Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3809642	3809844	203	55 [0]	[0] 10	yicH	conserved hypothetical protein

CGGCTTTGAACGGTAGCGGCGCGGTCTGGTCGGTGAGATTCAGCG  >  W3110S.gb/3809597‑3809641                                             | cGGCTTTGAACGGTTGCGGCGCGGTCTGGGCGGTGAGATTCAGCg  <  1:1161660/45‑1 (MQ=38) cGGCTTTGAACGGTAGCGGCGCGGTCTTGTCGGTGAGATTCAGCg  <  1:86979/45‑1 (MQ=255) cGGCTTTGAACGGTAGCGGCGCGGTCTGGTCGGTGAGATTCATCg  <  1:1118906/45‑1 (MQ=255) cGGCTTTGAACGGTAGCGGCGCGGTCTGGTCGGTGAGATTCAGCg  <  1:7190/45‑1 (MQ=255) cGGCTTTGAACGGTAGCGGCGCGGTCTGGTCGGTGAGATTCAGCg  <  1:564465/45‑1 (MQ=255) cGGCTTTGAACGGTAGCGGCGCGGTCTGGTCGGTGAGATTCAGCg  <  1:572142/45‑1 (MQ=255) cGGCTTTGAACGGTAGCGGCGCGGTCTGGTCGGTGAGATTCAGCg  <  1:583577/45‑1 (MQ=255) cGGCTTTGAACGGTAGCGGCGCGGTCTGGTCGGTGAGATTCAGCg  <  1:620669/45‑1 (MQ=255) cGGCTTTGAACGGTAGCGGCGCGGTCTGGTCGGTGAGATTCAGCg  <  1:650569/45‑1 (MQ=255) cGGCTTTGAACGGTAGCGGCGCGGTCTGGTCGGTGAGATTCAGCg  <  1:662871/45‑1 (MQ=255) cGGCTTTGAACGGTAGCGGCGCGGTCTGGTCGGTGAGATTCAGCg  <  1:66794/45‑1 (MQ=255) cGGCTTTGAACGGTAGCGGCGCGGTCTGGTCGGTGAGATTCAGCg  <  1:680353/45‑1 (MQ=255) cGGCTTTGAACGGTAGCGGCGCGGTCTGGTCGGTGAGATTCAGCg  <  1:688034/45‑1 (MQ=255) cGGCTTTGAACGGTAGCGGCGCGGTCTGGTCGGTGAGATTCAGCg  <  1:694273/45‑1 (MQ=255) cGGCTTTGAACGGTAGCGGCGCGGTCTGGTCGGTGAGATTCAGCg  <  1:696863/45‑1 (MQ=255) cGGCTTTGAACGGTAGCGGCGCGGTCTGGTCGGTGAGATTCAGCg  <  1:696914/45‑1 (MQ=255) cGGCTTTGAACGGTAGCGGCGCGGTCTGGTCGGTGAGATTCAGCg  <  1:703139/45‑1 (MQ=255) cGGCTTTGAACGGTAGCGGCGCGGTCTGGTCGGTGAGATTCAGCg  <  1:520356/45‑1 (MQ=255) cGGCTTTGAACGGTAGCGGCGCGGTCTGGTCGGTGAGATTCAGCg  <  1:729934/45‑1 (MQ=255) cGGCTTTGAACGGTAGCGGCGCGGTCTGGTCGGTGAGATTCAGCg  <  1:807040/45‑1 (MQ=255) cGGCTTTGAACGGTAGCGGCGCGGTCTGGTCGGTGAGATTCAGCg  <  1:816251/45‑1 (MQ=255) cGGCTTTGAACGGTAGCGGCGCGGTCTGGTCGGTGAGATTCAGCg  <  1:830075/45‑1 (MQ=255) cGGCTTTGAACGGTAGCGGCGCGGTCTGGTCGGTGAGATTCAGCg  <  1:857945/45‑1 (MQ=255) cGGCTTTGAACGGTAGCGGCGCGGTCTGGTCGGTGAGATTCAGCg  <  1:930941/45‑1 (MQ=255) cGGCTTTGAACGGTAGCGGCGCGGTCTGGTCGGTGAGATTCAGCg  <  1:931131/45‑1 (MQ=255) cGGCTTTGAACGGTAGCGGCGCGGTCTGGTCGGTGAGATTCAGCg  <  1:974712/45‑1 (MQ=255) cGGCTTTGAACGGTAGCGGCGCGGTCTGGTCGGTGAGATTCAGCg  <  1:993902/45‑1 (MQ=255) cGGCTTTGAACGGTAGCGGCGCGGTCTGGTCGGTGAGATTCAGCg  <  1:1443728/45‑1 (MQ=255) cGGCTTTGAACGGTAGCGGCGCGGTCTGGTCGGTGAGATTCAGCg  <  1:104059/45‑1 (MQ=255) cGGCTTTGAACGGTAGCGGCGCGGTCTGGTCGGTGAGATTCAGCg  <  1:1059465/45‑1 (MQ=255) cGGCTTTGAACGGTAGCGGCGCGGTCTGGTCGGTGAGATTCAGCg  <  1:1079223/45‑1 (MQ=255) cGGCTTTGAACGGTAGCGGCGCGGTCTGGTCGGTGAGATTCAGCg  <  1:117597/45‑1 (MQ=255) cGGCTTTGAACGGTAGCGGCGCGGTCTGGTCGGTGAGATTCAGCg  <  1:1191601/45‑1 (MQ=255) cGGCTTTGAACGGTAGCGGCGCGGTCTGGTCGGTGAGATTCAGCg  <  1:1194482/45‑1 (MQ=255) cGGCTTTGAACGGTAGCGGCGCGGTCTGGTCGGTGAGATTCAGCg  <  1:1196698/45‑1 (MQ=255) cGGCTTTGAACGGTAGCGGCGCGGTCTGGTCGGTGAGATTCAGCg  <  1:1197520/45‑1 (MQ=255) cGGCTTTGAACGGTAGCGGCGCGGTCTGGTCGGTGAGATTCAGCg  <  1:1228925/45‑1 (MQ=255) cGGCTTTGAACGGTAGCGGCGCGGTCTGGTCGGTGAGATTCAGCg  <  1:1231928/45‑1 (MQ=255) cGGCTTTGAACGGTAGCGGCGCGGTCTGGTCGGTGAGATTCAGCg  <  1:1275153/45‑1 (MQ=255) cGGCTTTGAACGGTAGCGGCGCGGTCTGGTCGGTGAGATTCAGCg  <  1:1018106/45‑1 (MQ=255) cGGCTTTGAACGGTAGCGGCGCGGTCTGGTCGGTGAGATTCAGCg  <  1:154289/45‑1 (MQ=255) cGGCTTTGAACGGTAGCGGCGCGGTCTGGTCGGTGAGATTCAGCg  <  1:205053/45‑1 (MQ=255) cGGCTTTGAACGGTAGCGGCGCGGTCTGGTCGGTGAGATTCAGCg  <  1:247254/45‑1 (MQ=255) cGGCTTTGAACGGTAGCGGCGCGGTCTGGTCGGTGAGATTCAGCg  <  1:247307/45‑1 (MQ=255) cGGCTTTGAACGGTAGCGGCGCGGTCTGGTCGGTGAGATTCAGCg  <  1:313262/45‑1 (MQ=255) cGGCTTTGAACGGTAGCGGCGCGGTCTGGTCGGTGAGATTCAGCg  <  1:395335/45‑1 (MQ=255) cGGCTTTGAACGGTAGCGGCGCGGTCTGGTCGGTGAGATTCAGCg  <  1:403570/45‑1 (MQ=255) cGGCTTTGAACGGTAGCGGCGCGGTCTGGTCGGTGAGATTCAGCg  <  1:417726/45‑1 (MQ=255) cGGCTTTGAACGGTAGCGGCGCGGTCTGGTCGGTGAGATTCAGCg  <  1:450534/45‑1 (MQ=255) cGGCTTTGAACGGTAGCGGCGCGGTCTGGTCGGTGAGATTCAGCg  <  1:451010/45‑1 (MQ=255) cGGCTTTGAACGGTAGCGGCGCGGTCTGGTCGGTGAGATTCAGCg  <  1:46899/45‑1 (MQ=255) cGGCTTTGAACGGTAGCGGCGCGGTCTGGTCGGTGAGATTCAGCg  <  1:481842/45‑1 (MQ=255)  ggCTTTGAACGGTAGCGGCGCGGTCTGGTCGGTGAGATTCAGCg  <  1:885793/44‑1 (MQ=255)  ggCTTTGAACGGTAGCGGCGCGGTCTGGTCGGTGAGATTCAGCg  <  1:977604/44‑1 (MQ=255)   gCTTTGAACGGTAGCGGCGCGGTCTGGTCGGTGAGATTCAGCg  <  1:547161/43‑1 (MQ=255)                                             | CGGCTTTGAACGGTAGCGGCGCGGTCTGGTCGGTGAGATTCAGCG  >  W3110S.gb/3809597‑3809641

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑