Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3494498	3494781	284	60 [0]	[0] 42	ptsA	fused predicted PTS enzymes Hpr component, enzyme I component, and enzyme IIA component

GAAAACCGTACCGGGAGAGAGGCAATGGCCCTGATTGTGGAATTTATTTGTGAGCTACCTAA  >  W3110S.gb/3494436‑3494497                                                              | gAAAACCGTCCCGGGAGAGAGGCAATGGCCCTGATTGTGGAATTTATTTGTGAGCTACCTaa  <  1:535078/62‑1 (MQ=255) gAAAACCGTACCGGGAGAGAGGCAATGGCCGTGATTGTGGAATTTATTTGTGAGCTACCTaa  <  1:1412022/62‑1 (MQ=255) gAAAACCGTACCGGGAGAGAGGCAATGGCCCTGATTGTGGAATTTATTTGTGAGCTACCTaa  <  1:694297/62‑1 (MQ=255) gAAAACCGTACCGGGAGAGAGGCAATGGCCCTGATTGTGGAATTTATTTGTGAGCTACCTaa  <  1:390076/62‑1 (MQ=255) gAAAACCGTACCGGGAGAGAGGCAATGGCCCTGATTGTGGAATTTATTTGTGAGCTACCTaa  <  1:419516/62‑1 (MQ=255) gAAAACCGTACCGGGAGAGAGGCAATGGCCCTGATTGTGGAATTTATTTGTGAGCTACCTaa  <  1:426721/62‑1 (MQ=255) gAAAACCGTACCGGGAGAGAGGCAATGGCCCTGATTGTGGAATTTATTTGTGAGCTACCTaa  <  1:434158/62‑1 (MQ=255) gAAAACCGTACCGGGAGAGAGGCAATGGCCCTGATTGTGGAATTTATTTGTGAGCTACCTaa  <  1:442857/62‑1 (MQ=255) gAAAACCGTACCGGGAGAGAGGCAATGGCCCTGATTGTGGAATTTATTTGTGAGCTACCTaa  <  1:476728/62‑1 (MQ=255) gAAAACCGTACCGGGAGAGAGGCAATGGCCCTGATTGTGGAATTTATTTGTGAGCTACCTaa  <  1:505299/62‑1 (MQ=255) gAAAACCGTACCGGGAGAGAGGCAATGGCCCTGATTGTGGAATTTATTTGTGAGCTACCTaa  <  1:531814/62‑1 (MQ=255) gAAAACCGTACCGGGAGAGAGGCAATGGCCCTGATTGTGGAATTTATTTGTGAGCTACCTaa  <  1:604506/62‑1 (MQ=255) gAAAACCGTACCGGGAGAGAGGCAATGGCCCTGATTGTGGAATTTATTTGTGAGCTACCTaa  <  1:644522/62‑1 (MQ=255) gAAAACCGTACCGGGAGAGAGGCAATGGCCCTGATTGTGGAATTTATTTGTGAGCTACCTaa  <  1:665905/62‑1 (MQ=255) gAAAACCGTACCGGGAGAGAGGCAATGGCCCTGATTGTGGAATTTATTTGTGAGCTACCTaa  <  1:1108197/62‑1 (MQ=255) gAAAACCGTACCGGGAGAGAGGCAATGGCCCTGATTGTGGAATTTATTTGTGAGCTACCTaa  <  1:707859/62‑1 (MQ=255) gAAAACCGTACCGGGAGAGAGGCAATGGCCCTGATTGTGGAATTTATTTGTGAGCTACCTaa  <  1:737603/62‑1 (MQ=255) gAAAACCGTACCGGGAGAGAGGCAATGGCCCTGATTGTGGAATTTATTTGTGAGCTACCTaa  <  1:778385/62‑1 (MQ=255) gAAAACCGTACCGGGAGAGAGGCAATGGCCCTGATTGTGGAATTTATTTGTGAGCTACCTaa  <  1:815248/62‑1 (MQ=255) gAAAACCGTACCGGGAGAGAGGCAATGGCCCTGATTGTGGAATTTATTTGTGAGCTACCTaa  <  1:818410/62‑1 (MQ=255) gAAAACCGTACCGGGAGAGAGGCAATGGCCCTGATTGTGGAATTTATTTGTGAGCTACCTaa  <  1:858335/62‑1 (MQ=255) gAAAACCGTACCGGGAGAGAGGCAATGGCCCTGATTGTGGAATTTATTTGTGAGCTACCTaa  <  1:858360/62‑1 (MQ=255) gAAAACCGTACCGGGAGAGAGGCAATGGCCCTGATTGTGGAATTTATTTGTGAGCTACCTaa  <  1:899368/62‑1 (MQ=255) gAAAACCGTACCGGGAGAGAGGCAATGGCCCTGATTGTGGAATTTATTTGTGAGCTACCTaa  <  1:909775/62‑1 (MQ=255) gAAAACCGTACCGGGAGAGAGGCAATGGCCCTGATTGTGGAATTTATTTGTGAGCTACCTaa  <  1:922122/62‑1 (MQ=255) gAAAACCGTACCGGGAGAGAGGCAATGGCCCTGATTGTGGAATTTATTTGTGAGCTACCTaa  <  1:942950/62‑1 (MQ=255) gAAAACCGTACCGGGAGAGAGGCAATGGCCCTGATTGTGGAATTTATTTGTGAGCTACCTaa  <  1:981403/62‑1 (MQ=255) gAAAACCGTACCGGGAGAGAGGCAATGGCCCTGATTGTGGAATTTATTTGTGAGCTACCTaa  <  1:1417901/62‑1 (MQ=255) gAAAACCGTACCGGGAGAGAGGCAATGGCCCTGATTGTGGAATTTATTTGTGAGCTACCTaa  <  1:1261780/62‑1 (MQ=255) gAAAACCGTACCGGGAGAGAGGCAATGGCCCTGATTGTGGAATTTATTTGTGAGCTACCTaa  <  1:1270146/62‑1 (MQ=255) gAAAACCGTACCGGGAGAGAGGCAATGGCCCTGATTGTGGAATTTATTTGTGAGCTACCTaa  <  1:1306531/62‑1 (MQ=255) gAAAACCGTACCGGGAGAGAGGCAATGGCCCTGATTGTGGAATTTATTTGTGAGCTACCTaa  <  1:1308566/62‑1 (MQ=255) gAAAACCGTACCGGGAGAGAGGCAATGGCCCTGATTGTGGAATTTATTTGTGAGCTACCTaa  <  1:1334162/62‑1 (MQ=255) gAAAACCGTACCGGGAGAGAGGCAATGGCCCTGATTGTGGAATTTATTTGTGAGCTACCTaa  <  1:1339625/62‑1 (MQ=255) gAAAACCGTACCGGGAGAGAGGCAATGGCCCTGATTGTGGAATTTATTTGTGAGCTACCTaa  <  1:1258216/62‑1 (MQ=255) gAAAACCGTACCGGGAGAGAGGCAATGGCCCTGATTGTGGAATTTATTTGTGAGCTACCTaa  <  1:1178984/62‑1 (MQ=255) gAAAACCGTACCGGGAGAGAGGCAATGGCCCTGATTGTGGAATTTATTTGTGAGCTACCTaa  <  1:1377182/62‑1 (MQ=255) gAAAACCGTACCGGGAGAGAGGCAATGGCCCTGATTGTGGAATTTATTTGTGAGCTACCTaa  <  1:1379558/62‑1 (MQ=255) gAAAACCGTACCGGGAGAGAGGCAATGGCCCTGATTGTGGAATTTATTTGTGAGCTACCTaa  <  1:1412408/62‑1 (MQ=255) gAAAACCGTACCGGGAGAGAGGCAATGGCCCTGATTGTGGAATTTATTTGTGAGCTACCTaa  <  1:1430353/62‑1 (MQ=255) gAAAACCGTACCGGGAGAGAGGCAATGGCCCTGATTGTGGAATTTATTTGTGAGCTACCTaa  <  1:1173277/62‑1 (MQ=255) gAAAACCGTACCGGGAGAGAGGCAATGGCCCTGATTGTGGAATTTATTTGTGAGCTACCTaa  <  1:175202/62‑1 (MQ=255) gAAAACCGTACCGGGAGAGAGGCAATGGCCCTGATTGTGGAATTTATTTGTGAGCTACCTaa  <  1:1171454/62‑1 (MQ=255) gAAAACCGTACCGGGAGAGAGGCAATGGCCCTGATTGTGGAATTTATTTGTGAGCTACCTaa  <  1:225867/62‑1 (MQ=255) gAAAACCGTACCGGGAGAGAGGCAATGGCCCTGATTGTGGAATTTATTTGTGAGCTACCTaa  <  1:230245/62‑1 (MQ=255) gAAAACCGTACCGGGAGAGAGGCAATGGCCCTGATTGTGGAATTTATTTGTGAGCTACCTaa  <  1:27216/62‑1 (MQ=255) gAAAACCGTACCGGGAGAGAGGCAATGGCCCTGATTGTGGAATTTATTTGTGAGCTACCTaa  <  1:105386/62‑1 (MQ=255) gAAAACCGTACCGGGAGAGAGGCAATGGCCCTGATTGTGGAATTTATTTGTGAGCTACCTaa  <  1:384728/62‑1 (MQ=255) gAAAACCGTACCGGGAGAGAGGCAATGGCCCTGATTGTGGAATTTATTTGTGAGCTACCTaa  <  1:324869/62‑1 (MQ=255) gAAAACCGTACCGGGAGAGAGGCAATGGCCCTGATTGTGGAATTTATTTGTGAGCTACCTaa  <  1:335910/62‑1 (MQ=255)  aaaaCCGTACCGGGAGAGAGGCAATGGCCCTGATTGTGGAATTTATTTGTGAGCTACCTaa  <  1:995646/61‑1 (MQ=255)  aaaaCCGTACCGGGAGAGAGGCAATGGCCCTGATTGTGGAATTTATTTGTGAGCTACCTaa  <  1:88389/61‑1 (MQ=255)  aaaaCCGTACCGGGAGAGAGGCAATGGCCCTGATTGTGGAATTTATTTGTGAGCTACCTaa  <  1:87634/61‑1 (MQ=255)  aaaaCCGTACCGGGAGAGAGGCAATGGCCCTGATTGTGGAATTTATTTGTGAGCTACCTaa  <  1:832520/61‑1 (MQ=255)  aaaaCCGTACCGGGAGAGAGGCAATGGCCCTGATTGTGGAATTTATTTGTGAGCTACCTaa  <  1:201596/61‑1 (MQ=255)  aaaaCCGTACCGGGAGAGAGGCAATGGCCCTGATTGTGGAATTTATTTGTGAGCTACCTaa  <  1:297776/61‑1 (MQ=255)  aaaaCCGTACCGGGAGAGAGGCAATGGCCCTGATTGTGGAATTTATTTGTGAGCTACCTaa  <  1:305664/61‑1 (MQ=255)   aaaCCGTACCGGGAGAGAGGCAATGGCCCTGATTGTGGAATTTATTTGTGAGCTACCTaa  <  1:589312/60‑1 (MQ=255)       cGTACCGGGAGAGAGGCAATGGCCCTGATTGTGGAATTTATTTGTGAGCTACCTaa  <  1:729753/56‑1 (MQ=255)           ccGGGAGAGAGGCAATGGCCCTGATTGTGGAATTTATTTGTGAGCTACCTaa  <  1:715924/52‑1 (MQ=255)                                                              | GAAAACCGTACCGGGAGAGAGGCAATGGCCCTGATTGTGGAATTTATTTGTGAGCTACCTAA  >  W3110S.gb/3494436‑3494497

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑