Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3804843	3804902	60	73 [1]	[1] 21	yicJ	predicted transporter

AGCACGCCAGATCTCAGTATGAACGGCAAAATGATCTATGCAGCAATTACTTACACCCTACT  >  W3110S.gb/3804782‑3804843                                                             |  aGCACGCCAGATCTCAGTATGAACGGCAAAATGATCTATGCAGCAATTACTTACACCCTAct  >  1:40488/1‑62 (MQ=255)  gCACGCCAGATCTCAGTATGAACGGCAAAATGATCTATGCAGCAATTACTTACACCCTAc   <  1:496523/60‑1 (MQ=255)  gCACGCCAGATCTCAGTATGAACGGCAAAATGATCTATGCAGCAATTACTTACACCCTAc   <  1:636508/60‑1 (MQ=255)  gCACGCCAGATCTCAGTATGAACGGCAAAATGATCTATGCAGCAATTACTTACACCCTAc   <  1:632978/60‑1 (MQ=255)  gCACGCCAGATCTCAGTATGAACGGCAAAATGATCTATGCAGCAATTACTTACACCCTAc   <  1:581621/60‑1 (MQ=255)  gCACGCCAGATCTCAGTATGAACGGCAAAATGATCTATGCAGCAATTACTTACACCCTAc   <  1:569946/60‑1 (MQ=255)  gCACGCCAGATCTCAGTATGAACGGCAAAATGATCTATGCAGCAATTACTTACACCCTAc   <  1:553309/60‑1 (MQ=255)  gCACGCCAGATCTCAGTATGAACGGCAAAATGATCTATGCAGCAATTACTTACACCCTAc   <  1:548310/60‑1 (MQ=255)  gCACGCCAGATCTCAGTATGAACGGCAAAATGATCTATGCAGCAATTACTTACACCCTAc   <  1:54191/60‑1 (MQ=255)  gCACGCCAGATCTCAGTATGAACGGCAAAATGATCTATGCAGCAATTACTTACACCCTAc   <  1:524535/60‑1 (MQ=255)  gCACGCCAGATCTCAGTATGAACGGCAAAATGATCTATGCAGCAATTACTTACACCCTAc   <  1:673717/60‑1 (MQ=255)  gCACGCCAGATCTCAGTATGAACGGCAAAATGATCTATGCAGCAATTACTTACACCCTAc   <  1:481585/60‑1 (MQ=255)  gCACGCCAGATCTCAGTATGAACGGCAAAATGATCTATGCAGCAATTACTTACACCCTAc   <  1:479896/60‑1 (MQ=255)  gCACGCCAGATCTCAGTATGAACGGCAAAATGATCTATGCAGCAATTACTTACACCCTAc   <  1:462236/60‑1 (MQ=255)  gCACGCCAGATCTCAGTATGAACGGCAAAATGATCTATGCAGCAATTACTTACACCCTAc   <  1:443282/60‑1 (MQ=255)  gCACGCCAGATCTCAGTATGAACGGCAAAATGATCTATGCAGCAATTACTTACACCCTAc   <  1:433868/60‑1 (MQ=255)  gCACGCCAGATCTCAGTATGAACGGCAAAATGATCTATGCAGCAATTACTTACACCCTAc   <  1:394365/60‑1 (MQ=255)  gCACGCCAGATCTCAGTATGAACGGCAAAATGATCTATGCAGCAATTACTTACACCCTAc   <  1:1041639/60‑1 (MQ=255)  gCACGCCAGATCTCAGTATGAACGGCAAAATGATCTATGCAGCAATTACTTACACCCTAc   <  1:868632/60‑1 (MQ=255)  gCACGCCAGATCTCAGTATGAACGGCAAAATGATCTATGCAGCAATTACTTACACCCTAc   <  1:967321/60‑1 (MQ=255)  gCACGCCAGATCTCAGTATGAACGGCAAAATGATCTATGCAGCAATTACTTACACCCTAc   <  1:944571/60‑1 (MQ=255)  gCACGCCAGATCTCAGTATGAACGGCAAAATGATCTATGCAGCAATTACTTACACCCTAc   <  1:93449/60‑1 (MQ=255)  gCACGCCAGATCTCAGTATGAACGGCAAAATGATCTATGCAGCAATTACTTACACCCTAc   <  1:92755/60‑1 (MQ=255)  gCACGCCAGATCTCAGTATGAACGGCAAAATGATCTATGCAGCAATTACTTACACCCTAc   <  1:916899/60‑1 (MQ=255)  gCACGCCAGATCTCAGTATGAACGGCAAAATGATCTATGCAGCAATTACTTACACCCTAc   <  1:898928/60‑1 (MQ=255)  gCACGCCAGATCTCAGTATGAACGGCAAAATGATCTATGCAGCAATTACTTACACCCTAc   <  1:897003/60‑1 (MQ=255)  gCACGCCAGATCTCAGTATGAACGGCAAAATGATCTATGCAGCAATTACTTACACCCTAc   <  1:879272/60‑1 (MQ=255)  gCACGCCAGATCTCAGTATGAACGGCAAAATGATCTATGCAGCAATTACTTACACCCTAc   <  1:376110/60‑1 (MQ=255)  gCACGCCAGATCTCAGTATGAACGGCAAAATGATCTATGCAGCAATTACTTACACCCTAc   <  1:849106/60‑1 (MQ=255)  gCACGCCAGATCTCAGTATGAACGGCAAAATGATCTATGCAGCAATTACTTACACCCTAc   <  1:805622/60‑1 (MQ=255)  gCACGCCAGATCTCAGTATGAACGGCAAAATGATCTATGCAGCAATTACTTACACCCTAc   <  1:804890/60‑1 (MQ=255)  gCACGCCAGATCTCAGTATGAACGGCAAAATGATCTATGCAGCAATTACTTACACCCTAc   <  1:795740/60‑1 (MQ=255)  gCACGCCAGATCTCAGTATGAACGGCAAAATGATCTATGCAGCAATTACTTACACCCTAc   <  1:794575/60‑1 (MQ=255)  gCACGCCAGATCTCAGTATGAACGGCAAAATGATCTATGCAGCAATTACTTACACCCTAc   <  1:721093/60‑1 (MQ=255)  gCACGCCAGATCTCAGTATGAACGGCAAAATGATCTATGCAGCAATTACTTACACCCTAc   <  1:716639/60‑1 (MQ=255)  gCACGCCAGATCTCAGTATGAACGGCAAAATGATCTATGCAGCAATTACTTACACCCTAc   <  1:705410/60‑1 (MQ=255)  gCACGCCAGATCTCAGTATGAACGGCAAAATGATCTATGCAGCAATTACTTACACCCTAc   <  1:120903/60‑1 (MQ=255)  gCACGCCAGATCTCAGTATGAACGGCAAAATGATCTATGCAGCAATTACTTACACCCTAc   <  1:1282929/60‑1 (MQ=255)  gCACGCCAGATCTCAGTATGAACGGCAAAATGATCTATGCAGCAATTACTTACACCCTAc   <  1:1276555/60‑1 (MQ=255)  gCACGCCAGATCTCAGTATGAACGGCAAAATGATCTATGCAGCAATTACTTACACCCTAc   <  1:1266519/60‑1 (MQ=255)  gCACGCCAGATCTCAGTATGAACGGCAAAATGATCTATGCAGCAATTACTTACACCCTAc   <  1:1265792/60‑1 (MQ=255)  gCACGCCAGATCTCAGTATGAACGGCAAAATGATCTATGCAGCAATTACTTACACCCTAc   <  1:1264995/60‑1 (MQ=255)  gCACGCCAGATCTCAGTATGAACGGCAAAATGATCTATGCAGCAATTACTTACACCCTAc   <  1:1249003/60‑1 (MQ=255)  gCACGCCAGATCTCAGTATGAACGGCAAAATGATCTATGCAGCAATTACTTACACCCTAc   <  1:1248690/60‑1 (MQ=255)  gCACGCCAGATCTCAGTATGAACGGCAAAATGATCTATGCAGCAATTACTTACACCCTAc   <  1:121336/60‑1 (MQ=255)  gCACGCCAGATCTCAGTATGAACGGCAAAATGATCTATGCAGCAATTACTTACACCCTAc   <  1:1304736/60‑1 (MQ=255)  gCACGCCAGATCTCAGTATGAACGGCAAAATGATCTATGCAGCAATTACTTACACCCTAc   <  1:1189581/60‑1 (MQ=255)  gCACGCCAGATCTCAGTATGAACGGCAAAATGATCTATGCAGCAATTACTTACACCCTAc   <  1:1189568/60‑1 (MQ=255)  gCACGCCAGATCTCAGTATGAACGGCAAAATGATCTATGCAGCAATTACTTACACCCTAc   <  1:1187220/60‑1 (MQ=255)  gCACGCCAGATCTCAGTATGAACGGCAAAATGATCTATGCAGCAATTACTTACACCCTAc   <  1:1129887/60‑1 (MQ=255)  gCACGCCAGATCTCAGTATGAACGGCAAAATGATCTATGCAGCAATTACTTACACCCTAc   <  1:1106158/60‑1 (MQ=255)  gCACGCCAGATCTCAGTATGAACGGCAAAATGATCTATGCAGCAATTACTTACACCCTAc   <  1:1076994/60‑1 (MQ=255)  gCACGCCAGATCTCAGTATGAACGGCAAAATGATCTATGCAGCAATTACTTACACCCTAc   <  1:1074517/60‑1 (MQ=255)  gCACGCCAGATCTCAGTATGAACGGCAAAATGATCTATGCAGCAATTACTTACACCCTAc   <  1:1071978/60‑1 (MQ=255)  gCACGCCAGATCTCAGTATGAACGGCAAAATGATCTATGCAGCAATTACTTACACCCTAc   <  1:1460634/60‑1 (MQ=255)  gCACGCCAGATCTCAGTATGAACGGCAAAATGATCTATGCAGCAATTACTTACACCCTAc   <  1:291781/60‑1 (MQ=255)  gCACGCCAGATCTCAGTATGAACGGCAAAATGATCTATGCAGCAATTACTTACACCCTAc   <  1:278458/60‑1 (MQ=255)  gCACGCCAGATCTCAGTATGAACGGCAAAATGATCTATGCAGCAATTACTTACACCCTAc   <  1:256713/60‑1 (MQ=255)  gCACGCCAGATCTCAGTATGAACGGCAAAATGATCTATGCAGCAATTACTTACACCCTAc   <  1:212051/60‑1 (MQ=255)  gCACGCCAGATCTCAGTATGAACGGCAAAATGATCTATGCAGCAATTACTTACACCCTAc   <  1:17791/60‑1 (MQ=255)  gCACGCCAGATCTCAGTATGAACGGCAAAATGATCTATGCAGCAATTACTTACACCCTAc   <  1:177602/60‑1 (MQ=255)  gCACGCCAGATCTCAGTATGAACGGCAAAATGATCTATGCAGCAATTACTTACACCCTAc   <  1:175585/60‑1 (MQ=255)  gCACGCCAGATCTCAGTATGAACGGCAAAATGATCTATGCAGCAATTACTTACACCCTAc   <  1:1465978/60‑1 (MQ=255)  gCACGCCAGATCTCAGTATGAACGGCAAAATGATCTATGCAGCAATTACTTACACCCTAc   <  1:364140/60‑1 (MQ=255)  gCACGCCAGATCTCAGTATGAACGGCAAAATGATCTATGCAGCAATTACTTACACCCTAc   <  1:1438822/60‑1 (MQ=255)  gCACGCCAGATCTCAGTATGAACGGCAAAATGATCTATGCAGCAATTACTTACACCCTAc   <  1:1432203/60‑1 (MQ=255)  gCACGCCAGATCTCAGTATGAACGGCAAAATGATCTATGCAGCAATTACTTACACCCTAc   <  1:1333078/60‑1 (MQ=255)  gCACGCCAGATCTCAGTATGAACGGCAAAATGATCTATGCAGCAATTACATACACCCTAc   <  1:1220888/60‑1 (MQ=255)   cACGCCAGATCTCAGTATGAACGGCAAAATGATCTATGCAGCAATTACTTACACCCTAc   <  1:1390331/59‑1 (MQ=255)            tctcAGTATGAACGGCAAAATGATCTATGCAGCAATTACTTACACCCTAc   <  1:406081/50‑1 (MQ=255)                     gAAAGGCAAAATGATCTATGCAGCAATTACTTACACCCTAc   <  1:1441387/41‑1 (MQ=255)                      aaCGGCAAAATGATCTATGCAGCAATTACTTACACCCTAc   <  1:1388786/40‑1 (MQ=255)                        cGGCAAAATGATCTATGCAGCAATTACTTACACCCTAc   <  1:58910/38‑1 (MQ=255)                                                             |  AGCACGCCAGATCTCAGTATGAACGGCAAAATGATCTATGCAGCAATTACTTACACCCTACT  >  W3110S.gb/3804782‑3804843

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑