Missing coverage evidence...
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GTTTACCGTGGAAAAGGGTAAAATAACGGATTAACCCAAGTATAAATGAGCGAG  >  W3110S.gb/3760236‑3760289                                                      | gTTTTCCGTGGAAAAGGGTAAAATAACGGATTAACCCAAGTATAAATGAGCgag  <  1:949197/54‑1 (MQ=255) gTTTACCGTGGAAAAGGGTAAAATAACGGTTTAACCCTAGTATAAATGAGCgag  <  1:1336374/54‑1 (MQ=39) gTTTACCGTGGAAAAGGGTAAAATAACGGATTAACCGAAGTATAAATGAGCgag  <  1:343630/54‑1 (MQ=255) gTTTACCGTGGAAAAGGGTAAAATAACGGATTAACCCAAGTATAAATGAGCgag  <  1:61541/54‑1 (MQ=255) gTTTACCGTGGAAAAGGGTAAAATAACGGATTAACCCAAGTATAAATGAGCgag  <  1:358161/54‑1 (MQ=255) gTTTACCGTGGAAAAGGGTAAAATAACGGATTAACCCAAGTATAAATGAGCgag  <  1:39419/54‑1 (MQ=255) gTTTACCGTGGAAAAGGGTAAAATAACGGATTAACCCAAGTATAAATGAGCgag  <  1:441526/54‑1 (MQ=255) gTTTACCGTGGAAAAGGGTAAAATAACGGATTAACCCAAGTATAAATGAGCgag  <  1:45980/54‑1 (MQ=255) gTTTACCGTGGAAAAGGGTAAAATAACGGATTAACCCAAGTATAAATGAGCgag  <  1:488674/54‑1 (MQ=255) gTTTACCGTGGAAAAGGGTAAAATAACGGATTAACCCAAGTATAAATGAGCgag  <  1:545825/54‑1 (MQ=255) gTTTACCGTGGAAAAGGGTAAAATAACGGATTAACCCAAGTATAAATGAGCgag  <  1:580481/54‑1 (MQ=255) gTTTACCGTGGAAAAGGGTAAAATAACGGATTAACCCAAGTATAAATGAGCgag  <  1:587385/54‑1 (MQ=255) gTTTACCGTGGAAAAGGGTAAAATAACGGATTAACCCAAGTATAAATGAGCgag  <  1:593514/54‑1 (MQ=255) gTTTACCGTGGAAAAGGGTAAAATAACGGATTAACCCAAGTATAAATGAGCgag  <  1:597113/54‑1 (MQ=255) gTTTACCGTGGAAAAGGGTAAAATAACGGATTAACCCAAGTATAAATGAGCgag  <  1:996425/54‑1 (MQ=255) gTTTACCGTGGAAAAGGGTAAAATAACGGATTAACCCAAGTATAAATGAGCgag  <  1:633519/54‑1 (MQ=255) gTTTACCGTGGAAAAGGGTAAAATAACGGATTAACCCAAGTATAAATGAGCgag  <  1:646736/54‑1 (MQ=255) gTTTACCGTGGAAAAGGGTAAAATAACGGATTAACCCAAGTATAAATGAGCgag  <  1:649290/54‑1 (MQ=255) gTTTACCGTGGAAAAGGGTAAAATAACGGATTAACCCAAGTATAAATGAGCgag  <  1:687885/54‑1 (MQ=255) gTTTACCGTGGAAAAGGGTAAAATAACGGATTAACCCAAGTATAAATGAGCgag  <  1:709811/54‑1 (MQ=255) gTTTACCGTGGAAAAGGGTAAAATAACGGATTAACCCAAGTATAAATGAGCgag  <  1:72106/54‑1 (MQ=255) gTTTACCGTGGAAAAGGGTAAAATAACGGATTAACCCAAGTATAAATGAGCgag  <  1:768710/54‑1 (MQ=255) gTTTACCGTGGAAAAGGGTAAAATAACGGATTAACCCAAGTATAAATGAGCgag  <  1:906559/54‑1 (MQ=255) gTTTACCGTGGAAAAGGGTAAAATAACGGATTAACCCAAGTATAAATGAGCgag  <  1:913863/54‑1 (MQ=255) gTTTACCGTGGAAAAGGGTAAAATAACGGATTAACCCAAGTATAAATGAGCgag  <  1:978306/54‑1 (MQ=255) gTTTACCGTGGAAAAGGGTAAAATAACGGATTAACCCAAGTATAAATGAGCgag  <  1:1026879/54‑1 (MQ=255) gTTTACCGTGGAAAAGGGTAAAATAACGGATTAACCCAAGTATAAATGAGCgag  <  1:128562/54‑1 (MQ=255) gTTTACCGTGGAAAAGGGTAAAATAACGGATTAACCCAAGTATAAATGAGCgag  <  1:104603/54‑1 (MQ=255) gTTTACCGTGGAAAAGGGTAAAATAACGGATTAACCCAAGTATAAATGAGCgag  <  1:1102727/54‑1 (MQ=255) gTTTACCGTGGAAAAGGGTAAAATAACGGATTAACCCAAGTATAAATGAGCgag  <  1:1125014/54‑1 (MQ=255) gTTTACCGTGGAAAAGGGTAAAATAACGGATTAACCCAAGTATAAATGAGCgag  <  1:1191771/54‑1 (MQ=255) gTTTACCGTGGAAAAGGGTAAAATAACGGATTAACCCAAGTATAAATGAGCgag  <  1:1197012/54‑1 (MQ=255) gTTTACCGTGGAAAAGGGTAAAATAACGGATTAACCCAAGTATAAATGAGCgag  <  1:1242931/54‑1 (MQ=255) gTTTACCGTGGAAAAGGGTAAAATAACGGATTAACCCAAGTATAAATGAGCgag  <  1:1267376/54‑1 (MQ=255) gTTTACCGTGGAAAAGGGTAAAATAACGGATTAACCCAAGTATAAATGAGCgag  <  1:1269913/54‑1 (MQ=255) gTTTACCGTGGAAAAGGGTAAAATAACGGATTAACCCAAGTATAAATGAGCgag  <  1:314929/54‑1 (MQ=255) gTTTACCGTGGAAAAGGGTAAAATAACGGATTAACCCAAGTATAAATGAGCgag  <  1:1313779/54‑1 (MQ=255) gTTTACCGTGGAAAAGGGTAAAATAACGGATTAACCCAAGTATAAATGAGCgag  <  1:1321530/54‑1 (MQ=255) gTTTACCGTGGAAAAGGGTAAAATAACGGATTAACCCAAGTATAAATGAGCgag  <  1:1353021/54‑1 (MQ=255) gTTTACCGTGGAAAAGGGTAAAATAACGGATTAACCCAAGTATAAATGAGCgag  <  1:1362884/54‑1 (MQ=255) gTTTACCGTGGAAAAGGGTAAAATAACGGATTAACCCAAGTATAAATGAGCgag  <  1:1376898/54‑1 (MQ=255) gTTTACCGTGGAAAAGGGTAAAATAACGGATTAACCCAAGTATAAATGAGCgag  <  1:147686/54‑1 (MQ=255) gTTTACCGTGGAAAAGGGTAAAATAACGGATTAACCCAAGTATAAATGAGCgag  <  1:151564/54‑1 (MQ=255) gTTTACCGTGGAAAAGGGTAAAATAACGGATTAACCCAAGTATAAATGAGCgag  <  1:197711/54‑1 (MQ=255) gTTTACCGTGGAAAAGGGTAAAATAACGGATTAACCCAAGTATAAATGAGCgag  <  1:227321/54‑1 (MQ=255) gTTTACCGTGGAAAAGGGTAAAATAACGGATTAACCCAAGTATAAATGAGCgag  <  1:293045/54‑1 (MQ=255) gTTTACCGTGGAAAAGGGTAAAATAACGGATTAACCCAAGAATAAATGAGCgag  <  1:961987/54‑1 (MQ=255)  tttACCGTGGAAAAGGGTAAAATAACGGATTAACCCAAGTATAAATGAGCgag  <  1:1371492/53‑1 (MQ=255)  tttACCGTGGAAAAGGGTAAAATAACGGATTAACCCAAGTATAAATGAGCgag  <  1:1201852/53‑1 (MQ=255)  tttACCGTGGAAAAGGGTAAAATAACGGATTAACCCAAGTATAAATGAGCgag  <  1:817593/53‑1 (MQ=255)         tGGAAAAGTGTAAAATAACTGATTAACCCAAGTATAAATGAGCgag  <  1:1087713/46‑1 (MQ=255)                                                      | GTTTACCGTGGAAAAGGGTAAAATAACGGATTAACCCAAGTATAAATGAGCGAG  >  W3110S.gb/3760236‑3760289

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑