Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3729216	3729256	41	52 [0]	[0] 66	phoU	DNA‑binding transcriptional regulator

TGGAAAGTATCCGCACGCAGGTGATGACCATGGGCGGCATGGTGGAGCAGCAGCTTTCT  >  W3110S.gb/3729157‑3729215                                                           | tGGAAAGTATCCGCACGCAGGTGATGACCATGGGCGGCATGGTGGAGCAGCAGCTTTCt  >  1:722484/1‑59 (MQ=255) tGGAAAGTATCCGCACGCAGGTGATGACCATGGGCGGCATGGTGGAGCAGCAGCTTTCt  >  1:397685/1‑59 (MQ=255) tGGAAAGTATCCGCACGCAGGTGATGACCATGGGCGGCATGGTGGAGCAGCAGCTTTCt  >  1:436279/1‑59 (MQ=255) tGGAAAGTATCCGCACGCAGGTGATGACCATGGGCGGCATGGTGGAGCAGCAGCTTTCt  >  1:45559/1‑59 (MQ=255) tGGAAAGTATCCGCACGCAGGTGATGACCATGGGCGGCATGGTGGAGCAGCAGCTTTCt  >  1:50509/1‑59 (MQ=255) tGGAAAGTATCCGCACGCAGGTGATGACCATGGGCGGCATGGTGGAGCAGCAGCTTTCt  >  1:531540/1‑59 (MQ=255) tGGAAAGTATCCGCACGCAGGTGATGACCATGGGCGGCATGGTGGAGCAGCAGCTTTCt  >  1:533841/1‑59 (MQ=255) tGGAAAGTATCCGCACGCAGGTGATGACCATGGGCGGCATGGTGGAGCAGCAGCTTTCt  >  1:56130/1‑59 (MQ=255) tGGAAAGTATCCGCACGCAGGTGATGACCATGGGCGGCATGGTGGAGCAGCAGCTTTCt  >  1:570355/1‑59 (MQ=255) tGGAAAGTATCCGCACGCAGGTGATGACCATGGGCGGCATGGTGGAGCAGCAGCTTTCt  >  1:574697/1‑59 (MQ=255) tGGAAAGTATCCGCACGCAGGTGATGACCATGGGCGGCATGGTGGAGCAGCAGCTTTCt  >  1:634217/1‑59 (MQ=255) tGGAAAGTATCCGCACGCAGGTGATGACCATGGGCGGCATGGTGGAGCAGCAGCTTTCt  >  1:640009/1‑59 (MQ=255) tGGAAAGTATCCGCACGCAGGTGATGACCATGGGCGGCATGGTGGAGCAGCAGCTTTCt  >  1:662255/1‑59 (MQ=255) tGGAAAGTATCCGCACGCAGGTGATGACCATGGGCGGCATGGTGGAGCAGCAGCTTTCt  >  1:376995/1‑59 (MQ=255) tGGAAAGTATCCGCACGCAGGTGATGACCATGGGCGGCATGGTGGAGCAGCAGCTTTCt  >  1:77811/1‑59 (MQ=255) tGGAAAGTATCCGCACGCAGGTGATGACCATGGGCGGCATGGTGGAGCAGCAGCTTTCt  >  1:790345/1‑59 (MQ=255) tGGAAAGTATCCGCACGCAGGTGATGACCATGGGCGGCATGGTGGAGCAGCAGCTTTCt  >  1:824498/1‑59 (MQ=255) tGGAAAGTATCCGCACGCAGGTGATGACCATGGGCGGCATGGTGGAGCAGCAGCTTTCt  >  1:853016/1‑59 (MQ=255) tGGAAAGTATCCGCACGCAGGTGATGACCATGGGCGGCATGGTGGAGCAGCAGCTTTCt  >  1:920996/1‑59 (MQ=255) tGGAAAGTATCCGCACGCAGGTGATGACCATGGGCGGCATGGTGGAGCAGCAGCTTTCt  >  1:925496/1‑59 (MQ=255) tGGAAAGTATCCGCACGCAGGTGATGACCATGGGCGGCATGGTGGAGCAGCAGCTTTCt  >  1:927188/1‑59 (MQ=255) tGGAAAGTATCCGCACGCAGGTGATGACCATGGGCGGCATGGTGGAGCAGCAGCTTTCt  >  1:9296/1‑59 (MQ=255) tGGAAAGTATCCGCACGCAGGTGATGACCATGGGCGGCATGGTGGAGCAGCAGCTTTCt  >  1:951898/1‑59 (MQ=255) tGGAAAGTATCCGCACGCAGGTGATGACCATGGGCGGCATGGTGGAGCAGCAGCTTTCt  >  1:957544/1‑59 (MQ=255) tGGAAAGTATCCGCACGCAGGTGATGACCATGGGCGGCATGGTGGAGCAGCAGCTTTCt  >  1:959163/1‑59 (MQ=255) tGGAAAGTATCCGCACGCAGGTGATGACCATGGGCGGCATGGTGGAGCAGCAGCTTTCt  >  1:997239/1‑59 (MQ=255) tGGAAAGTATCCGCACGCAGGTGATGACCATGGGCGGCATGGTGGAGCAGCAGCTTTCt  >  1:135687/1‑59 (MQ=255) tGGAAAGTATCCGCACGCAGGTGATGACCATGGGCGGCATGGTGGAGCAGCAGCTTTCt  >  1:1061617/1‑59 (MQ=255) tGGAAAGTATCCGCACGCAGGTGATGACCATGGGCGGCATGGTGGAGCAGCAGCTTTCt  >  1:1076787/1‑59 (MQ=255) tGGAAAGTATCCGCACGCAGGTGATGACCATGGGCGGCATGGTGGAGCAGCAGCTTTCt  >  1:1078483/1‑59 (MQ=255) tGGAAAGTATCCGCACGCAGGTGATGACCATGGGCGGCATGGTGGAGCAGCAGCTTTCt  >  1:1085097/1‑59 (MQ=255) tGGAAAGTATCCGCACGCAGGTGATGACCATGGGCGGCATGGTGGAGCAGCAGCTTTCt  >  1:1120824/1‑59 (MQ=255) tGGAAAGTATCCGCACGCAGGTGATGACCATGGGCGGCATGGTGGAGCAGCAGCTTTCt  >  1:1128003/1‑59 (MQ=255) tGGAAAGTATCCGCACGCAGGTGATGACCATGGGCGGCATGGTGGAGCAGCAGCTTTCt  >  1:1173826/1‑59 (MQ=255) tGGAAAGTATCCGCACGCAGGTGATGACCATGGGCGGCATGGTGGAGCAGCAGCTTTCt  >  1:1209564/1‑59 (MQ=255) tGGAAAGTATCCGCACGCAGGTGATGACCATGGGCGGCATGGTGGAGCAGCAGCTTTCt  >  1:1294484/1‑59 (MQ=255) tGGAAAGTATCCGCACGCAGGTGATGACCATGGGCGGCATGGTGGAGCAGCAGCTTTCt  >  1:1307053/1‑59 (MQ=255) tGGAAAGTATCCGCACGCAGGTGATGACCATGGGCGGCATGGTGGAGCAGCAGCTTTCt  >  1:1318706/1‑59 (MQ=255) tGGAAAGTATCCGCACGCAGGTGATGACCATGGGCGGCATGGTGGAGCAGCAGCTTTCt  >  1:1343637/1‑59 (MQ=255) tGGAAAGTATCCGCACGCAGGTGATGACCATGGGCGGCATGGTGGAGCAGCAGCTTTCt  >  1:1021937/1‑59 (MQ=255) tGGAAAGTATCCGCACGCAGGTGATGACCATGGGCGGCATGGTGGAGCAGCAGCTTTCt  >  1:1372288/1‑59 (MQ=255) tGGAAAGTATCCGCACGCAGGTGATGACCATGGGCGGCATGGTGGAGCAGCAGCTTTCt  >  1:1421979/1‑59 (MQ=255) tGGAAAGTATCCGCACGCAGGTGATGACCATGGGCGGCATGGTGGAGCAGCAGCTTTCt  >  1:145092/1‑59 (MQ=255) tGGAAAGTATCCGCACGCAGGTGATGACCATGGGCGGCATGGTGGAGCAGCAGCTTTCt  >  1:168898/1‑59 (MQ=255) tGGAAAGTATCCGCACGCAGGTGATGACCATGGGCGGCATGGTGGAGCAGCAGCTTTCt  >  1:188895/1‑59 (MQ=255) tGGAAAGTATCCGCACGCAGGTGATGACCATGGGCGGCATGGTGGAGCAGCAGCTTTCt  >  1:204099/1‑59 (MQ=255) tGGAAAGTATCCGCACGCAGGTGATGACCATGGGCGGCATGGTGGAGCAGCAGCTTTCt  >  1:314247/1‑59 (MQ=255) tGGAAAGTATCCGCACGCAGGTGATGACCATGGGCGGCATGGTGGAGCAGCAGCTTTCt  >  1:327324/1‑59 (MQ=255) tGGAAAGTATCCGCACGCAGGTGATGACCATGGGCGGCATGGTGGAGCAGCAGCTTTCt  >  1:338642/1‑59 (MQ=255) tGGAAAGTATCCGCACGCAGGTGATGACCATGGGCGGCATGGTGGAGCAGCAGCTTTCt  >  1:342577/1‑59 (MQ=255) tGGAAAGTATCCGCACGCAGGTGATGACCATGGGCGGCATGGTGGAGCAGCAGCTTTCt  >  1:376251/1‑59 (MQ=255) tGGAAAGTATCCGCACGCAGGTGATGACAATGGGCGGCATGGTGGAGCAGCAGCTTTCt  >  1:1385975/1‑59 (MQ=255)                                                           | TGGAAAGTATCCGCACGCAGGTGATGACCATGGGCGGCATGGTGGAGCAGCAGCTTTCT  >  W3110S.gb/3729157‑3729215

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑