Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3531811	3532060	250	9 [0]	[0] 24	cpxA	sensory histidine kinase in two‑component regulatory system with CpxR

TGACGCTGGCGCTGGTGTTGATGTTGGTTTTGATGTTACCCAAGCTCGATTCACGCCAGATG  >  W3110S.gb/3531749‑3531810                                                              | tGACGCTGGCGCTGGTGTTGATGTTGGTTTTGATGTTACCCAAGCTCGATTCCCGCCAGATg  >  1:833818/1‑62 (MQ=255) tGACGCTGGCGCTGGTGTTGATGTTGGTTTTGATGTTACCCAAGCTCGATTCACGCCAGATg  >  1:138948/1‑62 (MQ=255) tGACGCTGGCGCTGGTGTTGATGTTGGTTTTGATGTTACCCAAGCTCGATTCACGCCAGATg  >  1:241612/1‑62 (MQ=255) tGACGCTGGCGCTGGTGTTGATGTTGGTTTTGATGTTACCCAAGCTCGATTCACGCCAGATg  >  1:263480/1‑62 (MQ=255) tGACGCTGGCGCTGGTGTTGATGTTGGTTTTGATGTTACCCAAGCTCGATTCACGCCAGATg  >  1:287913/1‑62 (MQ=255) tGACGCTGGCGCTGGTGTTGATGTTGGTTTTGATGTTACCCAAGCTCGATTCACGCCAGATg  >  1:363381/1‑62 (MQ=255) tGACGCTGGCGCTGGTGTTGATGTTGGTTTTGATGTTACCCAAGCTCGATTCACGCCAGATg  >  1:496808/1‑62 (MQ=255) tGACGCTGGCGCTGGTGTTGATGTTGGTTTTGATGTTACCCAAGCTCGATTCACGCCAGATg  >  1:59053/1‑62 (MQ=255) tGACGCTGGCGCTGGTGTTGATGTTGGCTTTGATGTTACCCAAGCTCGATTCACGCCAGATg  >  1:161399/1‑62 (MQ=255)                                                              | TGACGCTGGCGCTGGTGTTGATGTTGGTTTTGATGTTACCCAAGCTCGATTCACGCCAGATG  >  W3110S.gb/3531749‑3531810

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑