Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3505543	3505550	8	51 [0]	[0] 5	metL	fused aspartokinase II and homoserine dehydrogenase II

CTGCGCGGAAGACGGACTGATGCAGCCCCTGAATCAGGCTTTCGGTCGGGCCGGTGCGCAGT  >  W3110S.gb/3505481‑3505542                                                              | cTGCGCGGAAGACGGACTGATGCAGCCCCTGAATCAGGCTTTCGGTCGGGCCGGTGCGCAGt  >  1:717463/1‑62 (MQ=255) cTGCGCGGAAGACGGACTGATGCAGCCCCTGAATCAGGCTTTCGGTCGGGCCGGTGCGCAGt  >  1:45509/1‑62 (MQ=255) cTGCGCGGAAGACGGACTGATGCAGCCCCTGAATCAGGCTTTCGGTCGGGCCGGTGCGCAGt  >  1:459090/1‑62 (MQ=255) cTGCGCGGAAGACGGACTGATGCAGCCCCTGAATCAGGCTTTCGGTCGGGCCGGTGCGCAGt  >  1:462316/1‑62 (MQ=255) cTGCGCGGAAGACGGACTGATGCAGCCCCTGAATCAGGCTTTCGGTCGGGCCGGTGCGCAGt  >  1:472293/1‑62 (MQ=255) cTGCGCGGAAGACGGACTGATGCAGCCCCTGAATCAGGCTTTCGGTCGGGCCGGTGCGCAGt  >  1:478043/1‑62 (MQ=255) cTGCGCGGAAGACGGACTGATGCAGCCCCTGAATCAGGCTTTCGGTCGGGCCGGTGCGCAGt  >  1:499517/1‑62 (MQ=255) cTGCGCGGAAGACGGACTGATGCAGCCCCTGAATCAGGCTTTCGGTCGGGCCGGTGCGCAGt  >  1:572330/1‑62 (MQ=255) cTGCGCGGAAGACGGACTGATGCAGCCCCTGAATCAGGCTTTCGGTCGGGCCGGTGCGCAGt  >  1:574305/1‑62 (MQ=255) cTGCGCGGAAGACGGACTGATGCAGCCCCTGAATCAGGCTTTCGGTCGGGCCGGTGCGCAGt  >  1:625731/1‑62 (MQ=255) cTGCGCGGAAGACGGACTGATGCAGCCCCTGAATCAGGCTTTCGGTCGGGCCGGTGCGCAGt  >  1:642504/1‑62 (MQ=255) cTGCGCGGAAGACGGACTGATGCAGCCCCTGAATCAGGCTTTCGGTCGGGCCGGTGCGCAGt  >  1:667622/1‑62 (MQ=255) cTGCGCGGAAGACGGACTGATGCAGCCCCTGAATCAGGCTTTCGGTCGGGCCGGTGCGCAGt  >  1:684673/1‑62 (MQ=255) cTGCGCGGAAGACGGACTGATGCAGCCCCTGAATCAGGCTTTCGGTCGGGCCGGTGCGCAGt  >  1:418129/1‑62 (MQ=255) cTGCGCGGAAGACGGACTGATGCAGCCCCTGAATCAGGCTTTCGGTCGGGCCGGTGCGCAGt  >  1:719969/1‑62 (MQ=255) cTGCGCGGAAGACGGACTGATGCAGCCCCTGAATCAGGCTTTCGGTCGGGCCGGTGCGCAGt  >  1:772641/1‑62 (MQ=255) cTGCGCGGAAGACGGACTGATGCAGCCCCTGAATCAGGCTTTCGGTCGGGCCGGTGCGCAGt  >  1:789581/1‑62 (MQ=255) cTGCGCGGAAGACGGACTGATGCAGCCCCTGAATCAGGCTTTCGGTCGGGCCGGTGCGCAGt  >  1:801047/1‑62 (MQ=255) cTGCGCGGAAGACGGACTGATGCAGCCCCTGAATCAGGCTTTCGGTCGGGCCGGTGCGCAGt  >  1:812813/1‑62 (MQ=255) cTGCGCGGAAGACGGACTGATGCAGCCCCTGAATCAGGCTTTCGGTCGGGCCGGTGCGCAGt  >  1:876958/1‑62 (MQ=255) cTGCGCGGAAGACGGACTGATGCAGCCCCTGAATCAGGCTTTCGGTCGGGCCGGTGCGCAGt  >  1:898330/1‑62 (MQ=255) cTGCGCGGAAGACGGACTGATGCAGCCCCTGAATCAGGCTTTCGGTCGGGCCGGTGCGCAGt  >  1:91384/1‑62 (MQ=255) cTGCGCGGAAGACGGACTGATGCAGCCCCTGAATCAGGCTTTCGGTCGGGCCGGTGCGCAGt  >  1:922669/1‑62 (MQ=255) cTGCGCGGAAGACGGACTGATGCAGCCCCTGAATCAGGCTTTCGGTCGGGCCGGTGCGCAGt  >  1:931902/1‑62 (MQ=255) cTGCGCGGAAGACGGACTGATGCAGCCCCTGAATCAGGCTTTCGGTCGGGCCGGTGCGCAGt  >  1:976673/1‑62 (MQ=255) cTGCGCGGAAGACGGACTGATGCAGCCCCTGAATCAGGCTTTCGGTCGGGCCGGTGCGCAGt  >  1:1301168/1‑62 (MQ=255) cTGCGCGGAAGACGGACTGATGCAGCCCCTGAATCAGGCTTTCGGTCGGGCCGGTGCGCAGt  >  1:1005651/1‑62 (MQ=255) cTGCGCGGAAGACGGACTGATGCAGCCCCTGAATCAGGCTTTCGGTCGGGCCGGTGCGCAGt  >  1:1033085/1‑62 (MQ=255) cTGCGCGGAAGACGGACTGATGCAGCCCCTGAATCAGGCTTTCGGTCGGGCCGGTGCGCAGt  >  1:1046340/1‑62 (MQ=255) cTGCGCGGAAGACGGACTGATGCAGCCCCTGAATCAGGCTTTCGGTCGGGCCGGTGCGCAGt  >  1:1061975/1‑62 (MQ=255) cTGCGCGGAAGACGGACTGATGCAGCCCCTGAATCAGGCTTTCGGTCGGGCCGGTGCGCAGt  >  1:1089305/1‑62 (MQ=255) cTGCGCGGAAGACGGACTGATGCAGCCCCTGAATCAGGCTTTCGGTCGGGCCGGTGCGCAGt  >  1:1147820/1‑62 (MQ=255) cTGCGCGGAAGACGGACTGATGCAGCCCCTGAATCAGGCTTTCGGTCGGGCCGGTGCGCAGt  >  1:118842/1‑62 (MQ=255) cTGCGCGGAAGACGGACTGATGCAGCCCCTGAATCAGGCTTTCGGTCGGGCCGGTGCGCAGt  >  1:1199278/1‑62 (MQ=255) cTGCGCGGAAGACGGACTGATGCAGCCCCTGAATCAGGCTTTCGGTCGGGCCGGTGCGCAGt  >  1:1217125/1‑62 (MQ=255) cTGCGCGGAAGACGGACTGATGCAGCCCCTGAATCAGGCTTTCGGTCGGGCCGGTGCGCAGt  >  1:1270246/1‑62 (MQ=255) cTGCGCGGAAGACGGACTGATGCAGCCCCTGAATCAGGCTTTCGGTCGGGCCGGTGCGCAGt  >  1:1271115/1‑62 (MQ=255) cTGCGCGGAAGACGGACTGATGCAGCCCCTGAATCAGGCTTTCGGTCGGGCCGGTGCGCAGt  >  1:1001440/1‑62 (MQ=255) cTGCGCGGAAGACGGACTGATGCAGCCCCTGAATCAGGCTTTCGGTCGGGCCGGTGCGCAGt  >  1:1387488/1‑62 (MQ=255) cTGCGCGGAAGACGGACTGATGCAGCCCCTGAATCAGGCTTTCGGTCGGGCCGGTGCGCAGt  >  1:1457005/1‑62 (MQ=255) cTGCGCGGAAGACGGACTGATGCAGCCCCTGAATCAGGCTTTCGGTCGGGCCGGTGCGCAGt  >  1:1460511/1‑62 (MQ=255) cTGCGCGGAAGACGGACTGATGCAGCCCCTGAATCAGGCTTTCGGTCGGGCCGGTGCGCAGt  >  1:1460845/1‑62 (MQ=255) cTGCGCGGAAGACGGACTGATGCAGCCCCTGAATCAGGCTTTCGGTCGGGCCGGTGCGCAGt  >  1:1471168/1‑62 (MQ=255) cTGCGCGGAAGACGGACTGATGCAGCCCCTGAATCAGGCTTTCGGTCGGGCCGGTGCGCAGt  >  1:219277/1‑62 (MQ=255) cTGCGCGGAAGACGGACTGATGCAGCCCCTGAATCAGGCTTTCGGTCGGGCCGGTGCGCAGt  >  1:245226/1‑62 (MQ=255) cTGCGCGGAAGACGGACTGATGCAGCCCCTGAATCAGGCTTTCGGTCGGGCCGGTGCGCAGt  >  1:246963/1‑62 (MQ=255) cTGCGCGGAAGACGGACTGATGCAGCCCCTGAATCAGGCTTTCGGTCGGGCCGGTGCGCAGt  >  1:345924/1‑62 (MQ=255) cTGCGCGGAAGACGGACTGATGCAGCCCCTGAATCAGGCTTTCGGTCGGGCCGGTGCGCAGt  >  1:361620/1‑62 (MQ=255) cTGCGCGGAAGACGGACTGATGCAGCCCCTGAATCAGGCTTTCGGTCGGGCCGGTGCGCAGt  >  1:387684/1‑62 (MQ=255) cTGCGCGGAAGACGGACTGATGCAGCCCCTGAATCAGGCTTTCGGTCGGGCCGGTGCGCAGt  >  1:40704/1‑62 (MQ=255) cTGCGCGGAAGACGGACTGATGCAGCCACTGAATCAGGCTTTCGGTCGGGCCGGTGCGCAGt  >  1:826603/1‑62 (MQ=255)                                                              | CTGCGCGGAAGACGGACTGATGCAGCCCCTGAATCAGGCTTTCGGTCGGGCCGGTGCGCAGT  >  W3110S.gb/3505481‑3505542

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑