Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3499556	3499575	20	65 [0]	[0] 35	yijF	conserved hypothetical protein

CGGGCTGGCACATATTGGGGTGGTTTCAGATGGCTTCGCCCGCGACGGTACGCCGCTGGTGA  >  W3110S.gb/3499494‑3499555                                                              | cGGGCTGGCACATATTGGGGTGGTTTCAGATGGCTTCGCCCGCGACGGTACGCCGCTGGTGa  >  1:406631/1‑62 (MQ=255) cGGGCTGGCACATATTGGGGTGGTTTCAGATGGCTTCGCCCGCGACGGTACGCCGCTGGTGa  >  1:628912/1‑62 (MQ=255) cGGGCTGGCACATATTGGGGTGGTTTCAGATGGCTTCGCCCGCGACGGTACGCCGCTGGTGa  >  1:487500/1‑62 (MQ=255) cGGGCTGGCACATATTGGGGTGGTTTCAGATGGCTTCGCCCGCGACGGTACGCCGCTGGTGa  >  1:487277/1‑62 (MQ=255) cGGGCTGGCACATATTGGGGTGGTTTCAGATGGCTTCGCCCGCGACGGTACGCCGCTGGTGa  >  1:486446/1‑62 (MQ=255) cGGGCTGGCACATATTGGGGTGGTTTCAGATGGCTTCGCCCGCGACGGTACGCCGCTGGTGa  >  1:453007/1‑62 (MQ=255) cGGGCTGGCACATATTGGGGTGGTTTCAGATGGCTTCGCCCGCGACGGTACGCCGCTGGTGa  >  1:44754/1‑62 (MQ=255) cGGGCTGGCACATATTGGGGTGGTTTCAGATGGCTTCGCCCGCGACGGTACGCCGCTGGTGa  >  1:425936/1‑62 (MQ=255) cGGGCTGGCACATATTGGGGTGGTTTCAGATGGCTTCGCCCGCGACGGTACGCCGCTGGTGa  >  1:411472/1‑62 (MQ=255) cGGGCTGGCACATATTGGGGTGGTTTCAGATGGCTTCGCCCGCGACGGTACGCCGCTGGTGa  >  1:666331/1‑62 (MQ=255) cGGGCTGGCACATATTGGGGTGGTTTCAGATGGCTTCGCCCGCGACGGTACGCCGCTGGTGa  >  1:3809/1‑62 (MQ=255) cGGGCTGGCACATATTGGGGTGGTTTCAGATGGCTTCGCCCGCGACGGTACGCCGCTGGTGa  >  1:370910/1‑62 (MQ=255) cGGGCTGGCACATATTGGGGTGGTTTCAGATGGCTTCGCCCGCGACGGTACGCCGCTGGTGa  >  1:364635/1‑62 (MQ=255) cGGGCTGGCACATATTGGGGTGGTTTCAGATGGCTTCGCCCGCGACGGTACGCCGCTGGTGa  >  1:364530/1‑62 (MQ=255) cGGGCTGGCACATATTGGGGTGGTTTCAGATGGCTTCGCCCGCGACGGTACGCCGCTGGTGa  >  1:329022/1‑62 (MQ=255) cGGGCTGGCACATATTGGGGTGGTTTCAGATGGCTTCGCCCGCGACGGTACGCCGCTGGTGa  >  1:308368/1‑62 (MQ=255) cGGGCTGGCACATATTGGGGTGGTTTCAGATGGCTTCGCCCGCGACGGTACGCCGCTGGTGa  >  1:254365/1‑62 (MQ=255) cGGGCTGGCACATATTGGGGTGGTTTCAGATGGCTTCGCCCGCGACGGTACGCCGCTGGTGa  >  1:24182/1‑62 (MQ=255) cGGGCTGGCACATATTGGGGTGGTTTCAGATGGCTTCGCCCGCGACGGTACGCCGCTGGTGa  >  1:671191/1‑62 (MQ=255) cGGGCTGGCACATATTGGGGTGGTTTCAGATGGCTTCGCCCGCGACGGTACGCCGCTGGTGa  >  1:704799/1‑62 (MQ=255) cGGGCTGGCACATATTGGGGTGGTTTCAGATGGCTTCGCCCGCGACGGTACGCCGCTGGTGa  >  1:705733/1‑62 (MQ=255) cGGGCTGGCACATATTGGGGTGGTTTCAGATGGCTTCGCCCGCGACGGTACGCCGCTGGTGa  >  1:722503/1‑62 (MQ=255) cGGGCTGGCACATATTGGGGTGGTTTCAGATGGCTTCGCCCGCGACGGTACGCCGCTGGTGa  >  1:772419/1‑62 (MQ=255) cGGGCTGGCACATATTGGGGTGGTTTCAGATGGCTTCGCCCGCGACGGTACGCCGCTGGTGa  >  1:802865/1‑62 (MQ=255) cGGGCTGGCACATATTGGGGTGGTTTCAGATGGCTTCGCCCGCGACGGTACGCCGCTGGTGa  >  1:825115/1‑62 (MQ=255) cGGGCTGGCACATATTGGGGTGGTTTCAGATGGCTTCGCCCGCGACGGTACGCCGCTGGTGa  >  1:845840/1‑62 (MQ=255) cGGGCTGGCACATATTGGGGTGGTTTCAGATGGCTTCGCCCGCGACGGTACGCCGCTGGTGa  >  1:877529/1‑62 (MQ=255) cGGGCTGGCACATATTGGGGTGGTTTCAGATGGCTTCGCCCGCGACGGTACGCCGCTGGTGa  >  1:898849/1‑62 (MQ=255) cGGGCTGGCACATATTGGGGTGGTTTCAGATGGCTTCGCCCGCGACGGTACGCCGCTGGTGa  >  1:913576/1‑62 (MQ=255) cGGGCTGGCACATATTGGGGTGGTTTCAGATGGCTTCGCCCGCGACGGTACGCCGCTGGTGa  >  1:953209/1‑62 (MQ=255) cGGGCTGGCACATATTGGGGTGGTTTCAGATGGCTTCGCCCGCGACGGTACGCCGCTGGTGa  >  1:954952/1‑62 (MQ=255) cGGGCTGGCACATATTGGGGTGGTTTCAGATGGCTTCGCCCGCGACGGTACGCCGCTGGTGa  >  1:969915/1‑62 (MQ=255) cGGGCTGGCACATATTGGGGTGGTTTCAGATGGCTTCGCCCGCGACGGTACGCCGCTGGTGa  >  1:983899/1‑62 (MQ=255) cGGGCTGGCACATATTGGGGTGGTTTCAGATGGCTTCGCCCGCGACGGTACGCCGCTGGTGa  >  1:1293429/1‑62 (MQ=255) cGGGCTGGCACATATTGGGGTGGTTTCAGATGGCTTCGCCCGCGACGGTACGCCGCTGGTGa  >  1:1060547/1‑62 (MQ=255) cGGGCTGGCACATATTGGGGTGGTTTCAGATGGCTTCGCCCGCGACGGTACGCCGCTGGTGa  >  1:1085581/1‑62 (MQ=255) cGGGCTGGCACATATTGGGGTGGTTTCAGATGGCTTCGCCCGCGACGGTACGCCGCTGGTGa  >  1:1111295/1‑62 (MQ=255) cGGGCTGGCACATATTGGGGTGGTTTCAGATGGCTTCGCCCGCGACGGTACGCCGCTGGTGa  >  1:1125627/1‑62 (MQ=255) cGGGCTGGCACATATTGGGGTGGTTTCAGATGGCTTCGCCCGCGACGGTACGCCGCTGGTGa  >  1:115287/1‑62 (MQ=255) cGGGCTGGCACATATTGGGGTGGTTTCAGATGGCTTCGCCCGCGACGGTACGCCGCTGGTGa  >  1:1153096/1‑62 (MQ=255) cGGGCTGGCACATATTGGGGTGGTTTCAGATGGCTTCGCCCGCGACGGTACGCCGCTGGTGa  >  1:1167251/1‑62 (MQ=255) cGGGCTGGCACATATTGGGGTGGTTTCAGATGGCTTCGCCCGCGACGGTACGCCGCTGGTGa  >  1:1192501/1‑62 (MQ=255) cGGGCTGGCACATATTGGGGTGGTTTCAGATGGCTTCGCCCGCGACGGTACGCCGCTGGTGa  >  1:1211911/1‑62 (MQ=255) cGGGCTGGCACATATTGGGGTGGTTTCAGATGGCTTCGCCCGCGACGGTACGCCGCTGGTGa  >  1:1232472/1‑62 (MQ=255) cGGGCTGGCACATATTGGGGTGGTTTCAGATGGCTTCGCCCGCGACGGTACGCCGCTGGTGa  >  1:1239244/1‑62 (MQ=255) cGGGCTGGCACATATTGGGGTGGTTTCAGATGGCTTCGCCCGCGACGGTACGCCGCTGGTGa  >  1:1250359/1‑62 (MQ=255) cGGGCTGGCACATATTGGGGTGGTTTCAGATGGCTTCGCCCGCGACGGTACGCCGCTGGTGa  >  1:1256178/1‑62 (MQ=255) cGGGCTGGCACATATTGGGGTGGTTTCAGATGGCTTCGCCCGCGACGGTACGCCGCTGGTGa  >  1:1258568/1‑62 (MQ=255) cGGGCTGGCACATATTGGGGTGGTTTCAGATGGCTTCGCCCGCGACGGTACGCCGCTGGTGa  >  1:1275882/1‑62 (MQ=255) cGGGCTGGCACATATTGGGGTGGTTTCAGATGGCTTCGCCCGCGACGGTACGCCGCTGGTGa  >  1:1059032/1‑62 (MQ=255) cGGGCTGGCACATATTGGGGTGGTTTCAGATGGCTTCGCCCGCGACGGTACGCCGCTGGTGa  >  1:129928/1‑62 (MQ=255) cGGGCTGGCACATATTGGGGTGGTTTCAGATGGCTTCGCCCGCGACGGTACGCCGCTGGTGa  >  1:131055/1‑62 (MQ=255) cGGGCTGGCACATATTGGGGTGGTTTCAGATGGCTTCGCCCGCGACGGTACGCCGCTGGTGa  >  1:1339806/1‑62 (MQ=255) cGGGCTGGCACATATTGGGGTGGTTTCAGATGGCTTCGCCCGCGACGGTACGCCGCTGGTGa  >  1:1343003/1‑62 (MQ=255) cGGGCTGGCACATATTGGGGTGGTTTCAGATGGCTTCGCCCGCGACGGTACGCCGCTGGTGa  >  1:1364458/1‑62 (MQ=255) cGGGCTGGCACATATTGGGGTGGTTTCAGATGGCTTCGCCCGCGACGGTACGCCGCTGGTGa  >  1:1433787/1‑62 (MQ=255) cGGGCTGGCACATATTGGGGTGGTTTCAGATGGCTTCGCCCGCGACGGTACGCCGCTGGTGa  >  1:1441086/1‑62 (MQ=255) cGGGCTGGCACATATTGGGGTGGTTTCAGATGGCTTCGCCCGCGACGGTACGCCGCTGGTGa  >  1:162322/1‑62 (MQ=255) cGGGCTGGCACATATTGGGGTGGTTTCAGATGGCTTCGCCCGCGACGGTACGCCGCTGGTGa  >  1:170811/1‑62 (MQ=255) cGGGCTGGCACATATTGGGGTGGTTTCAGATGGCTTCGCCCGCGACGGTACGCCGCTGGTGa  >  1:172611/1‑62 (MQ=255) cGGGCTGGCACATATTGGGGTGGTTTCAGATGGCTTCGCCCGCGACGGTACGCCGCTGGTGa  >  1:174909/1‑62 (MQ=255) cGGGCTGGCACATATTGGGGTGGTTTCAGATGGCTTCGCCCGCGACGGTACGCCGCTGGTGa  >  1:177636/1‑62 (MQ=255) cGGGCTGGCACATATTGGGGTGGTTTCAGATGGCTTCGCCCGCGACGGTACGCCGCTGGTGa  >  1:182511/1‑62 (MQ=255) cGGGCTGGCACATATTGGGGTGGTTTCAGATGGCTTCGCCCGCGACGGTACGCCGCTGGTGa  >  1:186474/1‑62 (MQ=255) cGGGCTGGCACATATTGGGGTGGTTTCAGATGGCTTCGCCCGCGACGGTACGCCGCTGGTGa  >  1:21181/1‑62 (MQ=255)                                                              | CGGGCTGGCACATATTGGGGTGGTTTCAGATGGCTTCGCCCGCGACGGTACGCCGCTGGTGA  >  W3110S.gb/3499494‑3499555

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑