Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3543896	3544188	293	37 [0]	[0] 51	frvA	predicted enzyme IIA component of PTS

ATATATTTTATGGAGTCCGATTAATGGCAGCTCTTACTGCAAGCTGTATTGACCTGAATAT  >  W3110S.gb/3543835‑3543895                                                             | atatatTTTATGGAGTCCGATTAATGGCAGCTCTTACTGCAAGCTGTATTGACCTGAatat  <  1:595763/61‑1 (MQ=255) atatatTTTATGGAGTCCGATTAATGGCAGCTCTTACTGCAAGCTGTATTGACCTGAatat  <  1:306706/61‑1 (MQ=255) atatatTTTATGGAGTCCGATTAATGGCAGCTCTTACTGCAAGCTGTATTGACCTGAatat  <  1:341357/61‑1 (MQ=255) atatatTTTATGGAGTCCGATTAATGGCAGCTCTTACTGCAAGCTGTATTGACCTGAatat  <  1:414506/61‑1 (MQ=255) atatatTTTATGGAGTCCGATTAATGGCAGCTCTTACTGCAAGCTGTATTGACCTGAatat  <  1:48787/61‑1 (MQ=255) atatatTTTATGGAGTCCGATTAATGGCAGCTCTTACTGCAAGCTGTATTGACCTGAatat  <  1:514095/61‑1 (MQ=255) atatatTTTATGGAGTCCGATTAATGGCAGCTCTTACTGCAAGCTGTATTGACCTGAatat  <  1:565573/61‑1 (MQ=255) atatatTTTATGGAGTCCGATTAATGGCAGCTCTTACTGCAAGCTGTATTGACCTGAatat  <  1:582507/61‑1 (MQ=255) atatatTTTATGGAGTCCGATTAATGGCAGCTCTTACTGCAAGCTGTATTGACCTGAatat  <  1:589443/61‑1 (MQ=255) atatatTTTATGGAGTCCGATTAATGGCAGCTCTTACTGCAAGCTGTATTGACCTGAatat  <  1:285461/61‑1 (MQ=255) atatatTTTATGGAGTCCGATTAATGGCAGCTCTTACTGCAAGCTGTATTGACCTGAatat  <  1:698293/61‑1 (MQ=255) atatatTTTATGGAGTCCGATTAATGGCAGCTCTTACTGCAAGCTGTATTGACCTGAatat  <  1:758266/61‑1 (MQ=255) atatatTTTATGGAGTCCGATTAATGGCAGCTCTTACTGCAAGCTGTATTGACCTGAatat  <  1:770611/61‑1 (MQ=255) atatatTTTATGGAGTCCGATTAATGGCAGCTCTTACTGCAAGCTGTATTGACCTGAatat  <  1:820420/61‑1 (MQ=255) atatatTTTATGGAGTCCGATTAATGGCAGCTCTTACTGCAAGCTGTATTGACCTGAatat  <  1:845678/61‑1 (MQ=255) atatatTTTATGGAGTCCGATTAATGGCAGCTCTTACTGCAAGCTGTATTGACCTGAatat  <  1:872382/61‑1 (MQ=255) atatatTTTATGGAGTCCGATTAATGGCAGCTCTTACTGCAAGCTGTATTGACCTGAatat  <  1:930395/61‑1 (MQ=255) atatatTTTATGGAGTCCGATTAATGGCAGCTCTTACTGCAAGCTGTATTGACCTGAatat  <  1:987508/61‑1 (MQ=255) atatatTTTATGGAGTCCGATTAATGGCAGCTCTTACTGCAAGCTGTATTGACCTGAatat  <  1:1214595/61‑1 (MQ=255) atatatTTTATGGAGTCCGATTAATGGCAGCTCTTACTGCAAGCTGTATTGACCTGAatat  <  1:104255/61‑1 (MQ=255) atatatTTTATGGAGTCCGATTAATGGCAGCTCTTACTGCAAGCTGTATTGACCTGAatat  <  1:1046541/61‑1 (MQ=255) atatatTTTATGGAGTCCGATTAATGGCAGCTCTTACTGCAAGCTGTATTGACCTGAatat  <  1:1052189/61‑1 (MQ=255) atatatTTTATGGAGTCCGATTAATGGCAGCTCTTACTGCAAGCTGTATTGACCTGAatat  <  1:1117312/61‑1 (MQ=255) atatatTTTATGGAGTCCGATTAATGGCAGCTCTTACTGCAAGCTGTATTGACCTGAatat  <  1:1184122/61‑1 (MQ=255) atatatTTTATGGAGTCCGATTAATGGCAGCTCTTACTGCAAGCTGTATTGACCTGAatat  <  1:1184680/61‑1 (MQ=255) atatatTTTATGGAGTCCGATTAATGGCAGCTCTTACTGCAAGCTGTATTGACCTGAatat  <  1:1214091/61‑1 (MQ=255) atatatTTTATGGAGTCCGATTAATGGCAGCTCTTACTGCAAGCTGTATTGACCTGAatat  <  1:1037629/61‑1 (MQ=255) atatatTTTATGGAGTCCGATTAATGGCAGCTCTTACTGCAAGCTGTATTGACCTGAatat  <  1:1231196/61‑1 (MQ=255) atatatTTTATGGAGTCCGATTAATGGCAGCTCTTACTGCAAGCTGTATTGACCTGAatat  <  1:1249487/61‑1 (MQ=255) atatatTTTATGGAGTCCGATTAATGGCAGCTCTTACTGCAAGCTGTATTGACCTGAatat  <  1:1275579/61‑1 (MQ=255) atatatTTTATGGAGTCCGATTAATGGCAGCTCTTACTGCAAGCTGTATTGACCTGAatat  <  1:1338262/61‑1 (MQ=255) atatatTTTATGGAGTCCGATTAATGGCAGCTCTTACTGCAAGCTGTATTGACCTGAatat  <  1:1365428/61‑1 (MQ=255) atatatTTTATGGAGTCCGATTAATGGCAGCTCTTACTGCAAGCTGTATTGACCTGAatat  <  1:1418958/61‑1 (MQ=255) atatatTTTATGGAGTCCGATTAATGGCAGCTCTTACTGCAAGCTGTATTGACCTGAatat  <  1:1448695/61‑1 (MQ=255) atatatTTTATGGAGTCCGATTAATGGCAGCTCTTACTGCAAGCTGTATTGACCTGAatat  <  1:201054/61‑1 (MQ=255) atataaTTTATGGAGTCCGATTAATGGCAGCTCTTACTGCAAGCTGTATTGACCTGAatat  <  1:1116847/61‑1 (MQ=255)           tGGAGTCCGATTAATGGCAGCTCTTACTGCAAGCTGTATTGACCTGAatat  <  1:860972/51‑1 (MQ=255)                                                             | ATATATTTTATGGAGTCCGATTAATGGCAGCTCTTACTGCAAGCTGTATTGACCTGAATAT  >  W3110S.gb/3543835‑3543895

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑