Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3977233	3977241	9	18 [0]	[0] 9	mdtF	multidrug transporter, RpoS‑dependent

CAGGATGGCGTTTTTGGCGGAAAGCCCGATGGTGGTCAGCAAACCAACCTGGAAG  >  W3110S.gb/3977178‑3977232                                                       | cAGGATGGCGTTTTTGGCGGAAAGCCCGATGGTGGTCAGCAAACCAACCTGGAAg  <  1:173289/55‑1 (MQ=255) cAGGATGGCGTTTTTGGCGGAAAGCCCGATGGTGGTCAGCAAACCAACCTGGAAg  <  1:973940/55‑1 (MQ=255) cAGGATGGCGTTTTTGGCGGAAAGCCCGATGGTGGTCAGCAAACCAACCTGGAAg  <  1:973193/55‑1 (MQ=255) cAGGATGGCGTTTTTGGCGGAAAGCCCGATGGTGGTCAGCAAACCAACCTGGAAg  <  1:833618/55‑1 (MQ=255) cAGGATGGCGTTTTTGGCGGAAAGCCCGATGGTGGTCAGCAAACCAACCTGGAAg  <  1:816580/55‑1 (MQ=255) cAGGATGGCGTTTTTGGCGGAAAGCCCGATGGTGGTCAGCAAACCAACCTGGAAg  <  1:73398/55‑1 (MQ=255) cAGGATGGCGTTTTTGGCGGAAAGCCCGATGGTGGTCAGCAAACCAACCTGGAAg  <  1:351330/55‑1 (MQ=255) cAGGATGGCGTTTTTGGCGGAAAGCCCGATGGTGGTCAGCAAACCAACCTGGAAg  <  1:296657/55‑1 (MQ=255) cAGGATGGCGTTTTTGGCGGAAAGCCCGATGGTGGTCAGCAAACCAACCTGGAAg  <  1:270547/55‑1 (MQ=255) cAGGATGGCGTTTTTGGCGGAAAGCCCGATGGTGGTCAGCAAACCAACCTGGAAg  <  1:1084770/55‑1 (MQ=255) cAGGATGGCGTTTTTGGCGGAAAGCCCGATGGTGGTCAGCAAACCAACCTGGAAg  <  1:152626/55‑1 (MQ=255) cAGGATGGCGTTTTTGGCGGAAAGCCCGATGGTGGTCAGCAAACCAACCTGGAAg  <  1:1426362/55‑1 (MQ=255) cAGGATGGCGTTTTTGGCGGAAAGCCCGATGGTGGTCAGCAAACCAACCTGGAAg  <  1:1343379/55‑1 (MQ=255) cAGGATGGCGTTTTTGGCGGAAAGCCCGATGGTGGTCAGCAAACCAACCTGGAAg  <  1:1305819/55‑1 (MQ=255) cAGGATGGCGTTTTTGGCGGAAAGCCCGATGGTGGTCAGCAAACCAACCTGGAAg  <  1:1305251/55‑1 (MQ=255) cAGGATGGCGTTTTTGGCGGAAAGCCCGATGGTGGTCAGCAAACCAACCTGGAAg  <  1:12409/55‑1 (MQ=255) cAGGATGGCGTTTTTGGCGGAAAGCCCGATGGTGGTCAGCAAACCAACCTGGAAg  <  1:1205875/55‑1 (MQ=255) cAGGATGGCGTTTTTGGCGGAAAGCCCGATGGTGGTCAGCAAACCAACCTGGAAg  <  1:1096179/55‑1 (MQ=255)                                                       | CAGGATGGCGTTTTTGGCGGAAAGCCCGATGGTGGTCAGCAAACCAACCTGGAAG  >  W3110S.gb/3977178‑3977232

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑