Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3592385	3592819	435	38 [0]	[0] 17	[yihF]–[dsbA]	[yihF],[dsbA]

AGGCATGTTCACCTTTCTTTTTAGCATCGTTAAAATCTTTAATAAATTTT  >  W3110S.gb/3592335‑3592384                                                  | aGGCATGTTCACCTTTCTTTTTAGCATCGTTAAAATCTTTAATAAAtttt  <  1:68998/50‑1 (MQ=255) aGGCATGTTCACCTTTCTTTTTAGCATCGTTAAAATCTTTAATAAAtttt  <  1:1008418/50‑1 (MQ=255) aGGCATGTTCACCTTTCTTTTTAGCATCGTTAAAATCTTTAATAAAtttt  <  1:277592/50‑1 (MQ=255) aGGCATGTTCACCTTTCTTTTTAGCATCGTTAAAATCTTTAATAAAtttt  <  1:280111/50‑1 (MQ=255) aGGCATGTTCACCTTTCTTTTTAGCATCGTTAAAATCTTTAATAAAtttt  <  1:324419/50‑1 (MQ=255) aGGCATGTTCACCTTTCTTTTTAGCATCGTTAAAATCTTTAATAAAtttt  <  1:372197/50‑1 (MQ=255) aGGCATGTTCACCTTTCTTTTTAGCATCGTTAAAATCTTTAATAAAtttt  <  1:436109/50‑1 (MQ=255) aGGCATGTTCACCTTTCTTTTTAGCATCGTTAAAATCTTTAATAAAtttt  <  1:44344/50‑1 (MQ=255) aGGCATGTTCACCTTTCTTTTTAGCATCGTTAAAATCTTTAATAAAtttt  <  1:610256/50‑1 (MQ=255) aGGCATGTTCACCTTTCTTTTTAGCATCGTTAAAATCTTTAATAAAtttt  <  1:630028/50‑1 (MQ=255) aGGCATGTTCACCTTTCTTTTTAGCATCGTTAAAATCTTTAATAAAtttt  <  1:251462/50‑1 (MQ=255) aGGCATGTTCACCTTTCTTTTTAGCATCGTTAAAATCTTTAATAAAtttt  <  1:693906/50‑1 (MQ=255) aGGCATGTTCACCTTTCTTTTTAGCATCGTTAAAATCTTTAATAAAtttt  <  1:698608/50‑1 (MQ=255) aGGCATGTTCACCTTTCTTTTTAGCATCGTTAAAATCTTTAATAAAtttt  <  1:721378/50‑1 (MQ=255) aGGCATGTTCACCTTTCTTTTTAGCATCGTTAAAATCTTTAATAAAtttt  <  1:75974/50‑1 (MQ=255) aGGCATGTTCACCTTTCTTTTTAGCATCGTTAAAATCTTTAATAAAtttt  <  1:855521/50‑1 (MQ=255) aGGCATGTTCACCTTTCTTTTTAGCATCGTTAAAATCTTTAATAAAtttt  <  1:911719/50‑1 (MQ=255) aGGCATGTTCACCTTTCTTTTTAGCATCGTTAAAATCTTTAATAAAtttt  <  1:925362/50‑1 (MQ=255) aGGCATGTTCACCTTTCTTTTTAGCATCGTTAAAATCTTTAATAAAtttt  <  1:974660/50‑1 (MQ=255) aGGCATGTTCACCTTTCTTTTTAGCATCGTTAAAATCTTTAATAAAtttt  <  1:1191521/50‑1 (MQ=255) aGGCATGTTCACCTTTCTTTTTAGCATCGTTAAAATCTTTAATAAAtttt  <  1:108439/50‑1 (MQ=255) aGGCATGTTCACCTTTCTTTTTAGCATCGTTAAAATCTTTAATAAAtttt  <  1:1092448/50‑1 (MQ=255) aGGCATGTTCACCTTTCTTTTTAGCATCGTTAAAATCTTTAATAAAtttt  <  1:1109528/50‑1 (MQ=255) aGGCATGTTCACCTTTCTTTTTAGCATCGTTAAAATCTTTAATAAAtttt  <  1:112519/50‑1 (MQ=255) aGGCATGTTCACCTTTCTTTTTAGCATCGTTAAAATCTTTAATAAAtttt  <  1:1125231/50‑1 (MQ=255) aGGCATGTTCACCTTTCTTTTTAGCATCGTTAAAATCTTTAATAAAtttt  <  1:1143022/50‑1 (MQ=255) aGGCATGTTCACCTTTCTTTTTAGCATCGTTAAAATCTTTAATAAAtttt  <  1:1166746/50‑1 (MQ=255) aGGCATGTTCACCTTTCTTTTTAGCATCGTTAAAATCTTTAATAAAtttt  <  1:1180626/50‑1 (MQ=255) aGGCATGTTCACCTTTCTTTTTAGCATCGTTAAAATCTTTAATAAAtttt  <  1:1182255/50‑1 (MQ=255) aGGCATGTTCACCTTTCTTTTTAGCATCGTTAAAATCTTTAATAAAtttt  <  1:224208/50‑1 (MQ=255) aGGCATGTTCACCTTTCTTTTTAGCATCGTTAAAATCTTTAATAAAtttt  <  1:1231021/50‑1 (MQ=255) aGGCATGTTCACCTTTCTTTTTAGCATCGTTAAAATCTTTAATAAAtttt  <  1:1256196/50‑1 (MQ=255) aGGCATGTTCACCTTTCTTTTTAGCATCGTTAAAATCTTTAATAAAtttt  <  1:1256930/50‑1 (MQ=255) aGGCATGTTCACCTTTCTTTTTAGCATCGTTAAAATCTTTAATAAAtttt  <  1:1281485/50‑1 (MQ=255) aGGCATGTTCACCTTTCTTTTTAGCATCGTTAAAATCTTTAATAAAtttt  <  1:1311242/50‑1 (MQ=255) aGGCATGTTCACCTTTCTTTTTAGCATCGTTAAAATCTTTAATAAAtttt  <  1:142517/50‑1 (MQ=255)  ggCATGTTCACCTTTCTTTTTAGCATCGTTAAAATCTTTAATAAAtttt  <  1:376145/49‑1 (MQ=255)  ggCATGTTCACCTTTCTTTTTAGCATCGTTAAAATCTTTAATAAAtttt  <  1:143420/49‑1 (MQ=255)                                                  | AGGCATGTTCACCTTTCTTTTTAGCATCGTTAAAATCTTTAATAAATTTT  >  W3110S.gb/3592335‑3592384

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑