Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3635688	3635737	50	47 [0]	[0] 6	yigE	hypothetical protein

CATTGGTAAAGGAATGATCACCTTGAATCTCAAACGGATTTTTCTC  >  W3110S.gb/3635642‑3635687                                              | cATTGGTAAAGGAATGATCACCTTGAATCTCAAACGGATTTTtctc  <  1:669062/46‑1 (MQ=255) cATTGGTAAAGGAATGATCACCTTGAATCTCAAACGGATTTTtctc  <  1:317637/46‑1 (MQ=255) cATTGGTAAAGGAATGATCACCTTGAATCTCAAACGGATTTTtctc  <  1:331368/46‑1 (MQ=255) cATTGGTAAAGGAATGATCACCTTGAATCTCAAACGGATTTTtctc  <  1:40499/46‑1 (MQ=255) cATTGGTAAAGGAATGATCACCTTGAATCTCAAACGGATTTTtctc  <  1:436778/46‑1 (MQ=255) cATTGGTAAAGGAATGATCACCTTGAATCTCAAACGGATTTTtctc  <  1:438830/46‑1 (MQ=255) cATTGGTAAAGGAATGATCACCTTGAATCTCAAACGGATTTTtctc  <  1:581928/46‑1 (MQ=255) cATTGGTAAAGGAATGATCACCTTGAATCTCAAACGGATTTTtctc  <  1:582965/46‑1 (MQ=255) cATTGGTAAAGGAATGATCACCTTGAATCTCAAACGGATTTTtctc  <  1:607669/46‑1 (MQ=255) cATTGGTAAAGGAATGATCACCTTGAATCTCAAACGGATTTTtctc  <  1:608888/46‑1 (MQ=255) cATTGGTAAAGGAATGATCACCTTGAATCTCAAACGGATTTTtctc  <  1:618166/46‑1 (MQ=255) cATTGGTAAAGGAATGATCACCTTGAATCTCAAACGGATTTTtctc  <  1:627701/46‑1 (MQ=255) cATTGGTAAAGGAATGATCACCTTGAATCTCAAACGGATTTTtctc  <  1:1025665/46‑1 (MQ=255) cATTGGTAAAGGAATGATCACCTTGAATCTCAAACGGATTTTtctc  <  1:685156/46‑1 (MQ=255) cATTGGTAAAGGAATGATCACCTTGAATCTCAAACGGATTTTtctc  <  1:685546/46‑1 (MQ=255) cATTGGTAAAGGAATGATCACCTTGAATCTCAAACGGATTTTtctc  <  1:775398/46‑1 (MQ=255) cATTGGTAAAGGAATGATCACCTTGAATCTCAAACGGATTTTtctc  <  1:79541/46‑1 (MQ=255) cATTGGTAAAGGAATGATCACCTTGAATCTCAAACGGATTTTtctc  <  1:811954/46‑1 (MQ=255) cATTGGTAAAGGAATGATCACCTTGAATCTCAAACGGATTTTtctc  <  1:837444/46‑1 (MQ=255) cATTGGTAAAGGAATGATCACCTTGAATCTCAAACGGATTTTtctc  <  1:862457/46‑1 (MQ=255) cATTGGTAAAGGAATGATCACCTTGAATCTCAAACGGATTTTtctc  <  1:864167/46‑1 (MQ=255) cATTGGTAAAGGAATGATCACCTTGAATCTCAAACGGATTTTtctc  <  1:920823/46‑1 (MQ=255) cATTGGTAAAGGAATGATCACCTTGAATCTCAAACGGATTTTtctc  <  1:922250/46‑1 (MQ=255) cATTGGTAAAGGAATGATCACCTTGAATCTCAAACGGATTTTtctc  <  1:289582/46‑1 (MQ=255) cATTGGTAAAGGAATGATCACCTTGAATCTCAAACGGATTTTtctc  <  1:1018562/46‑1 (MQ=255) cATTGGTAAAGGAATGATCACCTTGAATCTCAAACGGATTTTtctc  <  1:1132900/46‑1 (MQ=255) cATTGGTAAAGGAATGATCACCTTGAATCTCAAACGGATTTTtctc  <  1:115250/46‑1 (MQ=255) cATTGGTAAAGGAATGATCACCTTGAATCTCAAACGGATTTTtctc  <  1:1200429/46‑1 (MQ=255) cATTGGTAAAGGAATGATCACCTTGAATCTCAAACGGATTTTtctc  <  1:1217670/46‑1 (MQ=255) cATTGGTAAAGGAATGATCACCTTGAATCTCAAACGGATTTTtctc  <  1:1234099/46‑1 (MQ=255) cATTGGTAAAGGAATGATCACCTTGAATCTCAAACGGATTTTtctc  <  1:1275902/46‑1 (MQ=255) cATTGGTAAAGGAATGATCACCTTGAATCTCAAACGGATTTTtctc  <  1:1288068/46‑1 (MQ=255) cATTGGTAAAGGAATGATCACCTTGAATCTCAAACGGATTTTtctc  <  1:1333896/46‑1 (MQ=255) cATTGGTAAAGGAATGATCACCTTGAATCTCAAACGGATTTTtctc  <  1:1363086/46‑1 (MQ=255) cATTGGTAAAGGAATGATCACCTTGAATCTCAAACGGATTTTtctc  <  1:1396618/46‑1 (MQ=255) cATTGGTAAAGGAATGATCACCTTGAATCTCAAACGGATTTTtctc  <  1:1437213/46‑1 (MQ=255) cATTGGTAAAGGAATGATCACCTTGAATCTCAAACGGATTTTtctc  <  1:1461089/46‑1 (MQ=255) cATTGGTAAAGGAATGATCACCTTGAATCTCAAACGGATTTTtctc  <  1:205697/46‑1 (MQ=255) cATTGGTAAAGGAATGATCACCTTGAATCTCAAACGGATTTTtctc  <  1:223707/46‑1 (MQ=255) cATTGGTAAAGGAATGATCACCTTGAATCTCAAACGGATTTTtctc  <  1:232155/46‑1 (MQ=255) cATTGGTAAAGGAATGATCACCTTGAATCTCAAACGGATTTTtctc  <  1:236481/46‑1 (MQ=255) cATTGGTAAAGGAATGATCACCTTGAATCTCAAACGGATTTTtctc  <  1:278176/46‑1 (MQ=255) cATTGGTAAAGGAATGATCACCTTGAATCTCAAACGGATTTTtctc  <  1:28745/46‑1 (MQ=255) cATTGGTAAAGGAATGATCACCTTGAATCTCAAACGGATTTTtctc  <  1:298696/46‑1 (MQ=255) cATTGGTAAAGGAATGATCACCTTGAATCTCAAACGGATTATtctc  <  1:1079379/46‑1 (MQ=255)     tgTAAAGGAATGATCACCTTGAATCTCAAACGGATTTTtctc  <  1:1442074/41‑1 (MQ=255)         aaGGAATGATCACCTTGAATCTCAAACGGATTTTtctc  <  1:959336/38‑1 (MQ=255)                                              | CATTGGTAAAGGAATGATCACCTTGAATCTCAAACGGATTTTTCTC  >  W3110S.gb/3635642‑3635687

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑