Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3582225	3582348	124	40 [0]	[0] 21	glnG	fused DNA‑binding response regulator in two‑component regulatory system with GlnL, nitrogen regulator I (NRI)

CGTGCTGGCAGACGGTCAGTTTTACCGCGTTGGCGGCTATGCGCCGGTGAAAGTGGATGTG  >  W3110S.gb/3582164‑3582224                                                             | cgTGCTGGCAGACGGTCAGTTTTACCGCGTTGGCGGCTATGCGCCGGTGAAAGTGGAtgtg  >  1:689104/1‑61 (MQ=255) cgTGCTGGCAGACGGTCAGTTTTACCGCGTTGGCGGCTATGCGCCGGTGAAAGTGGAtgtg  >  1:417817/1‑61 (MQ=255) cgTGCTGGCAGACGGTCAGTTTTACCGCGTTGGCGGCTATGCGCCGGTGAAAGTGGAtgtg  >  1:469307/1‑61 (MQ=255) cgTGCTGGCAGACGGTCAGTTTTACCGCGTTGGCGGCTATGCGCCGGTGAAAGTGGAtgtg  >  1:472435/1‑61 (MQ=255) cgTGCTGGCAGACGGTCAGTTTTACCGCGTTGGCGGCTATGCGCCGGTGAAAGTGGAtgtg  >  1:491599/1‑61 (MQ=255) cgTGCTGGCAGACGGTCAGTTTTACCGCGTTGGCGGCTATGCGCCGGTGAAAGTGGAtgtg  >  1:524135/1‑61 (MQ=255) cgTGCTGGCAGACGGTCAGTTTTACCGCGTTGGCGGCTATGCGCCGGTGAAAGTGGAtgtg  >  1:546367/1‑61 (MQ=255) cgTGCTGGCAGACGGTCAGTTTTACCGCGTTGGCGGCTATGCGCCGGTGAAAGTGGAtgtg  >  1:589006/1‑61 (MQ=255) cgTGCTGGCAGACGGTCAGTTTTACCGCGTTGGCGGCTATGCGCCGGTGAAAGTGGAtgtg  >  1:607831/1‑61 (MQ=255) cgTGCTGGCAGACGGTCAGTTTTACCGCGTTGGCGGCTATGCGCCGGTGAAAGTGGAtgtg  >  1:616623/1‑61 (MQ=255) cgTGCTGGCAGACGGTCAGTTTTACCGCGTTGGCGGCTATGCGCCGGTGAAAGTGGAtgtg  >  1:40686/1‑61 (MQ=255) cgTGCTGGCAGACGGTCAGTTTTACCGCGTTGGCGGCTATGCGCCGGTGAAAGTGGAtgtg  >  1:746384/1‑61 (MQ=255) cgTGCTGGCAGACGGTCAGTTTTACCGCGTTGGCGGCTATGCGCCGGTGAAAGTGGAtgtg  >  1:770542/1‑61 (MQ=255) cgTGCTGGCAGACGGTCAGTTTTACCGCGTTGGCGGCTATGCGCCGGTGAAAGTGGAtgtg  >  1:79347/1‑61 (MQ=255) cgTGCTGGCAGACGGTCAGTTTTACCGCGTTGGCGGCTATGCGCCGGTGAAAGTGGAtgtg  >  1:825812/1‑61 (MQ=255) cgTGCTGGCAGACGGTCAGTTTTACCGCGTTGGCGGCTATGCGCCGGTGAAAGTGGAtgtg  >  1:890665/1‑61 (MQ=255) cgTGCTGGCAGACGGTCAGTTTTACCGCGTTGGCGGCTATGCGCCGGTGAAAGTGGAtgtg  >  1:942776/1‑61 (MQ=255) cgTGCTGGCAGACGGTCAGTTTTACCGCGTTGGCGGCTATGCGCCGGTGAAAGTGGAtgtg  >  1:97992/1‑61 (MQ=255) cgTGCTGGCAGACGGTCAGTTTTACCGCGTTGGCGGCTATGCGCCGGTGAAAGTGGAtgtg  >  1:980615/1‑61 (MQ=255) cgTGCTGGCAGACGGTCAGTTTTACCGCGTTGGCGGCTATGCGCCGGTGAAAGTGGAtgtg  >  1:999882/1‑61 (MQ=255) cgTGCTGGCAGACGGTCAGTTTTACCGCGTTGGCGGCTATGCGCCGGTGAAAGTGGAtgtg  >  1:1441472/1‑61 (MQ=255) cgTGCTGGCAGACGGTCAGTTTTACCGCGTTGGCGGCTATGCGCCGGTGAAAGTGGAtgtg  >  1:1074217/1‑61 (MQ=255) cgTGCTGGCAGACGGTCAGTTTTACCGCGTTGGCGGCTATGCGCCGGTGAAAGTGGAtgtg  >  1:1154262/1‑61 (MQ=255) cgTGCTGGCAGACGGTCAGTTTTACCGCGTTGGCGGCTATGCGCCGGTGAAAGTGGAtgtg  >  1:1158250/1‑61 (MQ=255) cgTGCTGGCAGACGGTCAGTTTTACCGCGTTGGCGGCTATGCGCCGGTGAAAGTGGAtgtg  >  1:1158557/1‑61 (MQ=255) cgTGCTGGCAGACGGTCAGTTTTACCGCGTTGGCGGCTATGCGCCGGTGAAAGTGGAtgtg  >  1:1184972/1‑61 (MQ=255) cgTGCTGGCAGACGGTCAGTTTTACCGCGTTGGCGGCTATGCGCCGGTGAAAGTGGAtgtg  >  1:1215208/1‑61 (MQ=255) cgTGCTGGCAGACGGTCAGTTTTACCGCGTTGGCGGCTATGCGCCGGTGAAAGTGGAtgtg  >  1:1297146/1‑61 (MQ=255) cgTGCTGGCAGACGGTCAGTTTTACCGCGTTGGCGGCTATGCGCCGGTGAAAGTGGAtgtg  >  1:1310881/1‑61 (MQ=255) cgTGCTGGCAGACGGTCAGTTTTACCGCGTTGGCGGCTATGCGCCGGTGAAAGTGGAtgtg  >  1:1431537/1‑61 (MQ=255) cgTGCTGGCAGACGGTCAGTTTTACCGCGTTGGCGGCTATGCGCCGGTGAAAGTGGAtgtg  >  1:1000722/1‑61 (MQ=255) cgTGCTGGCAGACGGTCAGTTTTACCGCGTTGGCGGCTATGCGCCGGTGAAAGTGGAtgtg  >  1:1444521/1‑61 (MQ=255) cgTGCTGGCAGACGGTCAGTTTTACCGCGTTGGCGGCTATGCGCCGGTGAAAGTGGAtgtg  >  1:157019/1‑61 (MQ=255) cgTGCTGGCAGACGGTCAGTTTTACCGCGTTGGCGGCTATGCGCCGGTGAAAGTGGAtgtg  >  1:163027/1‑61 (MQ=255) cgTGCTGGCAGACGGTCAGTTTTACCGCGTTGGCGGCTATGCGCCGGTGAAAGTGGAtgtg  >  1:201611/1‑61 (MQ=255) cgTGCTGGCAGACGGTCAGTTTTACCGCGTTGGCGGCTATGCGCCGGTGAAAGTGGAtgtg  >  1:216482/1‑61 (MQ=255) cgTGCTGGCAGACGGTCAGTTTTACCGCGTTGGCGGCTATGCGCCGGTGAAAGTGGAtgtg  >  1:243311/1‑61 (MQ=255) cgTGCTGGCAGACGGTCAGTTTTACCGCGTTGGCGGCTATGCGCCGGTGAAAGTGGAtgtg  >  1:248508/1‑61 (MQ=255) cgTGCTGGCAGACGGTCAGTTTTACCGCGTTGGCGGCTATGCGCCGGTGAAAGTGGAtgtg  >  1:254658/1‑61 (MQ=255) cgTGCTGGCAGACGGTCAGTTTTACCGCGTTGGCGGCTATGCGCCGGTGAAAGTGGAtgtg  >  1:313405/1‑61 (MQ=255)                                                             | CGTGCTGGCAGACGGTCAGTTTTACCGCGTTGGCGGCTATGCGCCGGTGAAAGTGGATGTG  >  W3110S.gb/3582164‑3582224

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑