1:803559/1‑62 (MQ=255) cGTGATTAATCAACAAACGCGCATGCGTCAGGGATTTTACGAACGTAATCACTGTGAAatat  >  1:811588/1‑62 (MQ=255) cGTGATTAATCAACAAACGCGCATGCGTCAGGGATTTTACGAACGTAATCACTGTGAAatat  >  1:813356/1‑62 (MQ=255) cGTGATTAATCAACAAACGCGCATGCGTCAGGGATTTTACGAACGTAATCACTGTGAAatat  >  1:813438/1‑62 (MQ=255) cGTGATTAATCAACAAACGCGCATGCGTCAGGGATTTTACGAACGTAATCACTGTGAAatat  >  1:825024/1‑62 (MQ=255) cGTGATTAATCAACAAACGCGCATGCGTCAGGGATTTTACGAACGTAATCACTGTGAAatat  >  1:838361/1‑62 (MQ=255) cGTGATTAATCAACAAACGCGCATGCGTCAGGGATTTTACGAACGTAATCACTGTGAAatat  >  1:851914/1‑62 (MQ=255) cGTGATTAATCAACAAACGCGCATGCGTCAGGGATTTTACGAACGTAATCACTGTGAAatat  >  1:893457/1‑62 (MQ=255) cGTGATTAATCAACAAACGCGCATGCGTCAGGGATTTTACGAACGTAATCACTGTGAAatat  >  1:917309/1‑62 (MQ=255) cGTGATTAATCAACAAACGCGCATGCGTCAGGGATTTTACGAACGTAATCACTGTGAAatat  >  1:931221/1‑62 (MQ=255) cGTGATTAATCAACAAACGCGCATGCGTCAGGGATTTTACGAACGTAATCACTGTGAAatat  >  1:1253434/1‑62 (MQ=255) cGTGATTAATCAACAAACGCGCATGCGTCAGGGATTTTACGAACGTAATCACTGTGAAatat  >  1:104912/1‑62 (MQ=255) cGTGATTAATCAACAAACGCGCATGCGTCAGGGATTTTACGAACGTAATCACTGTGAAatat  >  1:1125376/1‑62 (MQ=255) cGTGATTAATCAACAAACGCGCATGCGTCAGGGATTTTACGAACGTAATCACTGTGAAatat  >  1:1136474/1‑62 (MQ=255) cGTGATTAATCAACAAACGCGCATGCGTCAGGGATTTTACGAACGTAATCACTGTGAAatat  >  1:1144798/1‑62 (MQ=255) cGTGATTAATCAACAAACGCGCATGCGTCAGGGATTTTACGAACGTAATCACTGTGAAatat  >  1:1171951/1‑62 (MQ=255) cGTGATTAATCAACAAACGCGCATGCGTCAGGGATTTTACGAACGTAATCACTGTGAAatat  >  1:1187866/1‑62 (MQ=255) cGTGATTAATCAACAAACGCGCATGCGTCAGGGATTTTACGAACGTAATCACTGTGAAatat  >  1:1189527/1‑62 (MQ=255) cGTGATTAATCAACAAACGCGCATGCGTCAGGGATTTTACGAACGTAATCACTGTGAAatat  >  1:1226308/1‑62 (MQ=255) cGTGATTAATCAACAAACGCGCATGCGTCAGGGATTTTACGAACGTAATCACTGTGAAatat  >  1:1233717/1‑62 (MQ=255) cGTGATTAATCAACAAACGCGCATGCGTCAGGGATTTTACGAACGTAATCACTGTGAAatat  >  1:1233915/1‑62 (MQ=255) cGTGATTAATCAACAAACGCGCATGCGTCAGGGATTTTACGAACGTAATCACTGTGAAatat  >  1:1252068/1‑62 (MQ=255) cGTGATTAATCAACAAACGCGCATGCGTCAGGGATTTTACGAACGTAATCACTGTGAAatat  >  1:1033328/1‑62 (MQ=255) cGTGATTAATCAACAAACGCGCATGCGTCAGGGATTTTACGAACGTAATCACTGTGAAatat  >  1:1261278/1‑62 (MQ=255) cGTGATTAATCAACAAACGCGCATGCGTCAGGGATTTTACGAACGTAATCACTGTGAAatat  >  1:1347150/1‑62 (MQ=255) cGTGATTAATCAACAAACGCGCATGCGTCAGGGATTTTACGAACGTAATCACTGTGAAatat  >  1:1412239/1‑62 (MQ=255) cGTGATTAATCAACAAACGCGCATGCGTCAGGGATTTTACGAACGTAATCACTGTGAAatat  >  1:1413753/1‑62 (MQ=255) cGTGATTAATCAACAAACGCGCATGCGTCAGGGATTTTACGAACGTAATCACTGTGAAatat  >  1:1423146/1‑62 (MQ=255) cGTGATTAATCAACAAACGCGCATGCGTCAGGGATTTTACGAACGTAATCACTGTGAAatat  >  1:146204/1‑62 (MQ=255) cGTGATTAATCAACAAACGCGCATGCGTCAGGGATTTTACGAACGTAATCACTGTGAAatat  >  1:16151/1‑62 (MQ=255) cGTGATTAATCAACAAACGCGCATGCGTCAGGGATTTTACGAACGTAATCACTGTGAAatat  >  1:222348/1‑62 (MQ=255) cGTGATTAATCAACAAACGCGCATGCGTCAGGGATTTTACGAACGTAATCACTGTGAAatat  >  1:253480/1‑62 (MQ=255) cGTGATTAATCAACAAACGCGCATGCGTCAGGGATTTTACGAACGTAATCACTGTGAAatat  >  1:302793/1‑62 (MQ=255) cGTGATTAATCAACAAACGCGCATGCGTCAGGGATTTTACGAACGTAATCACTGTGAAatat  >  1:306354/1‑62 (MQ=255)                                                              | CGTGATTAATCAACAAACGCGCATGCGTCAGGGATTTTACGAACGTAATCACTGTGAAATAT  >  W3110S.gb/3476166‑3476227

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑