Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3576016	3576045	30	44 [0]	[0] 57	yihL	predicted DNA‑binding transcriptional regulator

CGCCCTTGCTCAATTGCGGCCCGCTGAAAGCTCGCCGACAGCTCCGGACTGTAATTAAATCG  >  W3110S.gb/3575954‑3576015                                                              | cGCCCTTGCTCAATTGCGGCCCGCTGAAAGCTCGCCGACAGCTCCGGACTGTAATTAAATcg  >  1:836457/1‑62 (MQ=255) cGCCCTTGCTCAATTGCGGCCCGCTGAAAGCTCGCCGACAGCTCCGGACTGTAATTAAATcg  >  1:467317/1‑62 (MQ=255) cGCCCTTGCTCAATTGCGGCCCGCTGAAAGCTCGCCGACAGCTCCGGACTGTAATTAAATcg  >  1:495999/1‑62 (MQ=255) cGCCCTTGCTCAATTGCGGCCCGCTGAAAGCTCGCCGACAGCTCCGGACTGTAATTAAATcg  >  1:503396/1‑62 (MQ=255) cGCCCTTGCTCAATTGCGGCCCGCTGAAAGCTCGCCGACAGCTCCGGACTGTAATTAAATcg  >  1:614316/1‑62 (MQ=255) cGCCCTTGCTCAATTGCGGCCCGCTGAAAGCTCGCCGACAGCTCCGGACTGTAATTAAATcg  >  1:661860/1‑62 (MQ=255) cGCCCTTGCTCAATTGCGGCCCGCTGAAAGCTCGCCGACAGCTCCGGACTGTAATTAAATcg  >  1:662136/1‑62 (MQ=255) cGCCCTTGCTCAATTGCGGCCCGCTGAAAGCTCGCCGACAGCTCCGGACTGTAATTAAATcg  >  1:710663/1‑62 (MQ=255) cGCCCTTGCTCAATTGCGGCCCGCTGAAAGCTCGCCGACAGCTCCGGACTGTAATTAAATcg  >  1:776231/1‑62 (MQ=255) cGCCCTTGCTCAATTGCGGCCCGCTGAAAGCTCGCCGACAGCTCCGGACTGTAATTAAATcg  >  1:820050/1‑62 (MQ=255) cGCCCTTGCTCAATTGCGGCCCGCTGAAAGCTCGCCGACAGCTCCGGACTGTAATTAAATcg  >  1:835980/1‑62 (MQ=255) cGCCCTTGCTCAATTGCGGCCCGCTGAAAGCTCGCCGACAGCTCCGGACTGTAATTAAATcg  >  1:465894/1‑62 (MQ=255) cGCCCTTGCTCAATTGCGGCCCGCTGAAAGCTCGCCGACAGCTCCGGACTGTAATTAAATcg  >  1:836490/1‑62 (MQ=255) cGCCCTTGCTCAATTGCGGCCCGCTGAAAGCTCGCCGACAGCTCCGGACTGTAATTAAATcg  >  1:842502/1‑62 (MQ=255) cGCCCTTGCTCAATTGCGGCCCGCTGAAAGCTCGCCGACAGCTCCGGACTGTAATTAAATcg  >  1:855554/1‑62 (MQ=255) cGCCCTTGCTCAATTGCGGCCCGCTGAAAGCTCGCCGACAGCTCCGGACTGTAATTAAATcg  >  1:869854/1‑62 (MQ=255) cGCCCTTGCTCAATTGCGGCCCGCTGAAAGCTCGCCGACAGCTCCGGACTGTAATTAAATcg  >  1:895631/1‑62 (MQ=255) cGCCCTTGCTCAATTGCGGCCCGCTGAAAGCTCGCCGACAGCTCCGGACTGTAATTAAATcg  >  1:908303/1‑62 (MQ=255) cGCCCTTGCTCAATTGCGGCCCGCTGAAAGCTCGCCGACAGCTCCGGACTGTAATTAAATcg  >  1:925199/1‑62 (MQ=255) cGCCCTTGCTCAATTGCGGCCCGCTGAAAGCTCGCCGACAGCTCCGGACTGTAATTAAATcg  >  1:928356/1‑62 (MQ=255) cGCCCTTGCTCAATTGCGGCCCGCTGAAAGCTCGCCGACAGCTCCGGACTGTAATTAAATcg  >  1:945881/1‑62 (MQ=255) cGCCCTTGCTCAATTGCGGCCCGCTGAAAGCTCGCCGACAGCTCCGGACTGTAATTAAATcg  >  1:976226/1‑62 (MQ=255) cGCCCTTGCTCAATTGCGGCCCGCTGAAAGCTCGCCGACAGCTCCGGACTGTAATTAAATcg  >  1:1364581/1‑62 (MQ=255) cGCCCTTGCTCAATTGCGGCCCGCTGAAAGCTCGCCGACAGCTCCGGACTGTAATTAAATcg  >  1:1144623/1‑62 (MQ=255) cGCCCTTGCTCAATTGCGGCCCGCTGAAAGCTCGCCGACAGCTCCGGACTGTAATTAAATcg  >  1:1168289/1‑62 (MQ=255) cGCCCTTGCTCAATTGCGGCCCGCTGAAAGCTCGCCGACAGCTCCGGACTGTAATTAAATcg  >  1:1168452/1‑62 (MQ=255) cGCCCTTGCTCAATTGCGGCCCGCTGAAAGCTCGCCGACAGCTCCGGACTGTAATTAAATcg  >  1:1169951/1‑62 (MQ=255) cGCCCTTGCTCAATTGCGGCCCGCTGAAAGCTCGCCGACAGCTCCGGACTGTAATTAAATcg  >  1:1174552/1‑62 (MQ=255) cGCCCTTGCTCAATTGCGGCCCGCTGAAAGCTCGCCGACAGCTCCGGACTGTAATTAAATcg  >  1:1238411/1‑62 (MQ=255) cGCCCTTGCTCAATTGCGGCCCGCTGAAAGCTCGCCGACAGCTCCGGACTGTAATTAAATcg  >  1:1255581/1‑62 (MQ=255) cGCCCTTGCTCAATTGCGGCCCGCTGAAAGCTCGCCGACAGCTCCGGACTGTAATTAAATcg  >  1:1339091/1‑62 (MQ=255) cGCCCTTGCTCAATTGCGGCCCGCTGAAAGCTCGCCGACAGCTCCGGACTGTAATTAAATcg  >  1:1347541/1‑62 (MQ=255) cGCCCTTGCTCAATTGCGGCCCGCTGAAAGCTCGCCGACAGCTCCGGACTGTAATTAAATcg  >  1:1355462/1‑62 (MQ=255) cGCCCTTGCTCAATTGCGGCCCGCTGAAAGCTCGCCGACAGCTCCGGACTGTAATTAAATcg  >  1:1011324/1‑62 (MQ=255) cGCCCTTGCTCAATTGCGGCCCGCTGAAAGCTCGCCGACAGCTCCGGACTGTAATTAAATcg  >  1:1397608/1‑62 (MQ=255) cGCCCTTGCTCAATTGCGGCCCGCTGAAAGCTCGCCGACAGCTCCGGACTGTAATTAAATcg  >  1:245840/1‑62 (MQ=255) cGCCCTTGCTCAATTGCGGCCCGCTGAAAGCTCGCCGACAGCTCCGGACTGTAATTAAATcg  >  1:260023/1‑62 (MQ=255) cGCCCTTGCTCAATTGCGGCCCGCTGAAAGCTCGCCGACAGCTCCGGACTGTAATTAAATcg  >  1:311994/1‑62 (MQ=255) cGCCCTTGCTCAATTGCGGCCCGCTGAAAGCTCGCCGACAGCTCCGGACTGTAATTAAATcg  >  1:330474/1‑62 (MQ=255) cGCCCTTGCTCAATTGCGGCCCGCTGAAAGCTCGCCGACAGCTCCGGACTGTAATTAAATcg  >  1:348214/1‑62 (MQ=255) cGCCCTTGCTCAATTGCGGCCCGCTGAAAGCTCGCCGACAGCTCCGGACTGTAATTAAATcg  >  1:406634/1‑62 (MQ=255) cGCCCTTGCTCAATTGCGGCCCGCTGAAAGCTCGCCGACAGCTCCGGACTGTAATTAAATcg  >  1:433764/1‑62 (MQ=255) cGCCCTTGCTCAATTGCGGCCCGCTGAAAGCTCGCCGACAGCTCCGGACTGTAATTAAATcg  >  1:455366/1‑62 (MQ=255) cGCCCTTGCTCAATTCCGGCCCGCTGAAAGCTCGCCGACAGCTCCGGACTGTAATTAAATcg  >  1:260777/1‑62 (MQ=255)                                                              | CGCCCTTGCTCAATTGCGGCCCGCTGAAAGCTCGCCGACAGCTCCGGACTGTAATTAAATCG  >  W3110S.gb/3575954‑3576015

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑