Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3717365	3717713	349	22 [0]	[0] 55	atpA	F1 sector of membrane‑bound ATP synthase, alpha subunit

GGTCGTGGTCAGCGTGAATTGATCATCGGTGACCGTCAGACAGGTAAAACCGCACTGGCTAT  >  W3110S.gb/3717303‑3717364                                                              | ggTCGTGGTCAGCGTGAATTGATCATCGGTGACCGTCAGACAGGTAAAACCGCACTGGCTAt  <  1:355817/62‑1 (MQ=255) ggTCGTGGTCAGCGTGAATTGATCATCGGTGACCGTCAGACAGGTAAAACCGCACTGGCTAt  <  1:973329/62‑1 (MQ=255) ggTCGTGGTCAGCGTGAATTGATCATCGGTGACCGTCAGACAGGTAAAACCGCACTGGCTAt  <  1:933285/62‑1 (MQ=255) ggTCGTGGTCAGCGTGAATTGATCATCGGTGACCGTCAGACAGGTAAAACCGCACTGGCTAt  <  1:925115/62‑1 (MQ=255) ggTCGTGGTCAGCGTGAATTGATCATCGGTGACCGTCAGACAGGTAAAACCGCACTGGCTAt  <  1:881474/62‑1 (MQ=255) ggTCGTGGTCAGCGTGAATTGATCATCGGTGACCGTCAGACAGGTAAAACCGCACTGGCTAt  <  1:609166/62‑1 (MQ=255) ggTCGTGGTCAGCGTGAATTGATCATCGGTGACCGTCAGACAGGTAAAACCGCACTGGCTAt  <  1:602475/62‑1 (MQ=255) ggTCGTGGTCAGCGTGAATTGATCATCGGTGACCGTCAGACAGGTAAAACCGCACTGGCTAt  <  1:600533/62‑1 (MQ=255) ggTCGTGGTCAGCGTGAATTGATCATCGGTGACCGTCAGACAGGTAAAACCGCACTGGCTAt  <  1:546918/62‑1 (MQ=255) ggTCGTGGTCAGCGTGAATTGATCATCGGTGACCGTCAGACAGGTAAAACCGCACTGGCTAt  <  1:466280/62‑1 (MQ=255) ggTCGTGGTCAGCGTGAATTGATCATCGGTGACCGTCAGACAGGTAAAACCGCACTGGCTAt  <  1:433738/62‑1 (MQ=255) ggTCGTGGTCAGCGTGAATTGATCATCGGTGACCGTCAGACAGGTAAAACCGCACTGGCTAt  <  1:1026301/62‑1 (MQ=255) ggTCGTGGTCAGCGTGAATTGATCATCGGTGACCGTCAGACAGGTAAAACCGCACTGGCTAt  <  1:273888/62‑1 (MQ=255) ggTCGTGGTCAGCGTGAATTGATCATCGGTGACCGTCAGACAGGTAAAACCGCACTGGCTAt  <  1:201002/62‑1 (MQ=255) ggTCGTGGTCAGCGTGAATTGATCATCGGTGACCGTCAGACAGGTAAAACCGCACTGGCTAt  <  1:169069/62‑1 (MQ=255) ggTCGTGGTCAGCGTGAATTGATCATCGGTGACCGTCAGACAGGTAAAACCGCACTGGCTAt  <  1:1367033/62‑1 (MQ=255) ggTCGTGGTCAGCGTGAATTGATCATCGGTGACCGTCAGACAGGTAAAACCGCACTGGCTAt  <  1:1344743/62‑1 (MQ=255) ggTCGTGGTCAGCGTGAATTGATCATCGGTGACCGTCAGACAGGTAAAACCGCACTGGCTAt  <  1:1333629/62‑1 (MQ=255) ggTCGTGGTCAGCGTGAATTGATCATCGGTGACCGTCAGACAGGTAAAACCGCACTGGCTAt  <  1:1294085/62‑1 (MQ=255) ggTCGTGGTCAGCGTGAATTGATCATCGGTGACCGTCAGACAGGTAAAACCGCACTGGCTAt  <  1:121094/62‑1 (MQ=255) ggTCGTGGTCAGCGTGAATTGATCATCGGTGACCGTCAGACAGGTAAAACCGCACTGGCTAt  <  1:1078361/62‑1 (MQ=255)    cGTGGGCAGCGGGAATTGATCATCGGTGACCGTCAGACAGGTAACACCGCACTGGCTAt  <  1:1166668/59‑1 (MQ=255)                                                              | GGTCGTGGTCAGCGTGAATTGATCATCGGTGACCGTCAGACAGGTAAAACCGCACTGGCTAT  >  W3110S.gb/3717303‑3717364

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑