Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3706356	3706799	444	43 [0]	[0] 4	yieN	fused predicted transcriptional regulators

GCGCCAGCAACTGGATAAATTACCGGATGCGCCTTATGTCTCGGATCGTCGCTGGAAAAAAG  >  W3110S.gb/3706294‑3706355                                                              | gcgcCAGCAACTGGATAAATTACCGGATGCGCCTTATGTCTCGGATCGTCGCTGGAAAAAAg  <  1:66895/62‑1 (MQ=255) gcgcCAGCAACTGGATAAATTACCGGATGCGCCTTATGTCTCGGATCGTCGCTGGAAAAAAg  <  1:347575/62‑1 (MQ=255) gcgcCAGCAACTGGATAAATTACCGGATGCGCCTTATGTCTCGGATCGTCGCTGGAAAAAAg  <  1:368209/62‑1 (MQ=255) gcgcCAGCAACTGGATAAATTACCGGATGCGCCTTATGTCTCGGATCGTCGCTGGAAAAAAg  <  1:385307/62‑1 (MQ=255) gcgcCAGCAACTGGATAAATTACCGGATGCGCCTTATGTCTCGGATCGTCGCTGGAAAAAAg  <  1:466038/62‑1 (MQ=255) gcgcCAGCAACTGGATAAATTACCGGATGCGCCTTATGTCTCGGATCGTCGCTGGAAAAAAg  <  1:471937/62‑1 (MQ=255) gcgcCAGCAACTGGATAAATTACCGGATGCGCCTTATGTCTCGGATCGTCGCTGGAAAAAAg  <  1:534552/62‑1 (MQ=255) gcgcCAGCAACTGGATAAATTACCGGATGCGCCTTATGTCTCGGATCGTCGCTGGAAAAAAg  <  1:539436/62‑1 (MQ=255) gcgcCAGCAACTGGATAAATTACCGGATGCGCCTTATGTCTCGGATCGTCGCTGGAAAAAAg  <  1:62424/62‑1 (MQ=255) gcgcCAGCAACTGGATAAATTACCGGATGCGCCTTATGTCTCGGATCGTCGCTGGAAAAAAg  <  1:658464/62‑1 (MQ=255) gcgcCAGCAACTGGATAAATTACCGGATGCGCCTTATGTCTCGGATCGTCGCTGGAAAAAAg  <  1:661807/62‑1 (MQ=255) gcgcCAGCAACTGGATAAATTACCGGATGCGCCTTATGTCTCGGATCGTCGCTGGAAAAAAg  <  1:345160/62‑1 (MQ=255) gcgcCAGCAACTGGATAAATTACCGGATGCGCCTTATGTCTCGGATCGTCGCTGGAAAAAAg  <  1:694357/62‑1 (MQ=255) gcgcCAGCAACTGGATAAATTACCGGATGCGCCTTATGTCTCGGATCGTCGCTGGAAAAAAg  <  1:709302/62‑1 (MQ=255) gcgcCAGCAACTGGATAAATTACCGGATGCGCCTTATGTCTCGGATCGTCGCTGGAAAAAAg  <  1:753158/62‑1 (MQ=255) gcgcCAGCAACTGGATAAATTACCGGATGCGCCTTATGTCTCGGATCGTCGCTGGAAAAAAg  <  1:755859/62‑1 (MQ=255) gcgcCAGCAACTGGATAAATTACCGGATGCGCCTTATGTCTCGGATCGTCGCTGGAAAAAAg  <  1:825797/62‑1 (MQ=255) gcgcCAGCAACTGGATAAATTACCGGATGCGCCTTATGTCTCGGATCGTCGCTGGAAAAAAg  <  1:883777/62‑1 (MQ=255) gcgcCAGCAACTGGATAAATTACCGGATGCGCCTTATGTCTCGGATCGTCGCTGGAAAAAAg  <  1:897747/62‑1 (MQ=255) gcgcCAGCAACTGGATAAATTACCGGATGCGCCTTATGTCTCGGATCGTCGCTGGAAAAAAg  <  1:920556/62‑1 (MQ=255) gcgcCAGCAACTGGATAAATTACCGGATGCGCCTTATGTCTCGGATCGTCGCTGGAAAAAAg  <  1:96094/62‑1 (MQ=255) gcgcCAGCAACTGGATAAATTACCGGATGCGCCTTATGTCTCGGATCGTCGCTGGAAAAAAg  <  1:1362241/62‑1 (MQ=255) gcgcCAGCAACTGGATAAATTACCGGATGCGCCTTATGTCTCGGATCGTCGCTGGAAAAAAg  <  1:1018836/62‑1 (MQ=255) gcgcCAGCAACTGGATAAATTACCGGATGCGCCTTATGTCTCGGATCGTCGCTGGAAAAAAg  <  1:1083409/62‑1 (MQ=255) gcgcCAGCAACTGGATAAATTACCGGATGCGCCTTATGTCTCGGATCGTCGCTGGAAAAAAg  <  1:1142858/62‑1 (MQ=255) gcgcCAGCAACTGGATAAATTACCGGATGCGCCTTATGTCTCGGATCGTCGCTGGAAAAAAg  <  1:1150386/62‑1 (MQ=255) gcgcCAGCAACTGGATAAATTACCGGATGCGCCTTATGTCTCGGATCGTCGCTGGAAAAAAg  <  1:11956/62‑1 (MQ=255) gcgcCAGCAACTGGATAAATTACCGGATGCGCCTTATGTCTCGGATCGTCGCTGGAAAAAAg  <  1:1215197/62‑1 (MQ=255) gcgcCAGCAACTGGATAAATTACCGGATGCGCCTTATGTCTCGGATCGTCGCTGGAAAAAAg  <  1:1221586/62‑1 (MQ=255) gcgcCAGCAACTGGATAAATTACCGGATGCGCCTTATGTCTCGGATCGTCGCTGGAAAAAAg  <  1:1242298/62‑1 (MQ=255) gcgcCAGCAACTGGATAAATTACCGGATGCGCCTTATGTCTCGGATCGTCGCTGGAAAAAAg  <  1:1244238/62‑1 (MQ=255) gcgcCAGCAACTGGATAAATTACCGGATGCGCCTTATGTCTCGGATCGTCGCTGGAAAAAAg  <  1:1285199/62‑1 (MQ=255) gcgcCAGCAACTGGATAAATTACCGGATGCGCCTTATGTCTCGGATCGTCGCTGGAAAAAAg  <  1:1008319/62‑1 (MQ=255) gcgcCAGCAACTGGATAAATTACCGGATGCGCCTTATGTCTCGGATCGTCGCTGGAAAAAAg  <  1:1371203/62‑1 (MQ=255) gcgcCAGCAACTGGATAAATTACCGGATGCGCCTTATGTCTCGGATCGTCGCTGGAAAAAAg  <  1:1375937/62‑1 (MQ=255) gcgcCAGCAACTGGATAAATTACCGGATGCGCCTTATGTCTCGGATCGTCGCTGGAAAAAAg  <  1:1401365/62‑1 (MQ=255) gcgcCAGCAACTGGATAAATTACCGGATGCGCCTTATGTCTCGGATCGTCGCTGGAAAAAAg  <  1:18881/62‑1 (MQ=255) gcgcCAGCAACTGGATAAATTACCGGATGCGCCTTATGTCTCGGATCGTCGCTGGAAAAAAg  <  1:241859/62‑1 (MQ=255) gcgcCAGCAACTGGATAAATTACCGGATGCGCCTTATGTCTCGGATCGTCGCTGGAAAAAAg  <  1:259702/62‑1 (MQ=255) gcgcCAGCAACTGGATAAATTACCGGATGCGCCTTATGTCTCGGATCGTCGCTGGAAAAAAg  <  1:289930/62‑1 (MQ=255) gcgcCAGCAACTGGATAAATTACCGGATGCGCCTTATGTCTCGGATCGTCGCTGGAAAAAAg  <  1:321910/62‑1 (MQ=255) gcgcCAGCAACTGGATAAATTACCGGATGCGCCTTATGTCTCGGATCGTCGCTGGAAAAAAg  <  1:338153/62‑1 (MQ=255)  cgcCAGCAACTGGATAAATTACCGGATGCGCCTTATGTCTCGGATCGTCGCTCGAAAAAAg  <  1:657599/61‑1 (MQ=255)                                                              | GCGCCAGCAACTGGATAAATTACCGGATGCGCCTTATGTCTCGGATCGTCGCTGGAAAAAAG  >  W3110S.gb/3706294‑3706355

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑