Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3971118	3971164	47	25 [0]	[0] 19	treF/yhjA	cytoplasmic trehalase/predicted cytochrome C peroxidase

TGGGTAATAGGCACAGGCTATCTTATTGATAGTTTATATTCATGTAATTGATTGATTCCTA  >  W3110S.gb/3971057‑3971117                                                             | tGGGTAATAGGCACAGGCTATCTTATTGATAGTTTATATTCATGTAATTGATTGATTCCTa  >  1:172615/1‑61 (MQ=255) tGGGTAATAGGCACAGGCTATCTTATTGATAGTTTATATTCATGTAATTGATTGATTCCTa  >  1:931196/1‑61 (MQ=255) tGGGTAATAGGCACAGGCTATCTTATTGATAGTTTATATTCATGTAATTGATTGATTCCTa  >  1:903542/1‑61 (MQ=255) tGGGTAATAGGCACAGGCTATCTTATTGATAGTTTATATTCATGTAATTGATTGATTCCTa  >  1:842070/1‑61 (MQ=255) tGGGTAATAGGCACAGGCTATCTTATTGATAGTTTATATTCATGTAATTGATTGATTCCTa  >  1:747905/1‑61 (MQ=255) tGGGTAATAGGCACAGGCTATCTTATTGATAGTTTATATTCATGTAATTGATTGATTCCTa  >  1:71209/1‑61 (MQ=255) tGGGTAATAGGCACAGGCTATCTTATTGATAGTTTATATTCATGTAATTGATTGATTCCTa  >  1:615763/1‑61 (MQ=255) tGGGTAATAGGCACAGGCTATCTTATTGATAGTTTATATTCATGTAATTGATTGATTCCTa  >  1:471408/1‑61 (MQ=255) tGGGTAATAGGCACAGGCTATCTTATTGATAGTTTATATTCATGTAATTGATTGATTCCTa  >  1:443380/1‑61 (MQ=255) tGGGTAATAGGCACAGGCTATCTTATTGATAGTTTATATTCATGTAATTGATTGATTCCTa  >  1:42274/1‑61 (MQ=255) tGGGTAATAGGCACAGGCTATCTTATTGATAGTTTATATTCATGTAATTGATTGATTCCTa  >  1:290262/1‑61 (MQ=255) tGGGTAATAGGCACAGGCTATCTTATTGATAGTTTATATTCATGTAATTGATTGATTCCTa  >  1:255281/1‑61 (MQ=255) tGGGTAATAGGCACAGGCTATCTTATTGATAGTTTATATTCATGTAATTGATTGATTCCTa  >  1:219566/1‑61 (MQ=255) tGGGTAATAGGCACAGGCTATCTTATTGATAGTTTATATTCATGTAATTGATTGATTCCTa  >  1:1004128/1‑61 (MQ=255) tGGGTAATAGGCACAGGCTATCTTATTGATAGTTTATATTCATGTAATTGATTGATTCCTa  >  1:171695/1‑61 (MQ=255) tGGGTAATAGGCACAGGCTATCTTATTGATAGTTTATATTCATGTAATTGATTGATTCCTa  >  1:1419207/1‑61 (MQ=255) tGGGTAATAGGCACAGGCTATCTTATTGATAGTTTATATTCATGTAATTGATTGATTCCTa  >  1:1404075/1‑61 (MQ=255) tGGGTAATAGGCACAGGCTATCTTATTGATAGTTTATATTCATGTAATTGATTGATTCCTa  >  1:1370271/1‑61 (MQ=255) tGGGTAATAGGCACAGGCTATCTTATTGATAGTTTATATTCATGTAATTGATTGATTCCTa  >  1:1317463/1‑61 (MQ=255) tGGGTAATAGGCACAGGCTATCTTATTGATAGTTTATATTCATGTAATTGATTGATTCCTa  >  1:1293195/1‑61 (MQ=255) tGGGTAATAGGCACAGGCTATCTTATTGATAGTTTATATTCATGTAATTGATTGATTCCTa  >  1:1283986/1‑61 (MQ=255) tGGGTAATAGGCACAGGCTATCTTATTGATAGTTTATATTCATGTAATTGATTGATTCCTa  >  1:1281090/1‑61 (MQ=255) tGGGTAATAGGCACAGGCTATCTTATTGATAGTTTATATTCATGTAATTGATTGATTCCTa  >  1:1092940/1‑61 (MQ=255) tGGGTAATAGGCACAGGCTATCTTATTGATAGTTTATATTCATGTAATTGATTGATTCCTa  >  1:1010764/1‑61 (MQ=255) tGGGTAATAGGCAAAGGCTATCTTATTGATAGTTTATATTCATGTAATTGATTGATTCCTa  >  1:1461890/1‑61 (MQ=255)                                                             | TGGGTAATAGGCACAGGCTATCTTATTGATAGTTTATATTCATGTAATTGATTGATTCCTA  >  W3110S.gb/3971057‑3971117

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑