Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3775502	3775576	75	52 [0]	[0] 24	yidE	predicted transporter

GCTGCGGGAGCTGGGGATCGTGCTGTTCCTCTCGGTCGTTGGTCTGAAATCTGGTGGGGA  >  W3110S.gb/3775442‑3775501                                                            | gcTGCGGGAGCTGGGGATCGTGCTGTTCCTCTCTGTCGTTGGTCTGAAATCTGGTGGGGa  <  1:584147/60‑1 (MQ=255) gcTGCGGGAGCTGGGGATCGTGCTGTTCCTCTCTGGCGTTGGTCTGAAATCTGGTGGGGa  <  1:959036/60‑1 (MQ=255) gcTGCGGGAGCTGGGGATCGTGCTGTTCCTCTCGGTCTTTGGTCTGAAATCTGGTGGGGa  <  1:1155014/60‑1 (MQ=255) gcTGCGGGAGCTGGGGATCGTGCTGTTCCTCTCGGTCGTTTGTCTGAAATCTTGTGGGGa  <  1:761645/60‑1 (MQ=255) gcTGCGGGAGCTGGGGATCGTGCTGTTCCTCTCGGTCGTTGGTCTGAAATCTGGTGGGGa  <  1:740413/60‑1 (MQ=255) gcTGCGGGAGCTGGGGATCGTGCTGTTCCTCTCGGTCGTTGGTCTGAAATCTGGTGGGGa  <  1:1020817/60‑1 (MQ=255) gcTGCGGGAGCTGGGGATCGTGCTGTTCCTCTCGGTCGTTGGTCTGAAATCTGGTGGGGa  <  1:462500/60‑1 (MQ=255) gcTGCGGGAGCTGGGGATCGTGCTGTTCCTCTCGGTCGTTGGTCTGAAATCTGGTGGGGa  <  1:474753/60‑1 (MQ=255) gcTGCGGGAGCTGGGGATCGTGCTGTTCCTCTCGGTCGTTGGTCTGAAATCTGGTGGGGa  <  1:489978/60‑1 (MQ=255) gcTGCGGGAGCTGGGGATCGTGCTGTTCCTCTCGGTCGTTGGTCTGAAATCTGGTGGGGa  <  1:544225/60‑1 (MQ=255) gcTGCGGGAGCTGGGGATCGTGCTGTTCCTCTCGGTCGTTGGTCTGAAATCTGGTGGGGa  <  1:577999/60‑1 (MQ=255) gcTGCGGGAGCTGGGGATCGTGCTGTTCCTCTCGGTCGTTGGTCTGAAATCTGGTGGGGa  <  1:590016/60‑1 (MQ=255) gcTGCGGGAGCTGGGGATCGTGCTGTTCCTCTCGGTCGTTGGTCTGAAATCTGGTGGGGa  <  1:666072/60‑1 (MQ=255) gcTGCGGGAGCTGGGGATCGTGCTGTTCCTCTCGGTCGTTGGTCTGAAATCTGGTGGGGa  <  1:685602/60‑1 (MQ=255) gcTGCGGGAGCTGGGGATCGTGCTGTTCCTCTCGGTCGTTGGTCTGAAATCTGGTGGGGa  <  1:699243/60‑1 (MQ=255) gcTGCGGGAGCTGGGGATCGTGCTGTTCCTCTCGGTCGTTGGTCTGAAATCTGGTGGGGa  <  1:72842/60‑1 (MQ=255) gcTGCGGGAGCTGGGGATCGTGCTGTTCCTCTCGGTCGTTGGTCTGAAATCTGGTGGGGa  <  1:398496/60‑1 (MQ=255) gcTGCGGGAGCTGGGGATCGTGCTGTTCCTCTCGGTCGTTGGTCTGAAATCTGGTGGGGa  <  1:767188/60‑1 (MQ=255) gcTGCGGGAGCTGGGGATCGTGCTGTTCCTCTCGGTCGTTGGTCTGAAATCTGGTGGGGa  <  1:777332/60‑1 (MQ=255) gcTGCGGGAGCTGGGGATCGTGCTGTTCCTCTCGGTCGTTGGTCTGAAATCTGGTGGGGa  <  1:847501/60‑1 (MQ=255) gcTGCGGGAGCTGGGGATCGTGCTGTTCCTCTCGGTCGTTGGTCTGAAATCTGGTGGGGa  <  1:902265/60‑1 (MQ=255) gcTGCGGGAGCTGGGGATCGTGCTGTTCCTCTCGGTCGTTGGTCTGAAATCTGGTGGGGa  <  1:916083/60‑1 (MQ=255) gcTGCGGGAGCTGGGGATCGTGCTGTTCCTCTCGGTCGTTGGTCTGAAATCTGGTGGGGa  <  1:938761/60‑1 (MQ=255) gcTGCGGGAGCTGGGGATCGTGCTGTTCCTCTCGGTCGTTGGTCTGAAATCTGGTGGGGa  <  1:942347/60‑1 (MQ=255) gcTGCGGGAGCTGGGGATCGTGCTGTTCCTCTCGGTCGTTGGTCTGAAATCTGGTGGGGa  <  1:959127/60‑1 (MQ=255) gcTGCGGGAGCTGGGGATCGTGCTGTTCCTCTCGGTCGTTGGTCTGAAATCTGGTGGGGa  <  1:990465/60‑1 (MQ=255) gcTGCGGGAGCTGGGGATCGTGCTGTTCCTCTCGGTCGTTGGTCTGAAATCTGGTGGGGa  <  1:1281846/60‑1 (MQ=255) gcTGCGGGAGCTGGGGATCGTGCTGTTCCTCTCGGTCGTTGGTCTGAAATCTGGTGGGGa  <  1:1032987/60‑1 (MQ=255) gcTGCGGGAGCTGGGGATCGTGCTGTTCCTCTCGGTCGTTGGTCTGAAATCTGGTGGGGa  <  1:1033734/60‑1 (MQ=255) gcTGCGGGAGCTGGGGATCGTGCTGTTCCTCTCGGTCGTTGGTCTGAAATCTGGTGGGGa  <  1:1117104/60‑1 (MQ=255) gcTGCGGGAGCTGGGGATCGTGCTGTTCCTCTCGGTCGTTGGTCTGAAATCTGGTGGGGa  <  1:113036/60‑1 (MQ=255) gcTGCGGGAGCTGGGGATCGTGCTGTTCCTCTCGGTCGTTGGTCTGAAATCTGGTGGGGa  <  1:114113/60‑1 (MQ=255) gcTGCGGGAGCTGGGGATCGTGCTGTTCCTCTCGGTCGTTGGTCTGAAATCTGGTGGGGa  <  1:1211625/60‑1 (MQ=255) gcTGCGGGAGCTGGGGATCGTGCTGTTCCTCTCGGTCGTTGGTCTGAAATCTGGTGGGGa  <  1:1221981/60‑1 (MQ=255) gcTGCGGGAGCTGGGGATCGTGCTGTTCCTCTCGGTCGTTGGTCTGAAATCTGGTGGGGa  <  1:1229726/60‑1 (MQ=255) gcTGCGGGAGCTGGGGATCGTGCTGTTCCTCTCGGTCGTTGGTCTGAAATCTGGTGGGGa  <  1:1249304/60‑1 (MQ=255) gcTGCGGGAGCTGGGGATCGTGCTGTTCCTCTCGGTCGTTGGTCTGAAATCTGGTGGGGa  <  1:37436/60‑1 (MQ=255) gcTGCGGGAGCTGGGGATCGTGCTGTTCCTCTCGGTCGTTGGTCTGAAATCTGGTGGGGa  <  1:1316565/60‑1 (MQ=255) gcTGCGGGAGCTGGGGATCGTGCTGTTCCTCTCGGTCGTTGGTCTGAAATCTGGTGGGGa  <  1:1333867/60‑1 (MQ=255) gcTGCGGGAGCTGGGGATCGTGCTGTTCCTCTCGGTCGTTGGTCTGAAATCTGGTGGGGa  <  1:1345183/60‑1 (MQ=255) gcTGCGGGAGCTGGGGATCGTGCTGTTCCTCTCGGTCGTTGGTCTGAAATCTGGTGGGGa  <  1:1355729/60‑1 (MQ=255) gcTGCGGGAGCTGGGGATCGTGCTGTTCCTCTCGGTCGTTGGTCTGAAATCTGGTGGGGa  <  1:139176/60‑1 (MQ=255) gcTGCGGGAGCTGGGGATCGTGCTGTTCCTCTCGGTCGTTGGTCTGAAATCTGGTGGGGa  <  1:146412/60‑1 (MQ=255) gcTGCGGGAGCTGGGGATCGTGCTGTTCCTCTCGGTCGTTGGTCTGAAATCTGGTGGGGa  <  1:197638/60‑1 (MQ=255) gcTGCGGGAGCTGGGGATCGTGCTGTTCCTCTCGGTCGTTGGTCTGAAATCTGGTGGGGa  <  1:255199/60‑1 (MQ=255) gcTGCGGGAGCTGGGGATCGTGCTGTTCCTCTCGGTCGTTGGTCTGAAATCTGGTGGGGa  <  1:286207/60‑1 (MQ=255) gcTGCGGGAGCTGGGGATCGTGCTGTTCCTCTCGGTCGTTGGTCTGAAATCTGGTGGGGa  <  1:368176/60‑1 (MQ=255) gcTGCGGGAGCTGGGGATCGTGCTGTTCCTCTCGGTCGTTGGTCTGAAATCTGGTGGGGa  <  1:368449/60‑1 (MQ=255) gcTGCGGGAGCTGGGGATCGTGCTGTTCCTCTCGGGCGTTGGTCTGAAATCTGGTGGGGa  <  1:598769/60‑1 (MQ=255)  cTGCGGGAGCTGGGGATCGTGCTGTTCCTCTCGGTCGTTGGTCTGAAATCTGGTGGGGa  <  1:1223420/59‑1 (MQ=255)  cTGCGGGAGCTGGGGATCGTGCTGTTCCTCTCGGTCGTTGGTCTGAAATCTGGTGGGGa  <  1:1047325/59‑1 (MQ=255)            tGGGGATCGTGCTGTTCCTCTCGGTCGTTGGTCTGAAATCTGGTGGGGa  <  1:775612/49‑1 (MQ=255)                                                            | GCTGCGGGAGCTGGGGATCGTGCTGTTCCTCTCGGTCGTTGGTCTGAAATCTGGTGGGGA  >  W3110S.gb/3775442‑3775501

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑