Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3735332	3735411	80	32 [0]	[0] 44	bglH	carbohydrate‑specific outer membrane porin, cryptic

ATCGCGCTGGTTCGCGAAGATGTCGATGATTACGATCGCAGCCTGCAAAACAAACAGCAGAT  >  W3110S.gb/3735270‑3735331                                                              | atCGCGCTGGTTCGCGAAGATGTCGATGATTTCGATCGCAGCCTGCAAAACAAACAGCAGAt  <  1:208251/62‑1 (MQ=255) atCGCGCTGGTTCGCGAAGATGTCGATGATTACGATCGCAGCCTGCAAAACAAACAGCAGAt  <  1:1066594/62‑1 (MQ=255) atCGCGCTGGTTCGCGAAGATGTCGATGATTACGATCGCAGCCTGCAAAACAAACAGCAGAt  <  1:935014/62‑1 (MQ=255) atCGCGCTGGTTCGCGAAGATGTCGATGATTACGATCGCAGCCTGCAAAACAAACAGCAGAt  <  1:813400/62‑1 (MQ=255) atCGCGCTGGTTCGCGAAGATGTCGATGATTACGATCGCAGCCTGCAAAACAAACAGCAGAt  <  1:792815/62‑1 (MQ=255) atCGCGCTGGTTCGCGAAGATGTCGATGATTACGATCGCAGCCTGCAAAACAAACAGCAGAt  <  1:712012/62‑1 (MQ=255) atCGCGCTGGTTCGCGAAGATGTCGATGATTACGATCGCAGCCTGCAAAACAAACAGCAGAt  <  1:607962/62‑1 (MQ=255) atCGCGCTGGTTCGCGAAGATGTCGATGATTACGATCGCAGCCTGCAAAACAAACAGCAGAt  <  1:606303/62‑1 (MQ=255) atCGCGCTGGTTCGCGAAGATGTCGATGATTACGATCGCAGCCTGCAAAACAAACAGCAGAt  <  1:545293/62‑1 (MQ=255) atCGCGCTGGTTCGCGAAGATGTCGATGATTACGATCGCAGCCTGCAAAACAAACAGCAGAt  <  1:539629/62‑1 (MQ=255) atCGCGCTGGTTCGCGAAGATGTCGATGATTACGATCGCAGCCTGCAAAACAAACAGCAGAt  <  1:462138/62‑1 (MQ=255) atCGCGCTGGTTCGCGAAGATGTCGATGATTACGATCGCAGCCTGCAAAACAAACAGCAGAt  <  1:432339/62‑1 (MQ=255) atCGCGCTGGTTCGCGAAGATGTCGATGATTACGATCGCAGCCTGCAAAACAAACAGCAGAt  <  1:429132/62‑1 (MQ=255) atCGCGCTGGTTCGCGAAGATGTCGATGATTACGATCGCAGCCTGCAAAACAAACAGCAGAt  <  1:428722/62‑1 (MQ=255) atCGCGCTGGTTCGCGAAGATGTCGATGATTACGATCGCAGCCTGCAAAACAAACAGCAGAt  <  1:36068/62‑1 (MQ=255) atCGCGCTGGTTCGCGAAGATGTCGATGATTACGATCGCAGCCTGCAAAACAAACAGCAGAt  <  1:322821/62‑1 (MQ=255) atCGCGCTGGTTCGCGAAGATGTCGATGATTACGATCGCAGCCTGCAAAACAAACAGCAGAt  <  1:315067/62‑1 (MQ=255) atCGCGCTGGTTCGCGAAGATGTCGATGATTACGATCGCAGCCTGCAAAACAAACAGCAGAt  <  1:1354402/62‑1 (MQ=255) atCGCGCTGGTTCGCGAAGATGTCGATGATTACGATCGCAGCCTGCAAAACAAACAGCAGAt  <  1:1332327/62‑1 (MQ=255) atCGCGCTGGTTCGCGAAGATGTCGATGATTACGATCGCAGCCTGCAAAACAAACAGCAGAt  <  1:124368/62‑1 (MQ=255) atCGCGCTGGTTCGCGAAGATGTCGATGATTACGATCGCAGCCTGCAAAACAAACAGCAGAt  <  1:1230442/62‑1 (MQ=255) atCGCGCTGGTTCGCGAAGATGTCGATGATTACGATCGCAGCCTGCAAAACAAACAGCAGAt  <  1:1177214/62‑1 (MQ=255) atCGCGCTGGTTCGCGAAGATGTCGATGATTACGATCGCAGCCTGCAAAACAAACAGCAGAt  <  1:1152241/62‑1 (MQ=255) atCGCGCTGGTTCGCGAAGATGTCGATGATTACGATCGCAGCCTGCAAAACAAACAGCAGAt  <  1:1146729/62‑1 (MQ=255) atCGCGCTGGTTCGCGAAGATGTCGATGATTACGATCGCAGCCTGCAAAACAAACAGCAGAt  <  1:1138799/62‑1 (MQ=255) atCGCGCTGGTTCGCGAAGATGTCGATGATTACGATCGCAGCCTGCAAAACAAACAGCAGAt  <  1:1125624/62‑1 (MQ=255) atCGCGCTGGTTCGCGAAGATGTCGATGATTACGATCGCAGCCTGCAAAACAAACAGCAGAt  <  1:1020563/62‑1 (MQ=255)  tCGCGCTGGTTCGCGAAGATGTCGATGATTACGATCGCAGCCTGCAAAACAAACAGCAGAt  <  1:310687/61‑1 (MQ=255)  tCGCGCTGGTTCGCGAAGATGTCGATGATTACGATCGCAGCCTGCAAAACAAACAGCAGAt  <  1:1221400/61‑1 (MQ=255)  tCGCGCTGGTTCGCGAAGATGTCGATGATTACGATCGCAGCCTGCAAAACAAACAGCAGAt  <  1:1118861/61‑1 (MQ=255)  tCGCGCTGGTTCGCGAAGATGTCGATGATTACGATCGCAGCCTGCAAAACAAACAGCAGAt  <  1:969560/61‑1 (MQ=255)                           tgatTACGATCGCAGCCTGCAAAACAAACAGCAGAt  <  1:522602/36‑1 (MQ=255)                                                              | ATCGCGCTGGTTCGCGAAGATGTCGATGATTACGATCGCAGCCTGCAAAACAAACAGCAGAT  >  W3110S.gb/3735270‑3735331

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑