Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3668890	3668953	64	69 [0]	[0] 32	rfe/rho	UDP‑GlcNAc:undecaprenylphosphate GlcNAc‑1‑phosphate transferase/transcription termination factor

GAAAGTCCGTTCCAAACCCACCAGTCCTGTGCAAAAATTAACCATTTGATATGCAAATTGC  >  W3110S.gb/3668829‑3668889                                                             | taaaGTCCGTTCCAAACCCACCAGTCCTGTGCAAAAATTAACCATTTGATATGCAAATTGc  >  1:499249/2‑61 (MQ=255) gAAAGTCCGTTCCAAACCCACCAGTCCTGTGCAAAAATTAACCATTTGATATGCAAATTGc  >  1:648085/1‑61 (MQ=255) gAAAGTCCGTTCCAAACCCACCAGTCCTGTGCAAAAATTAACCATTTGATATGCAAATTGc  >  1:754135/1‑61 (MQ=255) gAAAGTCCGTTCCAAACCCACCAGTCCTGTGCAAAAATTAACCATTTGATATGCAAATTGc  >  1:746865/1‑61 (MQ=255) gAAAGTCCGTTCCAAACCCACCAGTCCTGTGCAAAAATTAACCATTTGATATGCAAATTGc  >  1:718933/1‑61 (MQ=255) gAAAGTCCGTTCCAAACCCACCAGTCCTGTGCAAAAATTAACCATTTGATATGCAAATTGc  >  1:713061/1‑61 (MQ=255) gAAAGTCCGTTCCAAACCCACCAGTCCTGTGCAAAAATTAACCATTTGATATGCAAATTGc  >  1:694899/1‑61 (MQ=255) gAAAGTCCGTTCCAAACCCACCAGTCCTGTGCAAAAATTAACCATTTGATATGCAAATTGc  >  1:685161/1‑61 (MQ=255) gAAAGTCCGTTCCAAACCCACCAGTCCTGTGCAAAAATTAACCATTTGATATGCAAATTGc  >  1:653513/1‑61 (MQ=255) gAAAGTCCGTTCCAAACCCACCAGTCCTGTGCAAAAATTAACCATTTGATATGCAAATTGc  >  1:65028/1‑61 (MQ=255) gAAAGTCCGTTCCAAACCCACCAGTCCTGTGCAAAAATTAACCATTTGATATGCAAATTGc  >  1:757641/1‑61 (MQ=255) gAAAGTCCGTTCCAAACCCACCAGTCCTGTGCAAAAATTAACCATTTGATATGCAAATTGc  >  1:574053/1‑61 (MQ=255) gAAAGTCCGTTCCAAACCCACCAGTCCTGTGCAAAAATTAACCATTTGATATGCAAATTGc  >  1:57185/1‑61 (MQ=255) gAAAGTCCGTTCCAAACCCACCAGTCCTGTGCAAAAATTAACCATTTGATATGCAAATTGc  >  1:564769/1‑61 (MQ=255) gAAAGTCCGTTCCAAACCCACCAGTCCTGTGCAAAAATTAACCATTTGATATGCAAATTGc  >  1:548041/1‑61 (MQ=255) gAAAGTCCGTTCCAAACCCACCAGTCCTGTGCAAAAATTAACCATTTGATATGCAAATTGc  >  1:48122/1‑61 (MQ=255) gAAAGTCCGTTCCAAACCCACCAGTCCTGTGCAAAAATTAACCATTTGATATGCAAATTGc  >  1:473696/1‑61 (MQ=255) gAAAGTCCGTTCCAAACCCACCAGTCCTGTGCAAAAATTAACCATTTGATATGCAAATTGc  >  1:859908/1‑61 (MQ=255) gAAAGTCCGTTCCAAACCCACCAGTCCTGTGCAAAAATTAACCATTTGATATGCAAATTGc  >  1:992551/1‑61 (MQ=255) gAAAGTCCGTTCCAAACCCACCAGTCCTGTGCAAAAATTAACCATTTGATATGCAAATTGc  >  1:963428/1‑61 (MQ=255) gAAAGTCCGTTCCAAACCCACCAGTCCTGTGCAAAAATTAACCATTTGATATGCAAATTGc  >  1:946621/1‑61 (MQ=255) gAAAGTCCGTTCCAAACCCACCAGTCCTGTGCAAAAATTAACCATTTGATATGCAAATTGc  >  1:912924/1‑61 (MQ=255) gAAAGTCCGTTCCAAACCCACCAGTCCTGTGCAAAAATTAACCATTTGATATGCAAATTGc  >  1:907356/1‑61 (MQ=255) gAAAGTCCGTTCCAAACCCACCAGTCCTGTGCAAAAATTAACCATTTGATATGCAAATTGc  >  1:902258/1‑61 (MQ=255) gAAAGTCCGTTCCAAACCCACCAGTCCTGTGCAAAAATTAACCATTTGATATGCAAATTGc  >  1:900416/1‑61 (MQ=255) gAAAGTCCGTTCCAAACCCACCAGTCCTGTGCAAAAATTAACCATTTGATATGCAAATTGc  >  1:86838/1‑61 (MQ=255) gAAAGTCCGTTCCAAACCCACCAGTCCTGTGCAAAAATTAACCATTTGATATGCAAATTGc  >  1:458731/1‑61 (MQ=255) gAAAGTCCGTTCCAAACCCACCAGTCCTGTGCAAAAATTAACCATTTGATATGCAAATTGc  >  1:857003/1‑61 (MQ=255) gAAAGTCCGTTCCAAACCCACCAGTCCTGTGCAAAAATTAACCATTTGATATGCAAATTGc  >  1:838557/1‑61 (MQ=255) gAAAGTCCGTTCCAAACCCACCAGTCCTGTGCAAAAATTAACCATTTGATATGCAAATTGc  >  1:804606/1‑61 (MQ=255) gAAAGTCCGTTCCAAACCCACCAGTCCTGTGCAAAAATTAACCATTTGATATGCAAATTGc  >  1:801619/1‑61 (MQ=255) gAAAGTCCGTTCCAAACCCACCAGTCCTGTGCAAAAATTAACCATTTGATATGCAAATTGc  >  1:782130/1‑61 (MQ=255) gAAAGTCCGTTCCAAACCCACCAGTCCTGTGCAAAAATTAACCATTTGATATGCAAATTGc  >  1:767310/1‑61 (MQ=255) gAAAGTCCGTTCCAAACCCACCAGTCCTGTGCAAAAATTAACCATTTGATATGCAAATTGc  >  1:763861/1‑61 (MQ=255) gAAAGTCCGTTCCAAACCCACCAGTCCTGTGCAAAAATTAACCATTTGATATGCAAATTGc  >  1:1353478/1‑61 (MQ=255) gAAAGTCCGTTCCAAACCCACCAGTCCTGTGCAAAAATTAACCATTTGATATGCAAATTGc  >  1:1449893/1‑61 (MQ=255) gAAAGTCCGTTCCAAACCCACCAGTCCTGTGCAAAAATTAACCATTTGATATGCAAATTGc  >  1:1429465/1‑61 (MQ=255) gAAAGTCCGTTCCAAACCCACCAGTCCTGTGCAAAAATTAACCATTTGATATGCAAATTGc  >  1:1413491/1‑61 (MQ=255) gAAAGTCCGTTCCAAACCCACCAGTCCTGTGCAAAAATTAACCATTTGATATGCAAATTGc  >  1:1410785/1‑61 (MQ=255) gAAAGTCCGTTCCAAACCCACCAGTCCTGTGCAAAAATTAACCATTTGATATGCAAATTGc  >  1:1406198/1‑61 (MQ=255) gAAAGTCCGTTCCAAACCCACCAGTCCTGTGCAAAAATTAACCATTTGATATGCAAATTGc  >  1:1387351/1‑61 (MQ=255) gAAAGTCCGTTCCAAACCCACCAGTCCTGTGCAAAAATTAACCATTTGATATGCAAATTGc  >  1:1380873/1‑61 (MQ=255) gAAAGTCCGTTCCAAACCCACCAGTCCTGTGCAAAAATTAACCATTTGATATGCAAATTGc  >  1:1353765/1‑61 (MQ=255) gAAAGTCCGTTCCAAACCCACCAGTCCTGTGCAAAAATTAACCATTTGATATGCAAATTGc  >  1:1468208/1‑61 (MQ=255) gAAAGTCCGTTCCAAACCCACCAGTCCTGTGCAAAAATTAACCATTTGATATGCAAATTGc  >  1:1336078/1‑61 (MQ=255) gAAAGTCCGTTCCAAACCCACCAGTCCTGTGCAAAAATTAACCATTTGATATGCAAATTGc  >  1:124884/1‑61 (MQ=255) gAAAGTCCGTTCCAAACCCACCAGTCCTGTGCAAAAATTAACCATTTGATATGCAAATTGc  >  1:1191111/1‑61 (MQ=255) gAAAGTCCGTTCCAAACCCACCAGTCCTGTGCAAAAATTAACCATTTGATATGCAAATTGc  >  1:1186882/1‑61 (MQ=255) gAAAGTCCGTTCCAAACCCACCAGTCCTGTGCAAAAATTAACCATTTGATATGCAAATTGc  >  1:1136127/1‑61 (MQ=255) gAAAGTCCGTTCCAAACCCACCAGTCCTGTGCAAAAATTAACCATTTGATATGCAAATTGc  >  1:1057744/1‑61 (MQ=255) gAAAGTCCGTTCCAAACCCACCAGTCCTGTGCAAAAATTAACCATTTGATATGCAAATTGc  >  1:1047148/1‑61 (MQ=255) gAAAGTCCGTTCCAAACCCACCAGTCCTGTGCAAAAATTAACCATTTGATATGCAAATTGc  >  1:1006894/1‑61 (MQ=255) gAAAGTCCGTTCCAAACCCACCAGTCCTGTGCAAAAATTAACCATTTGATATGCAAATTGc  >  1:299152/1‑61 (MQ=255) gAAAGTCCGTTCCAAACCCACCAGTCCTGTGCAAAAATTAACCATTTGATATGCAAATTGc  >  1:447360/1‑61 (MQ=255) gAAAGTCCGTTCCAAACCCACCAGTCCTGTGCAAAAATTAACCATTTGATATGCAAATTGc  >  1:433483/1‑61 (MQ=255) gAAAGTCCGTTCCAAACCCACCAGTCCTGTGCAAAAATTAACCATTTGATATGCAAATTGc  >  1:43172/1‑61 (MQ=255) gAAAGTCCGTTCCAAACCCACCAGTCCTGTGCAAAAATTAACCATTTGATATGCAAATTGc  >  1:377845/1‑61 (MQ=255) gAAAGTCCGTTCCAAACCCACCAGTCCTGTGCAAAAATTAACCATTTGATATGCAAATTGc  >  1:340890/1‑61 (MQ=255) gAAAGTCCGTTCCAAACCCACCAGTCCTGTGCAAAAATTAACCATTTGATATGCAAATTGc  >  1:337058/1‑61 (MQ=255) gAAAGTCCGTTCCAAACCCACCAGTCCTGTGCAAAAATTAACCATTTGATATGCAAATTGc  >  1:323288/1‑61 (MQ=255) gAAAGTCCGTTCCAAACCCACCAGTCCTGTGCAAAAATTAACCATTTGATATGCAAATTGc  >  1:1002841/1‑61 (MQ=255) gAAAGTCCGTTCCAAACCCACCAGTCCTGTGCAAAAATTAACCATTTGATATGCAAATTGc  >  1:284381/1‑61 (MQ=255) gAAAGTCCGTTCCAAACCCACCAGTCCTGTGCAAAAATTAACCATTTGATATGCAAATTGc  >  1:246909/1‑61 (MQ=255) gAAAGTCCGTTCCAAACCCACCAGTCCTGTGCAAAAATTAACCATTTGATATGCAAATTGc  >  1:196573/1‑61 (MQ=255) gAAAGTCCGTTCCAAACCCACCAGTCCTGTGCAAAAATTAACCATTTGATATGCAAATTGc  >  1:184762/1‑61 (MQ=255) gAAAGTCCGTTCCAAACCCACCAGTCCTGTGCAAAAATTAACCATTTGATATGCAAATTGc  >  1:175253/1‑61 (MQ=255) gAAAGTCCGTTCCAAACCCACCAGTCCTGTGCAAAAATTAACCATTTGATATGCAAATTGc  >  1:164980/1‑61 (MQ=255) gAAAGTCCGTTCCAAACCCACCAGTCCTGTGCAAAAATTAACCATTTGATATGCAAATTGc  >  1:158982/1‑61 (MQ=255) gAAAGTCCGTTCAAAACCCACCAGTCCTGTGCAAAAATTAACCATTTGATATGCAAATTGc  >  1:575771/1‑61 (MQ=255)                                                             | GAAAGTCCGTTCCAAACCCACCAGTCCTGTGCAAAAATTAACCATTTGATATGCAAATTGC  >  W3110S.gb/3668829‑3668889

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑