Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3867458	3867628	171	56 [0]	[0] 25	mtlA	fused mannitol‑specific PTS enzyme IIABC components

TGCCGCACCGCCCGCAGACTGTTTAGCGCTACCACGACCAAAGAACATGTACGCCAGCAGCA  >  W3110S.gb/3867396‑3867457                                                              | tGCCGCACCGCCCGCAGACTGTTTAGCTCTACCACGACCAAAGAACATGTACGCCAgcagca  <  1:720138/62‑1 (MQ=255) tGCCGCACCGCCCGCAGACTGTTTAGCGCTACCACGACCAAAGAACATGTACGCCAgcagca  <  1:608519/62‑1 (MQ=255) tGCCGCACCGCCCGCAGACTGTTTAGCGCTACCACGACCAAAGAACATGTACGCCAgcagca  <  1:38285/62‑1 (MQ=255) tGCCGCACCGCCCGCAGACTGTTTAGCGCTACCACGACCAAAGAACATGTACGCCAgcagca  <  1:1072985/62‑1 (MQ=255) tGCCGCACCGCCCGCAGACTGTTTAGCGCTACCACGACCAAAGAACATGTACGCCAgcagca  <  1:404692/62‑1 (MQ=255) tGCCGCACCGCCCGCAGACTGTTTAGCGCTACCACGACCAAAGAACATGTACGCCAgcagca  <  1:41152/62‑1 (MQ=255) tGCCGCACCGCCCGCAGACTGTTTAGCGCTACCACGACCAAAGAACATGTACGCCAgcagca  <  1:414320/62‑1 (MQ=255) tGCCGCACCGCCCGCAGACTGTTTAGCGCTACCACGACCAAAGAACATGTACGCCAgcagca  <  1:449579/62‑1 (MQ=255) tGCCGCACCGCCCGCAGACTGTTTAGCGCTACCACGACCAAAGAACATGTACGCCAgcagca  <  1:460234/62‑1 (MQ=255) tGCCGCACCGCCCGCAGACTGTTTAGCGCTACCACGACCAAAGAACATGTACGCCAgcagca  <  1:546582/62‑1 (MQ=255) tGCCGCACCGCCCGCAGACTGTTTAGCGCTACCACGACCAAAGAACATGTACGCCAgcagca  <  1:560465/62‑1 (MQ=255) tGCCGCACCGCCCGCAGACTGTTTAGCGCTACCACGACCAAAGAACATGTACGCCAgcagca  <  1:564201/62‑1 (MQ=255) tGCCGCACCGCCCGCAGACTGTTTAGCGCTACCACGACCAAAGAACATGTACGCCAgcagca  <  1:566543/62‑1 (MQ=255) tGCCGCACCGCCCGCAGACTGTTTAGCGCTACCACGACCAAAGAACATGTACGCCAgcagca  <  1:571345/62‑1 (MQ=255) tGCCGCACCGCCCGCAGACTGTTTAGCGCTACCACGACCAAAGAACATGTACGCCAgcagca  <  1:395846/62‑1 (MQ=255) tGCCGCACCGCCCGCAGACTGTTTAGCGCTACCACGACCAAAGAACATGTACGCCAgcagca  <  1:611416/62‑1 (MQ=255) tGCCGCACCGCCCGCAGACTGTTTAGCGCTACCACGACCAAAGAACATGTACGCCAgcagca  <  1:66522/62‑1 (MQ=255) tGCCGCACCGCCCGCAGACTGTTTAGCGCTACCACGACCAAAGAACATGTACGCCAgcagca  <  1:732365/62‑1 (MQ=255) tGCCGCACCGCCCGCAGACTGTTTAGCGCTACCACGACCAAAGAACATGTACGCCAgcagca  <  1:751490/62‑1 (MQ=255) tGCCGCACCGCCCGCAGACTGTTTAGCGCTACCACGACCAAAGAACATGTACGCCAgcagca  <  1:763026/62‑1 (MQ=255) tGCCGCACCGCCCGCAGACTGTTTAGCGCTACCACGACCAAAGAACATGTACGCCAgcagca  <  1:799856/62‑1 (MQ=255) tGCCGCACCGCCCGCAGACTGTTTAGCGCTACCACGACCAAAGAACATGTACGCCAgcagca  <  1:851876/62‑1 (MQ=255) tGCCGCACCGCCCGCAGACTGTTTAGCGCTACCACGACCAAAGAACATGTACGCCAgcagca  <  1:854407/62‑1 (MQ=255) tGCCGCACCGCCCGCAGACTGTTTAGCGCTACCACGACCAAAGAACATGTACGCCAgcagca  <  1:953599/62‑1 (MQ=255) tGCCGCACCGCCCGCAGACTGTTTAGCGCTACCACGACCAAAGAACATGTACGCCAgcagca  <  1:96838/62‑1 (MQ=255) tGCCGCACCGCCCGCAGACTGTTTAGCGCTACCACGACCAAAGAACATGTACGCCAgcagca  <  1:996121/62‑1 (MQ=255) tGCCGCACCGCCCGCAGACTGTTTAGCGCTACCACGACCAAAGAACATGTACGCCAgcagca  <  1:309522/62‑1 (MQ=255) tGCCGCACCGCCCGCAGACTGTTTAGCGCTACCACGACCAAAGAACATGTACGCCAgcagca  <  1:1094287/62‑1 (MQ=255) tGCCGCACCGCCCGCAGACTGTTTAGCGCTACCACGACCAAAGAACATGTACGCCAgcagca  <  1:1096334/62‑1 (MQ=255) tGCCGCACCGCCCGCAGACTGTTTAGCGCTACCACGACCAAAGAACATGTACGCCAgcagca  <  1:1097736/62‑1 (MQ=255) tGCCGCACCGCCCGCAGACTGTTTAGCGCTACCACGACCAAAGAACATGTACGCCAgcagca  <  1:1125388/62‑1 (MQ=255) tGCCGCACCGCCCGCAGACTGTTTAGCGCTACCACGACCAAAGAACATGTACGCCAgcagca  <  1:1138074/62‑1 (MQ=255) tGCCGCACCGCCCGCAGACTGTTTAGCGCTACCACGACCAAAGAACATGTACGCCAgcagca  <  1:1154054/62‑1 (MQ=255) tGCCGCACCGCCCGCAGACTGTTTAGCGCTACCACGACCAAAGAACATGTACGCCAgcagca  <  1:116799/62‑1 (MQ=255) tGCCGCACCGCCCGCAGACTGTTTAGCGCTACCACGACCAAAGAACATGTACGCCAgcagca  <  1:1172793/62‑1 (MQ=255) tGCCGCACCGCCCGCAGACTGTTTAGCGCTACCACGACCAAAGAACATGTACGCCAgcagca  <  1:1188089/62‑1 (MQ=255) tGCCGCACCGCCCGCAGACTGTTTAGCGCTACCACGACCAAAGAACATGTACGCCAgcagca  <  1:1222317/62‑1 (MQ=255) tGCCGCACCGCCCGCAGACTGTTTAGCGCTACCACGACCAAAGAACATGTACGCCAgcagca  <  1:1259233/62‑1 (MQ=255) tGCCGCACCGCCCGCAGACTGTTTAGCGCTACCACGACCAAAGAACATGTACGCCAgcagca  <  1:1292096/62‑1 (MQ=255) tGCCGCACCGCCCGCAGACTGTTTAGCGCTACCACGACCAAAGAACATGTACGCCAgcagca  <  1:1340153/62‑1 (MQ=255) tGCCGCACCGCCCGCAGACTGTTTAGCGCTACCACGACCAAAGAACATGTACGCCAgcagca  <  1:315671/62‑1 (MQ=255) tGCCGCACCGCCCGCAGACTGTTTAGCGCTACCACGACCAAAGAACATGTACGCCAgcagca  <  1:265427/62‑1 (MQ=255) tGCCGCACCGCCCGCAGACTGTTTAGCGCTACCACGACCAAAGAACATGTACGCCAgcagca  <  1:256923/62‑1 (MQ=255) tGCCGCACCGCCCGCAGACTGTTTAGCGCTACCACGACCAAAGAACATGTACGCCAgcagca  <  1:215805/62‑1 (MQ=255) tGCCGCACCGCCCGCAGACTGTTTAGCGCTACCACGACCAAAGAACATGTACGCCAgcagca  <  1:145426/62‑1 (MQ=255) tGCCGCACCGCCCGCAGACTGTTTAGCGCTACCACGACCAAAGAACATGTACGCCAgcagca  <  1:1376276/62‑1 (MQ=255) tGCCGCACCGCCCGCAGACTGTTTAGCGCTACCACGACCAAAGAACATGTACGCCAgcagca  <  1:1362161/62‑1 (MQ=255) tGCCGCACCGCCCGCAGACTGTTTAGCGCTACCACGAACAAAGAACATGTACGCCAgcagca  <  1:500625/62‑1 (MQ=255) tGCCGCACCGCCCGCAGACTATTTAGCGCTACCACGACCAAAGAACATGTACGCCAgcagca  <  1:835000/62‑1 (MQ=255)  gCCGCACCGCCCGCAGACTGTTTAGCGCTACCACGACCAAAGAACATGTACGCCAgcagca  <  1:1343706/61‑1 (MQ=255)  gCCGCACCGCCCGCAGACTGTTTAGCGCTACCACGACCAAAGAACATGTACGCCAgcagca  <  1:1308385/61‑1 (MQ=255)               cAGACTGTTTAGCGCTACCACGACCAAAGAACATGTACGCCAgcagca  <  1:662789/48‑1 (MQ=255)                aGACTGTTTAGCGCTACCACGACCAAAGAACATGTACGCCAgcagca  <  1:1102314/47‑1 (MQ=255)                 gACTGTTTAGCGCTACCACGACCAAAGAACATGTACGCCAgcagca  <  1:640242/46‑1 (MQ=255)                          gcgcTACCACGACCAAAGAACATGTACGCCAgcagca  <  1:194136/37‑1 (MQ=255)                          gcgcTACCACGACCAAAGAACATGTACGCCAgcagca  <  1:1077080/37‑1 (MQ=255)                                                              | TGCCGCACCGCCCGCAGACTGTTTAGCGCTACCACGACCAAAGAACATGTACGCCAGCAGCA  >  W3110S.gb/3867396‑3867457

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑