Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3843307	3843433	127	27 [0]	[0] 12	rfaL	O‑antigen ligase

GGGAAGAATAAGGTTTTTTATATTATAATTTTCTTGTCTGCCACGTAAAATTAGTGACAATA  >  W3110S.gb/3843245‑3843306                                                              | gggAAGAATAAGGTTTTTTATATTATAATTTTCTTGTCTGCCACGTAAAATTAGTGACAATa  <  1:1100426/62‑1 (MQ=255) gggAAGAATAAGGTTTTTTATATTATAATTTTCTTGTCTGCCACGTAAAATTAGTGACAATa  <  1:801563/62‑1 (MQ=255) gggAAGAATAAGGTTTTTTATATTATAATTTTCTTGTCTGCCACGTAAAATTAGTGACAATa  <  1:800846/62‑1 (MQ=255) gggAAGAATAAGGTTTTTTATATTATAATTTTCTTGTCTGCCACGTAAAATTAGTGACAATa  <  1:779949/62‑1 (MQ=255) gggAAGAATAAGGTTTTTTATATTATAATTTTCTTGTCTGCCACGTAAAATTAGTGACAATa  <  1:752554/62‑1 (MQ=255) gggAAGAATAAGGTTTTTTATATTATAATTTTCTTGTCTGCCACGTAAAATTAGTGACAATa  <  1:74738/62‑1 (MQ=255) gggAAGAATAAGGTTTTTTATATTATAATTTTCTTGTCTGCCACGTAAAATTAGTGACAATa  <  1:733323/62‑1 (MQ=255) gggAAGAATAAGGTTTTTTATATTATAATTTTCTTGTCTGCCACGTAAAATTAGTGACAATa  <  1:729030/62‑1 (MQ=255) gggAAGAATAAGGTTTTTTATATTATAATTTTCTTGTCTGCCACGTAAAATTAGTGACAATa  <  1:700790/62‑1 (MQ=255) gggAAGAATAAGGTTTTTTATATTATAATTTTCTTGTCTGCCACGTAAAATTAGTGACAATa  <  1:667185/62‑1 (MQ=255) gggAAGAATAAGGTTTTTTATATTATAATTTTCTTGTCTGCCACGTAAAATTAGTGACAATa  <  1:541177/62‑1 (MQ=255) gggAAGAATAAGGTTTTTTATATTATAATTTTCTTGTCTGCCACGTAAAATTAGTGACAATa  <  1:457791/62‑1 (MQ=255) gggAAGAATAAGGTTTTTTATATTATAATTTTCTTGTCTGCCACGTAAAATTAGTGACAATa  <  1:425905/62‑1 (MQ=255) gggAAGAATAAGGTTTTTTATATTATAATTTTCTTGTCTGCCACGTAAAATTAGTGACAATa  <  1:398094/62‑1 (MQ=255) gggAAGAATAAGGTTTTTTATATTATAATTTTCTTGTCTGCCACGTAAAATTAGTGACAATa  <  1:393545/62‑1 (MQ=255) gggAAGAATAAGGTTTTTTATATTATAATTTTCTTGTCTGCCACGTAAAATTAGTGACAATa  <  1:194663/62‑1 (MQ=255) gggAAGAATAAGGTTTTTTATATTATAATTTTCTTGTCTGCCACGTAAAATTAGTGACAATa  <  1:160791/62‑1 (MQ=255) gggAAGAATAAGGTTTTTTATATTATAATTTTCTTGTCTGCCACGTAAAATTAGTGACAATa  <  1:1469467/62‑1 (MQ=255) gggAAGAATAAGGTTTTTTATATTATAATTTTCTTGTCTGCCACGTAAAATTAGTGACAATa  <  1:1414072/62‑1 (MQ=255) gggAAGAATAAGGTTTTTTATATTATAATTTTCTTGTCTGCCACGTAAAATTAGTGACAATa  <  1:1398805/62‑1 (MQ=255) gggAAGAATAAGGTTTTTTATATTATAATTTTCTTGTCTGCCACGTAAAATTAGTGACAATa  <  1:1369790/62‑1 (MQ=255) gggAAGAATAAGGTTTTTTATATTATAATTTTCTTGTCTGCCACGTAAAATTAGTGACAATa  <  1:1314916/62‑1 (MQ=255) gggAAGAATAAGGTTTTTTATATTATAATTTTCTTGTCTGCCACGTAAAATTAGTGACAATa  <  1:1219132/62‑1 (MQ=255) gggAAGAATAAGGTTTTTTATATTATAATTTTCTTGTCTGCCACGTAAAATTAGTGACAATa  <  1:1217135/62‑1 (MQ=255) gggAAGAATAAGGTTTTTTATATTATAATTTTCTTGTCTGCCACGTAAAATTAGTGACAATa  <  1:103370/62‑1 (MQ=255)  ggAAGAATAAGGTTTTTTATATTATAATTTTCTTGTCTGCCACGTAAAATTAGTGACAATa  <  1:859242/61‑1 (MQ=255)                ttttATATTATAATTTTCTTGTCTGCCACGTAAAATTAGTGACAATa  <  1:1284232/47‑1 (MQ=255)                                                              | GGGAAGAATAAGGTTTTTTATATTATAATTTTCTTGTCTGCCACGTAAAATTAGTGACAATA  >  W3110S.gb/3843245‑3843306

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑