Missing coverage evidence...
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GACTTATCCACCATCTCAATGCCTGCTCATCAAAAAATTGTTCCAGAAGTGTAACAGATT  >  W3110S.gb/3617813‑3617872                                                            | gACTTATCCACCATCTCAATGCCTGCTCATCAAAAAATTGTTCCAGAAGTGTAACAGAtt  <  1:558105/60‑1 (MQ=255) gACTTATCCACCATCTCAATGCCTGCTCATCAAAAAATTGTTCCAGAAGTGTAACAGAtt  <  1:338273/60‑1 (MQ=255) gACTTATCCACCATCTCAATGCCTGCTCATCAAAAAATTGTTCCAGAAGTGTAACAGAtt  <  1:1105629/60‑1 (MQ=255) gACTTATCCACCATCTCAATGCCTGCTCATCAAAAAATTGTTCCAGAAGTGTAACAGAtt  <  1:361933/60‑1 (MQ=255) gACTTATCCACCATCTCAATGCCTGCTCATCAAAAAATTGTTCCAGAAGTGTAACAGAtt  <  1:377405/60‑1 (MQ=255) gACTTATCCACCATCTCAATGCCTGCTCATCAAAAAATTGTTCCAGAAGTGTAACAGAtt  <  1:388712/60‑1 (MQ=255) gACTTATCCACCATCTCAATGCCTGCTCATCAAAAAATTGTTCCAGAAGTGTAACAGAtt  <  1:472629/60‑1 (MQ=255) gACTTATCCACCATCTCAATGCCTGCTCATCAAAAAATTGTTCCAGAAGTGTAACAGAtt  <  1:478731/60‑1 (MQ=255) gACTTATCCACCATCTCAATGCCTGCTCATCAAAAAATTGTTCCAGAAGTGTAACAGAtt  <  1:508352/60‑1 (MQ=255) gACTTATCCACCATCTCAATGCCTGCTCATCAAAAAATTGTTCCAGAAGTGTAACAGAtt  <  1:51473/60‑1 (MQ=255) gACTTATCCACCATCTCAATGCCTGCTCATCAAAAAATTGTTCCAGAAGTGTAACAGAtt  <  1:517540/60‑1 (MQ=255) gACTTATCCACCATCTCAATGCCTGCTCATCAAAAAATTGTTCCAGAAGTGTAACAGAtt  <  1:360264/60‑1 (MQ=255) gACTTATCCACCATCTCAATGCCTGCTCATCAAAAAATTGTTCCAGAAGTGTAACAGAtt  <  1:619679/60‑1 (MQ=255) gACTTATCCACCATCTCAATGCCTGCTCATCAAAAAATTGTTCCAGAAGTGTAACAGAtt  <  1:677594/60‑1 (MQ=255) gACTTATCCACCATCTCAATGCCTGCTCATCAAAAAATTGTTCCAGAAGTGTAACAGAtt  <  1:703184/60‑1 (MQ=255) gACTTATCCACCATCTCAATGCCTGCTCATCAAAAAATTGTTCCAGAAGTGTAACAGAtt  <  1:719572/60‑1 (MQ=255) gACTTATCCACCATCTCAATGCCTGCTCATCAAAAAATTGTTCCAGAAGTGTAACAGAtt  <  1:753/60‑1 (MQ=255) gACTTATCCACCATCTCAATGCCTGCTCATCAAAAAATTGTTCCAGAAGTGTAACAGAtt  <  1:764191/60‑1 (MQ=255) gACTTATCCACCATCTCAATGCCTGCTCATCAAAAAATTGTTCCAGAAGTGTAACAGAtt  <  1:871970/60‑1 (MQ=255) gACTTATCCACCATCTCAATGCCTGCTCATCAAAAAATTGTTCCAGAAGTGTAACAGAtt  <  1:934478/60‑1 (MQ=255) gACTTATCCACCATCTCAATGCCTGCTCATCAAAAAATTGTTCCAGAAGTGTAACAGAtt  <  1:955200/60‑1 (MQ=255) gACTTATCCACCATCTCAATGCCTGCTCATCAAAAAATTGTTCCAGAAGTGTAACAGAtt  <  1:977860/60‑1 (MQ=255) gACTTATCCACCATCTCAATGCCTGCTCATCAAAAAATTGTTCCAGAAGTGTAACAGAtt  <  1:123758/60‑1 (MQ=255) gACTTATCCACCATCTCAATGCCTGCTCATCAAAAAATTGTTCCAGAAGTGTAACAGAtt  <  1:1118201/60‑1 (MQ=255) gACTTATCCACCATCTCAATGCCTGCTCATCAAAAAATTGTTCCAGAAGTGTAACAGAtt  <  1:1118226/60‑1 (MQ=255) gACTTATCCACCATCTCAATGCCTGCTCATCAAAAAATTGTTCCAGAAGTGTAACAGAtt  <  1:1118439/60‑1 (MQ=255) gACTTATCCACCATCTCAATGCCTGCTCATCAAAAAATTGTTCCAGAAGTGTAACAGAtt  <  1:1124086/60‑1 (MQ=255) gACTTATCCACCATCTCAATGCCTGCTCATCAAAAAATTGTTCCAGAAGTGTAACAGAtt  <  1:113237/60‑1 (MQ=255) gACTTATCCACCATCTCAATGCCTGCTCATCAAAAAATTGTTCCAGAAGTGTAACAGAtt  <  1:1141819/60‑1 (MQ=255) gACTTATCCACCATCTCAATGCCTGCTCATCAAAAAATTGTTCCAGAAGTGTAACAGAtt  <  1:1171578/60‑1 (MQ=255) gACTTATCCACCATCTCAATGCCTGCTCATCAAAAAATTGTTCCAGAAGTGTAACAGAtt  <  1:1224755/60‑1 (MQ=255) gACTTATCCACCATCTCAATGCCTGCTCATCAAAAAATTGTTCCAGAAGTGTAACAGAtt  <  1:258265/60‑1 (MQ=255) gACTTATCCACCATCTCAATGCCTGCTCATCAAAAAATTGTTCCAGAAGTGTAACAGAtt  <  1:1250095/60‑1 (MQ=255) gACTTATCCACCATCTCAATGCCTGCTCATCAAAAAATTGTTCCAGAAGTGTAACAGAtt  <  1:1336371/60‑1 (MQ=255) gACTTATCCACCATCTCAATGCCTGCTCATCAAAAAATTGTTCCAGAAGTGTAACAGAtt  <  1:1340471/60‑1 (MQ=255) gACTTATCCACCATCTCAATGCCTGCTCATCAAAAAATTGTTCCAGAAGTGTAACAGAtt  <  1:1352390/60‑1 (MQ=255) gACTTATCCACCATCTCAATGCCTGCTCATCAAAAAATTGTTCCAGAAGTGTAACAGAtt  <  1:1370352/60‑1 (MQ=255) gACTTATCCACCATCTCAATGCCTGCTCATCAAAAAATTGTTCCAGAAGTGTAACAGAtt  <  1:1374339/60‑1 (MQ=255) gACTTATCCACCATCTCAATGCCTGCTCATCAAAAAATTGTTCCAGAAGTGTAACAGAtt  <  1:1386218/60‑1 (MQ=255) gACTTATCCACCATCTCAATGCCTGCTCATCAAAAAATTGTTCCAGAAGTGTAACAGAtt  <  1:1442335/60‑1 (MQ=255) gACTTATCCACCATCTCAATGCCTGCTCATCAAAAAATTGTTCCAGAAGTGTAACAGAtt  <  1:1462035/60‑1 (MQ=255) gACTTATCCACCATCTCAATGCCTGCTCATCAAAAAATTGTTCCAGAAGTGTAACAGAtt  <  1:219359/60‑1 (MQ=255) gACTTATCCACCATCTCAATGCCTGCTCATCAAAAAATTGTTCCAGAAGTGTAACAGAtt  <  1:2472/60‑1 (MQ=255) gACTTATCCACCATCTCAATGCCTGCACATCAAAAAATTGTTCCAGAAGTGTAACAGAtt  <  1:680124/60‑1 (MQ=255)  aCTTATCCACCATCTCAATGCCTGCTCATCAAAAAATTGTTCCAGAAGTGTAACAGAtt  <  1:686875/59‑1 (MQ=255)  aCTTATCCACCATCTCAATGCCTGCTCATCAAAAAATTGTTCCAGAAGTGTAACAGAtt  <  1:936651/59‑1 (MQ=255)             aTCTCAATGCCTGCTCATCAAAAAATTGTTCCAGAAGTGTAACAGAtt  <  1:876136/48‑1 (MQ=255)                                                            | GACTTATCCACCATCTCAATGCCTGCTCATCAAAAAATTGTTCCAGAAGTGTAACAGATT  >  W3110S.gb/3617813‑3617872

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑