Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3794095	3794462	368	59 [0]	[0] 44	uhpT	hexose phosphate transporter

TGCTGTGCTTCGCCAACATTTTCCTCTATGTGGTACGTATTGGTATCGACCAGTGGTC  >  W3110S.gb/3794037‑3794094                                                          | tgctgTGCTTCGCCAACATTTTCCTCTATGTGGTACGTATTGGTATCGACCAGTGGTc  <  1:724126/58‑1 (MQ=255) tgctgTGCTTCGCCAACATTTTCCTCTATGTGGTACGTATTGGTATCGACCAGTGGTc  <  1:23849/58‑1 (MQ=255) tgctgTGCTTCGCCAACATTTTCCTCTATGTGGTACGTATTGGTATCGACCAGTGGTc  <  1:248126/58‑1 (MQ=255) tgctgTGCTTCGCCAACATTTTCCTCTATGTGGTACGTATTGGTATCGACCAGTGGTc  <  1:260117/58‑1 (MQ=255) tgctgTGCTTCGCCAACATTTTCCTCTATGTGGTACGTATTGGTATCGACCAGTGGTc  <  1:313948/58‑1 (MQ=255) tgctgTGCTTCGCCAACATTTTCCTCTATGTGGTACGTATTGGTATCGACCAGTGGTc  <  1:357648/58‑1 (MQ=255) tgctgTGCTTCGCCAACATTTTCCTCTATGTGGTACGTATTGGTATCGACCAGTGGTc  <  1:359739/58‑1 (MQ=255) tgctgTGCTTCGCCAACATTTTCCTCTATGTGGTACGTATTGGTATCGACCAGTGGTc  <  1:361367/58‑1 (MQ=255) tgctgTGCTTCGCCAACATTTTCCTCTATGTGGTACGTATTGGTATCGACCAGTGGTc  <  1:395372/58‑1 (MQ=255) tgctgTGCTTCGCCAACATTTTCCTCTATGTGGTACGTATTGGTATCGACCAGTGGTc  <  1:48753/58‑1 (MQ=255) tgctgTGCTTCGCCAACATTTTCCTCTATGTGGTACGTATTGGTATCGACCAGTGGTc  <  1:500022/58‑1 (MQ=255) tgctgTGCTTCGCCAACATTTTCCTCTATGTGGTACGTATTGGTATCGACCAGTGGTc  <  1:512929/58‑1 (MQ=255) tgctgTGCTTCGCCAACATTTTCCTCTATGTGGTACGTATTGGTATCGACCAGTGGTc  <  1:530388/58‑1 (MQ=255) tgctgTGCTTCGCCAACATTTTCCTCTATGTGGTACGTATTGGTATCGACCAGTGGTc  <  1:534200/58‑1 (MQ=255) tgctgTGCTTCGCCAACATTTTCCTCTATGTGGTACGTATTGGTATCGACCAGTGGTc  <  1:1086906/58‑1 (MQ=255) tgctgTGCTTCGCCAACATTTTCCTCTATGTGGTACGTATTGGTATCGACCAGTGGTc  <  1:786567/58‑1 (MQ=255) tgctgTGCTTCGCCAACATTTTCCTCTATGTGGTACGTATTGGTATCGACCAGTGGTc  <  1:791783/58‑1 (MQ=255) tgctgTGCTTCGCCAACATTTTCCTCTATGTGGTACGTATTGGTATCGACCAGTGGTc  <  1:794739/58‑1 (MQ=255) tgctgTGCTTCGCCAACATTTTCCTCTATGTGGTACGTATTGGTATCGACCAGTGGTc  <  1:815756/58‑1 (MQ=255) tgctgTGCTTCGCCAACATTTTCCTCTATGTGGTACGTATTGGTATCGACCAGTGGTc  <  1:85327/58‑1 (MQ=255) tgctgTGCTTCGCCAACATTTTCCTCTATGTGGTACGTATTGGTATCGACCAGTGGTc  <  1:858560/58‑1 (MQ=255) tgctgTGCTTCGCCAACATTTTCCTCTATGTGGTACGTATTGGTATCGACCAGTGGTc  <  1:870023/58‑1 (MQ=255) tgctgTGCTTCGCCAACATTTTCCTCTATGTGGTACGTATTGGTATCGACCAGTGGTc  <  1:904485/58‑1 (MQ=255) tgctgTGCTTCGCCAACATTTTCCTCTATGTGGTACGTATTGGTATCGACCAGTGGTc  <  1:931219/58‑1 (MQ=255) tgctgTGCTTCGCCAACATTTTCCTCTATGTGGTACGTATTGGTATCGACCAGTGGTc  <  1:934722/58‑1 (MQ=255) tgctgTGCTTCGCCAACATTTTCCTCTATGTGGTACGTATTGGTATCGACCAGTGGTc  <  1:972092/58‑1 (MQ=255) tgctgTGCTTCGCCAACATTTTCCTCTATGTGGTACGTATTGGTATCGACCAGTGGTc  <  1:980977/58‑1 (MQ=255) tgctgTGCTTCGCCAACATTTTCCTCTATGTGGTACGTATTGGTATCGACCAGTGGTc  <  1:232329/58‑1 (MQ=255) tgctgTGCTTCGCCAACATTTTCCTCTATGTGGTACGTATTGGTATCGACCAGTGGTc  <  1:1212304/58‑1 (MQ=255) tgctgTGCTTCGCCAACATTTTCCTCTATGTGGTACGTATTGGTATCGACCAGTGGTc  <  1:119485/58‑1 (MQ=255) tgctgTGCTTCGCCAACATTTTCCTCTATGTGGTACGTATTGGTATCGACCAGTGGTc  <  1:1237609/58‑1 (MQ=255) tgctgTGCTTCGCCAACATTTTCCTCTATGTGGTACGTATTGGTATCGACCAGTGGTc  <  1:1101008/58‑1 (MQ=255) tgctgTGCTTCGCCAACATTTTCCTCTATGTGGTACGTATTGGTATCGACCAGTGGTc  <  1:1243536/58‑1 (MQ=255) tgctgTGCTTCGCCAACATTTTCCTCTATGTGGTACGTATTGGTATCGACCAGTGGTc  <  1:1274766/58‑1 (MQ=255) tgctgTGCTTCGCCAACATTTTCCTCTATGTGGTACGTATTGGTATCGACCAGTGGTc  <  1:1292449/58‑1 (MQ=255) tgctgTGCTTCGCCAACATTTTCCTCTATGTGGTACGTATTGGTATCGACCAGTGGTc  <  1:132777/58‑1 (MQ=255) tgctgTGCTTCGCCAACATTTTCCTCTATGTGGTACGTATTGGTATCGACCAGTGGTc  <  1:1338017/58‑1 (MQ=255) tgctgTGCTTCGCCAACATTTTCCTCTATGTGGTACGTATTGGTATCGACCAGTGGTc  <  1:1357920/58‑1 (MQ=255) tgctgTGCTTCGCCAACATTTTCCTCTATGTGGTACGTATTGGTATCGACCAGTGGTc  <  1:136320/58‑1 (MQ=255) tgctgTGCTTCGCCAACATTTTCCTCTATGTGGTACGTATTGGTATCGACCAGTGGTc  <  1:1367013/58‑1 (MQ=255) tgctgTGCTTCGCCAACATTTTCCTCTATGTGGTACGTATTGGTATCGACCAGTGGTc  <  1:1392814/58‑1 (MQ=255) tgctgTGCTTCGCCAACATTTTCCTCTATGTGGTACGTATTGGTATCGACCAGTGGTc  <  1:1398183/58‑1 (MQ=255) tgctgTGCTTCGCCAACATTTTCCTCTATGTGGTACGTATTGGTATCGACCAGTGGTc  <  1:1425950/58‑1 (MQ=255) tgctgTGCTTCGCCAACATTTTCCTCTATGTGGTACGTATTGGTATCGACCAGTGGTc  <  1:1440602/58‑1 (MQ=255) tgctgTGCTTCGCCAACATTTTCCTCTATGTGGTACGTATTGGTATCGACCAGTGGTc  <  1:1458301/58‑1 (MQ=255) tgctgTGCTTCGCCAACATTTTCCTCTATGTGGTACGTATTGGTATCGACCAGTGGTc  <  1:1033211/58‑1 (MQ=255) tgctgTGCTTCGCCAACATTTTCCTCTATGTGGTACGTATTGGTATCGACCAGTGGTc  <  1:181058/58‑1 (MQ=255) tgctgTGCTTCGCCAACATTTTCCTCTATGTGGTACGTATTGGTATCGACCAGTGGTc  <  1:199619/58‑1 (MQ=255) tgctgTGCTTCGCCAACATTTTCCTCTATGTGGTACGTATTGGTATCGACCAGTGGTc  <  1:214171/58‑1 (MQ=255) tgctgTGCTTCGCCAACATTTTCCTCTATGTGGTACGTAATGGTATCGACCAGTGGTc  <  1:369657/58‑1 (MQ=255) tgctgTGCTTCGCCAACATTTTCCTCTATGTGATACGTATTGGTATCGACCAGTGGTc  <  1:1443527/58‑1 (MQ=255) tgctgTGCTTCGCCAACATTTTCCTCTATGAGGTACGTATTGGTATCGACCAGTGGTc  <  1:1388287/58‑1 (MQ=255)  gctgTGCTTCGCCAACATTTTCCTCTATGTGGTACGTATTGGTATCGACCAGTGGTc  <  1:982572/57‑1 (MQ=255)  gctgTGCTTCGCCAACATTTTCCTCTATGTGGTACGTATTGGTATCGACCAGTGGTc  <  1:906687/57‑1 (MQ=255)  gctgTGCTTCGCCAACATTTTCCTCTATGTGGTACGTATTGGTATCGACCAGTGGTc  <  1:1236936/57‑1 (MQ=255)  gctgTGCTTCGCCAACATTTTCCTCTATGTGGTACGTATTGGTATCGACCAGTGGTc  <  1:327377/57‑1 (MQ=255)          tCGCCAACATTTTCCTCTATGTGGTACGTATTGGTATCGACCAGTGGTc  <  1:242087/49‑1 (MQ=255)           cGCCAACATTTTCCTCTATGTGGTACGTATTGGTATCGACCAGTGGTc  <  1:1239419/48‑1 (MQ=255)               aaCATTTTCCTCTATGTGGTACGTATTGGTATCGACCAGTGGTc  <  1:916594/44‑1 (MQ=255)                                                          | TGCTGTGCTTCGCCAACATTTTCCTCTATGTGGTACGTATTGGTATCGACCAGTGGTC  >  W3110S.gb/3794037‑3794094

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑