Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3537964	3538043	80	49 [0]	[0] 11	rhaR	DNA‑binding transcriptional activator, L‑rhamnose‑binding

CAGACAATCACCAGCTCACAAAAATCATGTGTATGTTCAGCAAAGACATCTTGCGGATAACG  >  W3110S.gb/3537902‑3537963                                                              | cAGACAATCACCAGCTCACAAAAATCATGTGTATGTTCAGCAAAGACATCTTGCGGATAACg  >  1:767391/1‑62 (MQ=255) cAGACAATCACCAGCTCACAAAAATCATGTGTATGTTCAGCAAAGACATCTTGCGGATAACg  >  1:441202/1‑62 (MQ=255) cAGACAATCACCAGCTCACAAAAATCATGTGTATGTTCAGCAAAGACATCTTGCGGATAACg  >  1:468927/1‑62 (MQ=255) cAGACAATCACCAGCTCACAAAAATCATGTGTATGTTCAGCAAAGACATCTTGCGGATAACg  >  1:576952/1‑62 (MQ=255) cAGACAATCACCAGCTCACAAAAATCATGTGTATGTTCAGCAAAGACATCTTGCGGATAACg  >  1:593223/1‑62 (MQ=255) cAGACAATCACCAGCTCACAAAAATCATGTGTATGTTCAGCAAAGACATCTTGCGGATAACg  >  1:613773/1‑62 (MQ=255) cAGACAATCACCAGCTCACAAAAATCATGTGTATGTTCAGCAAAGACATCTTGCGGATAACg  >  1:622687/1‑62 (MQ=255) cAGACAATCACCAGCTCACAAAAATCATGTGTATGTTCAGCAAAGACATCTTGCGGATAACg  >  1:654666/1‑62 (MQ=255) cAGACAATCACCAGCTCACAAAAATCATGTGTATGTTCAGCAAAGACATCTTGCGGATAACg  >  1:665447/1‑62 (MQ=255) cAGACAATCACCAGCTCACAAAAATCATGTGTATGTTCAGCAAAGACATCTTGCGGATAACg  >  1:685386/1‑62 (MQ=255) cAGACAATCACCAGCTCACAAAAATCATGTGTATGTTCAGCAAAGACATCTTGCGGATAACg  >  1:728271/1‑62 (MQ=255) cAGACAATCACCAGCTCACAAAAATCATGTGTATGTTCAGCAAAGACATCTTGCGGATAACg  >  1:748991/1‑62 (MQ=255) cAGACAATCACCAGCTCACAAAAATCATGTGTATGTTCAGCAAAGACATCTTGCGGATAACg  >  1:750174/1‑62 (MQ=255) cAGACAATCACCAGCTCACAAAAATCATGTGTATGTTCAGCAAAGACATCTTGCGGATAACg  >  1:440211/1‑62 (MQ=255) cAGACAATCACCAGCTCACAAAAATCATGTGTATGTTCAGCAAAGACATCTTGCGGATAACg  >  1:808604/1‑62 (MQ=255) cAGACAATCACCAGCTCACAAAAATCATGTGTATGTTCAGCAAAGACATCTTGCGGATAACg  >  1:839286/1‑62 (MQ=255) cAGACAATCACCAGCTCACAAAAATCATGTGTATGTTCAGCAAAGACATCTTGCGGATAACg  >  1:848496/1‑62 (MQ=255) cAGACAATCACCAGCTCACAAAAATCATGTGTATGTTCAGCAAAGACATCTTGCGGATAACg  >  1:882163/1‑62 (MQ=255) cAGACAATCACCAGCTCACAAAAATCATGTGTATGTTCAGCAAAGACATCTTGCGGATAACg  >  1:900250/1‑62 (MQ=255) cAGACAATCACCAGCTCACAAAAATCATGTGTATGTTCAGCAAAGACATCTTGCGGATAACg  >  1:91021/1‑62 (MQ=255) cAGACAATCACCAGCTCACAAAAATCATGTGTATGTTCAGCAAAGACATCTTGCGGATAACg  >  1:929240/1‑62 (MQ=255) cAGACAATCACCAGCTCACAAAAATCATGTGTATGTTCAGCAAAGACATCTTGCGGATAACg  >  1:932967/1‑62 (MQ=255) cAGACAATCACCAGCTCACAAAAATCATGTGTATGTTCAGCAAAGACATCTTGCGGATAACg  >  1:954737/1‑62 (MQ=255) cAGACAATCACCAGCTCACAAAAATCATGTGTATGTTCAGCAAAGACATCTTGCGGATAACg  >  1:961011/1‑62 (MQ=255) cAGACAATCACCAGCTCACAAAAATCATGTGTATGTTCAGCAAAGACATCTTGCGGATAACg  >  1:997576/1‑62 (MQ=255) cAGACAATCACCAGCTCACAAAAATCATGTGTATGTTCAGCAAAGACATCTTGCGGATAACg  >  1:1377529/1‑62 (MQ=255) cAGACAATCACCAGCTCACAAAAATCATGTGTATGTTCAGCAAAGACATCTTGCGGATAACg  >  1:1128295/1‑62 (MQ=255) cAGACAATCACCAGCTCACAAAAATCATGTGTATGTTCAGCAAAGACATCTTGCGGATAACg  >  1:1139929/1‑62 (MQ=255) cAGACAATCACCAGCTCACAAAAATCATGTGTATGTTCAGCAAAGACATCTTGCGGATAACg  >  1:1156432/1‑62 (MQ=255) cAGACAATCACCAGCTCACAAAAATCATGTGTATGTTCAGCAAAGACATCTTGCGGATAACg  >  1:1159265/1‑62 (MQ=255) cAGACAATCACCAGCTCACAAAAATCATGTGTATGTTCAGCAAAGACATCTTGCGGATAACg  >  1:1188393/1‑62 (MQ=255) cAGACAATCACCAGCTCACAAAAATCATGTGTATGTTCAGCAAAGACATCTTGCGGATAACg  >  1:1217196/1‑62 (MQ=255) cAGACAATCACCAGCTCACAAAAATCATGTGTATGTTCAGCAAAGACATCTTGCGGATAACg  >  1:1276250/1‑62 (MQ=255) cAGACAATCACCAGCTCACAAAAATCATGTGTATGTTCAGCAAAGACATCTTGCGGATAACg  >  1:1276873/1‑62 (MQ=255) cAGACAATCACCAGCTCACAAAAATCATGTGTATGTTCAGCAAAGACATCTTGCGGATAACg  >  1:1279521/1‑62 (MQ=255) cAGACAATCACCAGCTCACAAAAATCATGTGTATGTTCAGCAAAGACATCTTGCGGATAACg  >  1:1324781/1‑62 (MQ=255) cAGACAATCACCAGCTCACAAAAATCATGTGTATGTTCAGCAAAGACATCTTGCGGATAACg  >  1:133688/1‑62 (MQ=255) cAGACAATCACCAGCTCACAAAAATCATGTGTATGTTCAGCAAAGACATCTTGCGGATAACg  >  1:1090445/1‑62 (MQ=255) cAGACAATCACCAGCTCACAAAAATCATGTGTATGTTCAGCAAAGACATCTTGCGGATAACg  >  1:1401504/1‑62 (MQ=255) cAGACAATCACCAGCTCACAAAAATCATGTGTATGTTCAGCAAAGACATCTTGCGGATAACg  >  1:1430672/1‑62 (MQ=255) cAGACAATCACCAGCTCACAAAAATCATGTGTATGTTCAGCAAAGACATCTTGCGGATAACg  >  1:153036/1‑62 (MQ=255) cAGACAATCACCAGCTCACAAAAATCATGTGTATGTTCAGCAAAGACATCTTGCGGATAACg  >  1:206232/1‑62 (MQ=255) cAGACAATCACCAGCTCACAAAAATCATGTGTATGTTCAGCAAAGACATCTTGCGGATAACg  >  1:212683/1‑62 (MQ=255) cAGACAATCACCAGCTCACAAAAATCATGTGTATGTTCAGCAAAGACATCTTGCGGATAACg  >  1:214923/1‑62 (MQ=255) cAGACAATCACCAGCTCACAAAAATCATGTGTATGTTCAGCAAAGACATCTTGCGGATAACg  >  1:216469/1‑62 (MQ=255) cAGACAATCACCAGCTCACAAAAATCATGTGTATGTTCAGCAAAGACATCTTGCGGATAACg  >  1:270906/1‑62 (MQ=255) cAGACAATCACCAGCTCACAAAAATCATGTGTATGTTCAGCAAAGACATCTTGCGGATAACg  >  1:29167/1‑62 (MQ=255) cAGACAATCACCAGCTCACAAAAATCATGTGTATGTTCAGCAAAGACATCTTGCGGATAACg  >  1:3485/1‑62 (MQ=255) cAGACAATCACCAGCTCACAAAAATCATGTGTATGTTCAGCAAAGACATCTTGCGGATAACg  >  1:410365/1‑62 (MQ=255)                                                              | CAGACAATCACCAGCTCACAAAAATCATGTGTATGTTCAGCAAAGACATCTTGCGGATAACG  >  W3110S.gb/3537902‑3537963

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑